Protein–RNA interactions for Protein: E9Q043

Fndc1, Fibronectin type III domain-containing 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,732 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fndc1E9Q043 Gm8492-201ENSMUST00000182375 987 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Fndc1E9Q043 Gm13522-202ENSMUST00000209682 997 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Fndc1E9Q043 AC107638.1-201ENSMUST00000213690 1061 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Fndc1E9Q043 E230034D01Rik-201ENSMUST00000214440 1212 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Fndc1E9Q043 AC159462.1-201ENSMUST00000214822 687 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Fndc1E9Q043 Rab17-201ENSMUST00000027529 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Fndc1E9Q043 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Fndc1E9Q043 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Fndc1E9Q043 Rab30-202ENSMUST00000107179 1304 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Fndc1E9Q043 Jmjd8-201ENSMUST00000026832 2091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Fndc1E9Q043 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Fndc1E9Q043 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Fndc1E9Q043 Kcnj3-203ENSMUST00000112633 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Fndc1E9Q043 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Fndc1E9Q043 Commd1-201ENSMUST00000057843 1459 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Fndc1E9Q043 Gm17089-201ENSMUST00000171098 1394 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Fndc1E9Q043 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Fndc1E9Q043 Gng12-205ENSMUST00000114226 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Fndc1E9Q043 Gm15515-201ENSMUST00000117827 822 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Fndc1E9Q043 Gm6506-201ENSMUST00000119775 1136 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Fndc1E9Q043 F12-202ENSMUST00000170921 478 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Fndc1E9Q043 Isl1-202ENSMUST00000176044 1198 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Fndc1E9Q043 Rpl36-ps4-201ENSMUST00000179601 354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Fndc1E9Q043 Qdpr-209ENSMUST00000198258 1172 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Fndc1E9Q043 Gm45460-201ENSMUST00000211385 1038 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Fndc1E9Q043 Cct2-206ENSMUST00000219573 637 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Fndc1E9Q043 Snu13-202ENSMUST00000080622 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Fndc1E9Q043 Rsg1-201ENSMUST00000097813 985 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Fndc1E9Q043 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Fndc1E9Q043 Iah1-204ENSMUST00000223345 1890 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Fndc1E9Q043 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Fndc1E9Q043 Dnmt3l-208ENSMUST00000151242 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Fndc1E9Q043 Hrg-201ENSMUST00000023590 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Fndc1E9Q043 Pfkfb3-205ENSMUST00000114845 1971 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Fndc1E9Q043 Gm26565-201ENSMUST00000181642 1968 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Fndc1E9Q043 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Fndc1E9Q043 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Fndc1E9Q043 Adamtsl1-204ENSMUST00000120678 977 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Fndc1E9Q043 Gm6254-201ENSMUST00000168178 1072 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
Fndc1E9Q043 Cox16-206ENSMUST00000168463 431 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Fndc1E9Q043 Gm3671-201ENSMUST00000182463 1007 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
Fndc1E9Q043 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Fndc1E9Q043 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Fndc1E9Q043 Dclk1-215ENSMUST00000200352 1662 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Fndc1E9Q043 Bend7-201ENSMUST00000056914 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Fndc1E9Q043 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Fndc1E9Q043 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Fndc1E9Q043 Fut8-201ENSMUST00000062804 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Fndc1E9Q043 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Fndc1E9Q043 Pgbd5-203ENSMUST00000136892 1739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Fndc1E9Q043 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Fndc1E9Q043 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Fndc1E9Q043 Cops4-201ENSMUST00000045993 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Fndc1E9Q043 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Fndc1E9Q043 Tm2d3-203ENSMUST00000107495 1003 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Fndc1E9Q043 Gm12165-201ENSMUST00000117047 342 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
Fndc1E9Q043 Gm14704-201ENSMUST00000120300 874 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
Fndc1E9Q043 Gm26953-204ENSMUST00000212526 553 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Fndc1E9Q043 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Fndc1E9Q043 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Fndc1E9Q043 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Fndc1E9Q043 Crhr2-201ENSMUST00000003568 2695 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Fndc1E9Q043 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Fndc1E9Q043 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Fndc1E9Q043 Shroom1-201ENSMUST00000018531 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Fndc1E9Q043 Naga-201ENSMUST00000023088 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Fndc1E9Q043 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Fndc1E9Q043 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Fndc1E9Q043 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Fndc1E9Q043 Igf1-203ENSMUST00000105300 1673 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Fndc1E9Q043 Gm12404-201ENSMUST00000122839 1661 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Fndc1E9Q043 Brsk1-202ENSMUST00000120836 2867 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Fndc1E9Q043 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Fndc1E9Q043 Ldha-ps2-201ENSMUST00000118722 1057 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
Fndc1E9Q043 Igfbp2-202ENSMUST00000120564 991 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Fndc1E9Q043 Iffo2-202ENSMUST00000123827 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Fndc1E9Q043 Gm6963-201ENSMUST00000147879 379 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
Fndc1E9Q043 Cabp2-202ENSMUST00000159556 781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Fndc1E9Q043 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Fndc1E9Q043 Gm29187-201ENSMUST00000186681 689 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Fndc1E9Q043 Gm37201-201ENSMUST00000191845 523 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
Fndc1E9Q043 Gm35822-201ENSMUST00000204954 562 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Fndc1E9Q043 Abhd6-201ENSMUST00000026313 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Fndc1E9Q043 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Fndc1E9Q043 Hspb2-201ENSMUST00000042790 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Fndc1E9Q043 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Fndc1E9Q043 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Fndc1E9Q043 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Fndc1E9Q043 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Fndc1E9Q043 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Fndc1E9Q043 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Fndc1E9Q043 Cd79b-201ENSMUST00000044228 1431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Fndc1E9Q043 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Fndc1E9Q043 Apoo-202ENSMUST00000113896 1032 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Fndc1E9Q043 Sec11a-204ENSMUST00000120285 875 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Fndc1E9Q043 Stard10-207ENSMUST00000173270 670 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Fndc1E9Q043 Ank3-234ENSMUST00000182993 1233 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Fndc1E9Q043 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Fndc1E9Q043 Slc39a2-201ENSMUST00000047726 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Fndc1E9Q043 Ramp1-201ENSMUST00000097648 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47 ms