Protein–RNA interactions for Protein: B5KM66

Syce3, Synaptonemal complex central element protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 88 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syce3B5KM66 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Syce3B5KM66 Fbxl12-203ENSMUST00000131128 4182 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Syce3B5KM66 Phf21a-206ENSMUST00000111292 2461 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Syce3B5KM66 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Syce3B5KM66 Tfe3-206ENSMUST00000115679 3239 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Syce3B5KM66 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Syce3B5KM66 Il4ra-201ENSMUST00000033004 5256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Syce3B5KM66 Pik3cd-201ENSMUST00000038859 4905 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Syce3B5KM66 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Syce3B5KM66 BC001981-202ENSMUST00000191393 1545 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Syce3B5KM66 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Syce3B5KM66 Sbds-201ENSMUST00000026387 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Syce3B5KM66 Dnm2-206ENSMUST00000172482 2613 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Syce3B5KM66 Abhd14b-201ENSMUST00000048527 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Syce3B5KM66 Il13ra1-201ENSMUST00000033418 3712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Syce3B5KM66 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Syce3B5KM66 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Syce3B5KM66 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Syce3B5KM66 Pik3r6-202ENSMUST00000102613 3225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Syce3B5KM66 Acsl6-210ENSMUST00000108905 5807 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Syce3B5KM66 Gm5385-201ENSMUST00000118988 1559 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Syce3B5KM66 Gm36745-201ENSMUST00000213455 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Syce3B5KM66 Phka1-203ENSMUST00000113611 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Syce3B5KM66 Phka1-205ENSMUST00000120270 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Syce3B5KM66 Elf1-201ENSMUST00000040131 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Syce3B5KM66 Cpeb1-201ENSMUST00000098331 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Syce3B5KM66 Gm20554-201ENSMUST00000177421 2352 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Syce3B5KM66 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Syce3B5KM66 Dync1i1-204ENSMUST00000115559 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Syce3B5KM66 Ntsr1-202ENSMUST00000170448 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Syce3B5KM66 Gm45743-201ENSMUST00000212701 2795 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Syce3B5KM66 Usp33-209ENSMUST00000197748 4183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Syce3B5KM66 Sema3d-201ENSMUST00000030868 6307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Syce3B5KM66 Ocrl-203ENSMUST00000115020 3210 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Syce3B5KM66 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Syce3B5KM66 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Syce3B5KM66 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Syce3B5KM66 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Syce3B5KM66 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Syce3B5KM66 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Syce3B5KM66 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Syce3B5KM66 9430085M18Rik-201ENSMUST00000198824 1178 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Syce3B5KM66 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Syce3B5KM66 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Syce3B5KM66 Gm30934-201ENSMUST00000215803 815 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Syce3B5KM66 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Syce3B5KM66 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Syce3B5KM66 Ggn-201ENSMUST00000033886 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Syce3B5KM66 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Syce3B5KM66 Rnf44-218ENSMUST00000177950 3941 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Syce3B5KM66 Adamts16-201ENSMUST00000080145 4981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Syce3B5KM66 B230369F24Rik-201ENSMUST00000141846 2560 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Syce3B5KM66 Acbd5-213ENSMUST00000227809 1986 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Syce3B5KM66 Zc3h13-201ENSMUST00000022577 6151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Syce3B5KM66 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Syce3B5KM66 Hist1h2be-202ENSMUST00000091704 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Syce3B5KM66 Fam198a-202ENSMUST00000213773 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Syce3B5KM66 Kiss1r-201ENSMUST00000045529 3163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Syce3B5KM66 Unc5d-204ENSMUST00000210785 3404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Syce3B5KM66 Caprin1-201ENSMUST00000028607 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Syce3B5KM66 Gm10561-201ENSMUST00000181563 1943 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Syce3B5KM66 Stx11-202ENSMUST00000163425 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Syce3B5KM66 Cd80-201ENSMUST00000099816 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Syce3B5KM66 2900026A02Rik-201ENSMUST00000050125 5876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Syce3B5KM66 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Syce3B5KM66 Mmab-202ENSMUST00000112245 644 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Syce3B5KM66 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Syce3B5KM66 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Syce3B5KM66 Hoxa7-203ENSMUST00000140316 643 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Syce3B5KM66 3110053B16Rik-204ENSMUST00000145605 575 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Syce3B5KM66 Smim17-203ENSMUST00000161855 664 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Syce3B5KM66 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Syce3B5KM66 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Syce3B5KM66 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Syce3B5KM66 Psmd8-207ENSMUST00000209034 1983 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Syce3B5KM66 Aifm3-201ENSMUST00000023448 2688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Syce3B5KM66 Nacc1-201ENSMUST00000001975 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Syce3B5KM66 Dpysl5-202ENSMUST00000101442 1309 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Syce3B5KM66 Zfyve28-201ENSMUST00000094868 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Syce3B5KM66 Reep3-201ENSMUST00000020023 5430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Syce3B5KM66 S1pr3-201ENSMUST00000087978 4463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Syce3B5KM66 Canx-201ENSMUST00000020637 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Syce3B5KM66 Sltm-206ENSMUST00000216816 3755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Syce3B5KM66 Sfxn3-203ENSMUST00000111954 2867 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Syce3B5KM66 Nfe2-205ENSMUST00000133600 1605 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Syce3B5KM66 AC159196.2-201ENSMUST00000224082 1622 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Syce3B5KM66 Gigyf2-201ENSMUST00000027475 5724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Syce3B5KM66 Stx3-203ENSMUST00000075304 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Syce3B5KM66 Vapb-201ENSMUST00000067530 7029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Syce3B5KM66 Tctn2-207ENSMUST00000185820 2733 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Syce3B5KM66 Ugt1a8-201ENSMUST00000113139 2227 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Syce3B5KM66 AC122314.1-201ENSMUST00000223056 2239 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Syce3B5KM66 Glis3-202ENSMUST00000112612 3016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Syce3B5KM66 Ptch2-201ENSMUST00000030443 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Syce3B5KM66 Tesmin-203ENSMUST00000142193 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Syce3B5KM66 Fam13c-202ENSMUST00000105436 3380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Syce3B5KM66 Epha8-201ENSMUST00000030420 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Syce3B5KM66 Ap1s2-201ENSMUST00000033734 1785 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Syce3B5KM66 Spry2-201ENSMUST00000022709 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Syce3B5KM66 Ext1-201ENSMUST00000077273 7663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.4 ms