Protein–RNA interactions for Protein: J3KMP5

Gm21897, Predicted gene, 21897, mousemouse

Predictions only

Length 500 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21897J3KMP5 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm21897J3KMP5 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm21897J3KMP5 2010300F17Rik-202ENSMUST00000181758 2493 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm21897J3KMP5 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm21897J3KMP5 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm21897J3KMP5 Mtif3-202ENSMUST00000066675 4927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm21897J3KMP5 Sv2b-202ENSMUST00000165175 5524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm21897J3KMP5 Ggt7-201ENSMUST00000029131 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm21897J3KMP5 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm21897J3KMP5 Cyth4-201ENSMUST00000043069 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm21897J3KMP5 Lmod3-201ENSMUST00000095655 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm21897J3KMP5 Olfr533-204ENSMUST00000216258 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm21897J3KMP5 Ackr2-201ENSMUST00000050327 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm21897J3KMP5 Bdp1-201ENSMUST00000038104 9921 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Gm21897J3KMP5 Anapc7-202ENSMUST00000119792 3599 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Gm21897J3KMP5 Noto-201ENSMUST00000089578 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Gm21897J3KMP5 Slco4a1-202ENSMUST00000038259 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Gm21897J3KMP5 Olfr607-202ENSMUST00000214347 5706 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Gm21897J3KMP5 Mdm2-202ENSMUST00000105263 3145 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Gm21897J3KMP5 Ptgr2-208ENSMUST00000147363 1869 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Gm21897J3KMP5 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Gm21897J3KMP5 Fis1-203ENSMUST00000111097 601 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm21897J3KMP5 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm21897J3KMP5 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm21897J3KMP5 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm21897J3KMP5 Gm18041-201ENSMUST00000218210 618 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm21897J3KMP5 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm21897J3KMP5 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm21897J3KMP5 4921504A21Rik-201ENSMUST00000180594 2156 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm21897J3KMP5 Rec8-201ENSMUST00000002395 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm21897J3KMP5 Zfp341-202ENSMUST00000109702 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm21897J3KMP5 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm21897J3KMP5 Dmac2-202ENSMUST00000085953 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm21897J3KMP5 Cox19-201ENSMUST00000049630 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm21897J3KMP5 Gm38355-201ENSMUST00000192514 1570 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm21897J3KMP5 Dmtn-208ENSMUST00000228009 2643 ntAPPRIS P2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm21897J3KMP5 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm21897J3KMP5 Api5-201ENSMUST00000028617 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm21897J3KMP5 Cebpd-201ENSMUST00000096232 3746 ntAPPRIS P1 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm21897J3KMP5 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm21897J3KMP5 Sgce-205ENSMUST00000115579 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm21897J3KMP5 Cyth1-203ENSMUST00000106302 3119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm21897J3KMP5 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm21897J3KMP5 Gm15082-201ENSMUST00000147045 1960 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm21897J3KMP5 Ehd1-201ENSMUST00000025684 3353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm21897J3KMP5 Cyp11a1-201ENSMUST00000034874 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm21897J3KMP5 Psg23-201ENSMUST00000057810 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm21897J3KMP5 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm21897J3KMP5 Grin2c-201ENSMUST00000003351 4279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm21897J3KMP5 Nxph1-201ENSMUST00000060369 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm21897J3KMP5 Irak3-201ENSMUST00000020448 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm21897J3KMP5 Edrf1-201ENSMUST00000051169 5424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm21897J3KMP5 Slc39a8-206ENSMUST00000180196 3383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm21897J3KMP5 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm21897J3KMP5 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm21897J3KMP5 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm21897J3KMP5 Mettl26-204ENSMUST00000169085 324 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm21897J3KMP5 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm21897J3KMP5 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm21897J3KMP5 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm21897J3KMP5 Gm31105-201ENSMUST00000211421 687 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm21897J3KMP5 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm21897J3KMP5 Gm5626-201ENSMUST00000222151 1058 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm21897J3KMP5 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm21897J3KMP5 Rnf44-218ENSMUST00000177950 3941 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm21897J3KMP5 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm21897J3KMP5 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm21897J3KMP5 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm21897J3KMP5 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm21897J3KMP5 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm21897J3KMP5 Ces2e-202ENSMUST00000109410 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm21897J3KMP5 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm21897J3KMP5 Capn5-202ENSMUST00000107112 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm21897J3KMP5 Gm42480-201ENSMUST00000198434 2595 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm21897J3KMP5 Gm19434-201ENSMUST00000204330 2573 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm21897J3KMP5 Arhgap10-201ENSMUST00000076316 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm21897J3KMP5 Hnrnpul1-201ENSMUST00000043765 3354 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm21897J3KMP5 Klhl32-204ENSMUST00000108218 7143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm21897J3KMP5 Bcl2-201ENSMUST00000112751 7191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm21897J3KMP5 Gm36995-201ENSMUST00000126170 5727 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Gm21897J3KMP5 Sipa1-204ENSMUST00000169854 3583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Gm21897J3KMP5 Tmem163-205ENSMUST00000185560 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm21897J3KMP5 Ap2a1-204ENSMUST00000167930 3376 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Gm21897J3KMP5 Mmp2-201ENSMUST00000034187 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm21897J3KMP5 Kansl3-205ENSMUST00000186470 2801 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm21897J3KMP5 Gabpb1-204ENSMUST00000103227 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm21897J3KMP5 A530016L24Rik-201ENSMUST00000057465 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm21897J3KMP5 Tsku-204ENSMUST00000165901 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm21897J3KMP5 Osbpl10-204ENSMUST00000182384 2158 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Gm21897J3KMP5 Ahcyl2-205ENSMUST00000125911 2039 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Gm21897J3KMP5 Prrt3-205ENSMUST00000205170 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Gm21897J3KMP5 Col22a1-202ENSMUST00000159993 8809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Gm21897J3KMP5 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm21897J3KMP5 Rprd1b-202ENSMUST00000103123 4504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm21897J3KMP5 Skida1-202ENSMUST00000091420 4376 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Gm21897J3KMP5 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm21897J3KMP5 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm21897J3KMP5 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm21897J3KMP5 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm21897J3KMP5 1010001B22Rik-201ENSMUST00000181488 589 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.1 ms