Protein–RNA interactions for Protein: D3YZP9

Ccdc6, Coiled-coil domain-containing protein 6, mousemouse

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Length 469 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc6D3YZP9 Gm38304-201ENSMUST00000161826 600 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc6D3YZP9 1700031P21Rik-203ENSMUST00000191400 466 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc6D3YZP9 Gm29707-202ENSMUST00000198744 659 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc6D3YZP9 Abracl-204ENSMUST00000220110 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc6D3YZP9 1700001J03Rik-201ENSMUST00000073721 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc6D3YZP9 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc6D3YZP9 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc6D3YZP9 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc6D3YZP9 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc6D3YZP9 Mettl11b-201ENSMUST00000159679 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc6D3YZP9 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc6D3YZP9 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc6D3YZP9 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc6D3YZP9 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc6D3YZP9 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc6D3YZP9 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc6D3YZP9 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc6D3YZP9 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc6D3YZP9 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc6D3YZP9 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc6D3YZP9 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc6D3YZP9 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc6D3YZP9 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc6D3YZP9 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc6D3YZP9 Zmynd15-202ENSMUST00000092958 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc6D3YZP9 Gm43423-201ENSMUST00000198390 2094 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc6D3YZP9 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc6D3YZP9 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc6D3YZP9 Tubb4b-ps2-201ENSMUST00000187481 1337 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc6D3YZP9 Tead3-207ENSMUST00000219703 1320 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc6D3YZP9 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc6D3YZP9 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc6D3YZP9 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc6D3YZP9 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc6D3YZP9 Mapk8-204ENSMUST00000111944 1528 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc6D3YZP9 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc6D3YZP9 Rhbdl2-202ENSMUST00000106204 1120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc6D3YZP9 Gngt2-205ENSMUST00000107711 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc6D3YZP9 Rfc4-202ENSMUST00000115337 416 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc6D3YZP9 Zar1l-201ENSMUST00000118769 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc6D3YZP9 Tex22-201ENSMUST00000012355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc6D3YZP9 Pcbd2-202ENSMUST00000124968 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc6D3YZP9 Gm15891-201ENSMUST00000127307 611 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc6D3YZP9 3110080O07Rik-201ENSMUST00000193469 1021 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc6D3YZP9 Fam168a-204ENSMUST00000207564 1083 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
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Ccdc6D3YZP9 Mrpl23-206ENSMUST00000210662 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc6D3YZP9 Gm7207-201ENSMUST00000211575 1067 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc6D3YZP9 Rln1-201ENSMUST00000044143 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc6D3YZP9 n-R5s77-201ENSMUST00000083757 119 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc6D3YZP9 Olfr1230-201ENSMUST00000099787 918 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc6D3YZP9 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc6D3YZP9 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc6D3YZP9 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc6D3YZP9 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc6D3YZP9 Sgce-203ENSMUST00000101677 1656 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc6D3YZP9 Exosc2-201ENSMUST00000038474 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc6D3YZP9 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc6D3YZP9 Abhd14b-209ENSMUST00000216130 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc6D3YZP9 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc6D3YZP9 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc6D3YZP9 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ccdc6D3YZP9 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ccdc6D3YZP9 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ccdc6D3YZP9 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ccdc6D3YZP9 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ccdc6D3YZP9 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ccdc6D3YZP9 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ccdc6D3YZP9 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ccdc6D3YZP9 Xrra1-202ENSMUST00000207855 1334 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ccdc6D3YZP9 Spatc1l-201ENSMUST00000009259 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ccdc6D3YZP9 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ccdc6D3YZP9 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ccdc6D3YZP9 Dnajc30-201ENSMUST00000071263 1661 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ccdc6D3YZP9 Gm6370-201ENSMUST00000110611 1142 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ccdc6D3YZP9 Gm12502-201ENSMUST00000120197 444 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Ccdc6D3YZP9 Gm6309-201ENSMUST00000174320 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ccdc6D3YZP9 Tmem176b-206ENSMUST00000203355 1202 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ccdc6D3YZP9 Gm40652-201ENSMUST00000218944 895 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ccdc6D3YZP9 Arhgef33-207ENSMUST00000224966 490 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Ccdc6D3YZP9 Nmur1-201ENSMUST00000027440 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ccdc6D3YZP9 Olfr76-201ENSMUST00000087822 1048 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ccdc6D3YZP9 Tepp-201ENSMUST00000098480 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ccdc6D3YZP9 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Ccdc6D3YZP9 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Ccdc6D3YZP9 BC051019-201ENSMUST00000033334 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Ccdc6D3YZP9 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Ccdc6D3YZP9 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Ccdc6D3YZP9 Hsd17b6-201ENSMUST00000026462 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Ccdc6D3YZP9 Dda1-206ENSMUST00000138892 1738 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc6D3YZP9 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc6D3YZP9 Gypc-202ENSMUST00000174000 2072 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc6D3YZP9 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc6D3YZP9 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc6D3YZP9 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc6D3YZP9 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc6D3YZP9 Slc36a1-202ENSMUST00000108867 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc6D3YZP9 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc6D3YZP9 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc6D3YZP9 Gm12029-201ENSMUST00000120073 832 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
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