Protein–RNA interactions for Protein: F8VPQ2

Arid4a, AT-rich interactive domain 4A (RBP1-like), mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arid4aF8VPQ2 Bbs5-201ENSMUST00000074963 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Arid4aF8VPQ2 Creld2-201ENSMUST00000024042 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Arid4aF8VPQ2 Hus1b-201ENSMUST00000102943 1187 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Arid4aF8VPQ2 Gm13612-201ENSMUST00000119276 390 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Arid4aF8VPQ2 Gm14730-201ENSMUST00000122378 1045 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Arid4aF8VPQ2 C430014B12Rik-201ENSMUST00000181720 1001 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Arid4aF8VPQ2 4930432H08Rik-201ENSMUST00000198220 1284 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Arid4aF8VPQ2 Gm7498-201ENSMUST00000203282 1084 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Arid4aF8VPQ2 Mettl3-201ENSMUST00000022767 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Arid4aF8VPQ2 Fn3k-202ENSMUST00000092302 1803 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Arid4aF8VPQ2 F830212C03Rik-201ENSMUST00000191701 2285 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Arid4aF8VPQ2 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Arid4aF8VPQ2 Bckdha-201ENSMUST00000071329 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Arid4aF8VPQ2 Pitpnm2-205ENSMUST00000161273 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Arid4aF8VPQ2 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Arid4aF8VPQ2 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Arid4aF8VPQ2 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Arid4aF8VPQ2 Il11-201ENSMUST00000094892 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Arid4aF8VPQ2 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Arid4aF8VPQ2 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Arid4aF8VPQ2 Kcnj8-202ENSMUST00000203945 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Arid4aF8VPQ2 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Arid4aF8VPQ2 Gm15440-201ENSMUST00000110042 1231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Arid4aF8VPQ2 Wisp1-202ENSMUST00000118823 708 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Arid4aF8VPQ2 Gm13185-201ENSMUST00000131044 944 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Arid4aF8VPQ2 Gm13112-201ENSMUST00000138795 1258 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Arid4aF8VPQ2 Gm16136-203ENSMUST00000162520 1121 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Arid4aF8VPQ2 Tmem52-204ENSMUST00000178188 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Arid4aF8VPQ2 Tmem52-205ENSMUST00000178238 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Arid4aF8VPQ2 Gm24196-201ENSMUST00000179161 110 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Arid4aF8VPQ2 Gm3809-201ENSMUST00000180973 1006 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Arid4aF8VPQ2 Gm29127-201ENSMUST00000188304 517 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Arid4aF8VPQ2 Gm9803-202ENSMUST00000216543 456 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Arid4aF8VPQ2 Dmac1-201ENSMUST00000030103 741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Arid4aF8VPQ2 Gps2-201ENSMUST00000057884 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Arid4aF8VPQ2 Nanos3-201ENSMUST00000070102 730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Arid4aF8VPQ2 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Arid4aF8VPQ2 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Arid4aF8VPQ2 Rnaseh2a-210ENSMUST00000147812 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Arid4aF8VPQ2 AC161252.3-201ENSMUST00000225465 1549 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Arid4aF8VPQ2 Lancl1-202ENSMUST00000113979 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Arid4aF8VPQ2 Cacna1g-207ENSMUST00000107789 8383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Arid4aF8VPQ2 Kcnk16-202ENSMUST00000225596 2127 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Arid4aF8VPQ2 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Arid4aF8VPQ2 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Arid4aF8VPQ2 Tbx3-201ENSMUST00000018748 4856 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Arid4aF8VPQ2 Rnf144a-201ENSMUST00000020971 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Arid4aF8VPQ2 Ikzf1-204ENSMUST00000076700 5163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Arid4aF8VPQ2 Polg-201ENSMUST00000073889 7837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Arid4aF8VPQ2 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Arid4aF8VPQ2 Ptx4-201ENSMUST00000054930 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Arid4aF8VPQ2 Notch1-201ENSMUST00000028288 9488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Arid4aF8VPQ2 Gypa-201ENSMUST00000063359 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Arid4aF8VPQ2 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Arid4aF8VPQ2 Fhad1-202ENSMUST00000105779 4263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Arid4aF8VPQ2 Plch2-207ENSMUST00000139976 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Arid4aF8VPQ2 Cfp-201ENSMUST00000001156 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Arid4aF8VPQ2 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Arid4aF8VPQ2 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Arid4aF8VPQ2 Arhgap28-201ENSMUST00000024840 5322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Arid4aF8VPQ2 Zfp664-201ENSMUST00000111417 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Arid4aF8VPQ2 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Arid4aF8VPQ2 Lims1-203ENSMUST00000105468 1205 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Arid4aF8VPQ2 Timm10b-202ENSMUST00000106780 671 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Arid4aF8VPQ2 Pnpo-202ENSMUST00000107629 681 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Arid4aF8VPQ2 Zbtb32-201ENSMUST00000108150 854 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Arid4aF8VPQ2 Shisa5-203ENSMUST00000154184 1038 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Arid4aF8VPQ2 Snhg9-201ENSMUST00000161706 183 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Arid4aF8VPQ2 Gm38671-201ENSMUST00000200573 130 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Arid4aF8VPQ2 Tgif2-ps1-201ENSMUST00000203590 713 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Arid4aF8VPQ2 Degs2-201ENSMUST00000021691 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Arid4aF8VPQ2 Atp6v0c-201ENSMUST00000024932 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Arid4aF8VPQ2 Fam241b-202ENSMUST00000064050 1096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Arid4aF8VPQ2 Tmem256-201ENSMUST00000094065 492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Arid4aF8VPQ2 Specc1-202ENSMUST00000092415 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Arid4aF8VPQ2 Lrrc10-201ENSMUST00000073834 1428 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Arid4aF8VPQ2 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Arid4aF8VPQ2 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Arid4aF8VPQ2 Gnb5-202ENSMUST00000213990 1803 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Arid4aF8VPQ2 Pde4d-203ENSMUST00000117420 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Arid4aF8VPQ2 Alkbh4-202ENSMUST00000100568 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Arid4aF8VPQ2 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Arid4aF8VPQ2 Phactr3-203ENSMUST00000108915 2694 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Arid4aF8VPQ2 Phactr3-204ENSMUST00000108916 2656 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Arid4aF8VPQ2 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Arid4aF8VPQ2 Dhx9-202ENSMUST00000186380 4561 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Arid4aF8VPQ2 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Arid4aF8VPQ2 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Arid4aF8VPQ2 Npc2-201ENSMUST00000021668 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Arid4aF8VPQ2 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Arid4aF8VPQ2 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Arid4aF8VPQ2 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Arid4aF8VPQ2 Ifi47-204ENSMUST00000213728 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Arid4aF8VPQ2 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Arid4aF8VPQ2 AC126549.2-201ENSMUST00000223997 1976 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Arid4aF8VPQ2 Myo1d-201ENSMUST00000041065 5354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Arid4aF8VPQ2 Map2k3os-201ENSMUST00000123544 1291 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Arid4aF8VPQ2 Pigyl-202ENSMUST00000148088 676 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Arid4aF8VPQ2 Grp-202ENSMUST00000173530 617 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Arid4aF8VPQ2 1700122O11Rik-201ENSMUST00000178823 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.6 ms