Protein–RNA interactions for Protein: B4XVP9

Phf11c, PHD finger protein 11C, mousemouse

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Length 339 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phf11cB4XVP9 Ints7-201ENSMUST00000045450 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Phf11cB4XVP9 Acsl6-210ENSMUST00000108905 5807 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Phf11cB4XVP9 Unc5d-204ENSMUST00000210785 3404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Phf11cB4XVP9 AC159196.2-201ENSMUST00000224082 1622 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Phf11cB4XVP9 Syt2-204ENSMUST00000188842 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Phf11cB4XVP9 Kcnk13-201ENSMUST00000049788 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Phf11cB4XVP9 Pla2g4c-204ENSMUST00000167232 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Phf11cB4XVP9 Wnt9a-201ENSMUST00000000128 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Phf11cB4XVP9 2310022A10Rik-204ENSMUST00000187032 1871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Phf11cB4XVP9 Arhgef2-229ENSMUST00000177303 3000 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Phf11cB4XVP9 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Phf11cB4XVP9 Nrf1-210ENSMUST00000115211 3295 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Phf11cB4XVP9 Lamtor2-202ENSMUST00000119002 568 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Phf11cB4XVP9 Rpl27a-203ENSMUST00000143107 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Phf11cB4XVP9 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Phf11cB4XVP9 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Phf11cB4XVP9 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Phf11cB4XVP9 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Phf11cB4XVP9 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Phf11cB4XVP9 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Phf11cB4XVP9 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Phf11cB4XVP9 Selenow-201ENSMUST00000044355 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Phf11cB4XVP9 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Phf11cB4XVP9 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Phf11cB4XVP9 Phf13-201ENSMUST00000055688 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Phf11cB4XVP9 Slc5a11-201ENSMUST00000033035 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Phf11cB4XVP9 Dnmt3b-208ENSMUST00000109772 4015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Phf11cB4XVP9 Got1-201ENSMUST00000026196 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Phf11cB4XVP9 Chfr-202ENSMUST00000112519 3159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Phf11cB4XVP9 Slc25a15-201ENSMUST00000033871 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Phf11cB4XVP9 Cplx4-201ENSMUST00000025397 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Phf11cB4XVP9 Vwa3b-202ENSMUST00000067178 1769 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.34
Phf11cB4XVP9 Otx2-209ENSMUST00000226501 2592 ntAPPRIS P1 BASIC12.96□□□□□ -0.34
Phf11cB4XVP9 Nfatc4-201ENSMUST00000024179 3267 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Phf11cB4XVP9 Rab11fip1-201ENSMUST00000033878 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Phf11cB4XVP9 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Phf11cB4XVP9 Ppara-202ENSMUST00000109422 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Phf11cB4XVP9 Gpr85-201ENSMUST00000060442 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Phf11cB4XVP9 Gm13288-201ENSMUST00000094977 2850 ntAPPRIS P1 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Phf11cB4XVP9 Lingo1-202ENSMUST00000114247 2287 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Phf11cB4XVP9 Sema3d-201ENSMUST00000030868 6307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Phf11cB4XVP9 Sbsn-201ENSMUST00000080518 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Phf11cB4XVP9 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Phf11cB4XVP9 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Phf11cB4XVP9 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Phf11cB4XVP9 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Phf11cB4XVP9 Nmi-205ENSMUST00000145481 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Phf11cB4XVP9 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Phf11cB4XVP9 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Phf11cB4XVP9 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Phf11cB4XVP9 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Phf11cB4XVP9 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Phf11cB4XVP9 9430085M18Rik-201ENSMUST00000198824 1178 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Phf11cB4XVP9 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Phf11cB4XVP9 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Phf11cB4XVP9 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Phf11cB4XVP9 Ndufa8-201ENSMUST00000070112 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Phf11cB4XVP9 Mir497b-201ENSMUST00000093601 125 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Phf11cB4XVP9 Rubcn-203ENSMUST00000115105 5255 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Phf11cB4XVP9 Prss36-202ENSMUST00000118755 3028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Phf11cB4XVP9 Pik3ip1-201ENSMUST00000045153 2573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Phf11cB4XVP9 Gm45242-201ENSMUST00000210666 2129 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Phf11cB4XVP9 Arhgef2-201ENSMUST00000029694 4300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Phf11cB4XVP9 Nptn-206ENSMUST00000176557 1898 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Phf11cB4XVP9 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Phf11cB4XVP9 Pcdh8-201ENSMUST00000039568 4000 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Phf11cB4XVP9 Ampd2-202ENSMUST00000102637 3586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Phf11cB4XVP9 Cacna1g-203ENSMUST00000103166 8104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Phf11cB4XVP9 Rnf185-201ENSMUST00000064364 2906 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Phf11cB4XVP9 Cct4-204ENSMUST00000173867 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Phf11cB4XVP9 Wiz-201ENSMUST00000064694 2871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Phf11cB4XVP9 Trpc7-206ENSMUST00000173513 2241 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Phf11cB4XVP9 Gm10729-202ENSMUST00000193403 1375 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Phf11cB4XVP9 Slc34a1-201ENSMUST00000057167 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Phf11cB4XVP9 Bcl2l1-201ENSMUST00000007803 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Phf11cB4XVP9 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Phf11cB4XVP9 AC114543.1-201ENSMUST00000226451 1558 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Phf11cB4XVP9 Efr3a-205ENSMUST00000173858 2848 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Phf11cB4XVP9 Emc3-201ENSMUST00000032425 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Phf11cB4XVP9 Map4k2-201ENSMUST00000025897 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Phf11cB4XVP9 Cttnbp2nl-202ENSMUST00000098763 4834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Phf11cB4XVP9 Ablim1-202ENSMUST00000099294 6232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Phf11cB4XVP9 Slc6a8-201ENSMUST00000033752 3964 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Phf11cB4XVP9 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Phf11cB4XVP9 Fosb-207ENSMUST00000208505 3523 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Phf11cB4XVP9 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Phf11cB4XVP9 Bbs5-201ENSMUST00000074963 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Phf11cB4XVP9 Tbc1d16-201ENSMUST00000036113 6986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Phf11cB4XVP9 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Phf11cB4XVP9 Tmem109-207ENSMUST00000147699 1096 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Phf11cB4XVP9 Gm9719-201ENSMUST00000162765 543 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Phf11cB4XVP9 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Phf11cB4XVP9 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Phf11cB4XVP9 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Phf11cB4XVP9 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Phf11cB4XVP9 Gm6916-202ENSMUST00000205523 195 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Phf11cB4XVP9 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Phf11cB4XVP9 Gm36236-201ENSMUST00000220780 701 ntTSL 3 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Phf11cB4XVP9 Dupd1-202ENSMUST00000224735 548 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Phf11cB4XVP9 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.9 ms