Protein–RNA interactions for Protein: B2RUQ2

Usf3, Gene model 608, (NCBI), mousemouse

Predictions only

Length 2,221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usf3B2RUQ2 Serinc5-201ENSMUST00000049488 5366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Usf3B2RUQ2 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Usf3B2RUQ2 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Usf3B2RUQ2 Trim32-202ENSMUST00000107366 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Usf3B2RUQ2 Hspb8-201ENSMUST00000036991 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Usf3B2RUQ2 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Usf3B2RUQ2 Eya4-206ENSMUST00000219315 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Usf3B2RUQ2 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Usf3B2RUQ2 Fgfr1-203ENSMUST00000119398 3789 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Usf3B2RUQ2 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Usf3B2RUQ2 1700001C02Rik-203ENSMUST00000127815 660 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Usf3B2RUQ2 Pfdn6-205ENSMUST00000174426 396 ntTSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Usf3B2RUQ2 Gm28942-201ENSMUST00000186334 365 ntTSL 3 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Usf3B2RUQ2 9430007M09Rik-201ENSMUST00000201947 804 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Usf3B2RUQ2 AC159474.1-201ENSMUST00000218454 374 ntTSL 3 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Usf3B2RUQ2 Taf11-201ENSMUST00000025057 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Usf3B2RUQ2 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Usf3B2RUQ2 1700037C18Rik-202ENSMUST00000115859 2592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Usf3B2RUQ2 Rnf224-202ENSMUST00000205192 1707 ntAPPRIS P1 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Usf3B2RUQ2 Fbln1-201ENSMUST00000057410 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Usf3B2RUQ2 B430305J03Rik-201ENSMUST00000066298 3702 ntAPPRIS P1 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Usf3B2RUQ2 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Usf3B2RUQ2 Bag6-203ENSMUST00000172571 3599 ntTSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Usf3B2RUQ2 Hk3-208ENSMUST00000153665 2945 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Usf3B2RUQ2 Trim15-201ENSMUST00000025329 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Usf3B2RUQ2 Zdhhc23-201ENSMUST00000036321 1380 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Usf3B2RUQ2 Col22a1-202ENSMUST00000159993 8809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Usf3B2RUQ2 E230013L22Rik-201ENSMUST00000180408 1856 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Usf3B2RUQ2 Rasd2-202ENSMUST00000139848 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Usf3B2RUQ2 Maged2-204ENSMUST00000112700 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Usf3B2RUQ2 Gpat2-201ENSMUST00000062211 2628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Usf3B2RUQ2 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Usf3B2RUQ2 Ttc7-201ENSMUST00000041110 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Usf3B2RUQ2 Syngap1-202ENSMUST00000177932 3927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Usf3B2RUQ2 Sesn3-207ENSMUST00000209187 1700 ntTSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Usf3B2RUQ2 Trp73-201ENSMUST00000097762 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Usf3B2RUQ2 Matn3-201ENSMUST00000020899 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Usf3B2RUQ2 Igha-202ENSMUST00000194738 2540 ntAPPRIS P5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Usf3B2RUQ2 Gm12957-201ENSMUST00000117835 377 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Usf3B2RUQ2 Gm16175-201ENSMUST00000128181 248 ntTSL 3 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Usf3B2RUQ2 Gm12446-202ENSMUST00000152069 713 ntTSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Usf3B2RUQ2 Mir6392-201ENSMUST00000184924 108 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Usf3B2RUQ2 AC154846.1-201ENSMUST00000226278 862 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Usf3B2RUQ2 Tmem253-203ENSMUST00000227295 704 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Usf3B2RUQ2 Srd5a2-201ENSMUST00000043458 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Usf3B2RUQ2 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Usf3B2RUQ2 S100a16-201ENSMUST00000098910 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Usf3B2RUQ2 Mdm2-201ENSMUST00000020408 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Usf3B2RUQ2 Eln-201ENSMUST00000015138 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Usf3B2RUQ2 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Usf3B2RUQ2 Zyx-202ENSMUST00000164375 3188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Usf3B2RUQ2 Oprm1-202ENSMUST00000052751 1334 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Usf3B2RUQ2 Oprm1-207ENSMUST00000092731 1332 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Usf3B2RUQ2 Tppp3-203ENSMUST00000177126 1396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Usf3B2RUQ2 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Usf3B2RUQ2 Ell-201ENSMUST00000093454 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Usf3B2RUQ2 Xkr5-202ENSMUST00000095438 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Usf3B2RUQ2 Ppt2-201ENSMUST00000064953 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Usf3B2RUQ2 Pdss2-202ENSMUST00000159139 1467 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Usf3B2RUQ2 Hcrtr1-202ENSMUST00000119423 2439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Usf3B2RUQ2 Dlst-201ENSMUST00000053811 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Usf3B2RUQ2 Mfn2-203ENSMUST00000105715 4043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Usf3B2RUQ2 Spaca3-202ENSMUST00000103223 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Usf3B2RUQ2 Gfpt1-203ENSMUST00000113657 1200 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Usf3B2RUQ2 Apoo-203ENSMUST00000113897 1218 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Usf3B2RUQ2 Pigyl-202ENSMUST00000148088 676 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Usf3B2RUQ2 Tmem52-204ENSMUST00000178188 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Usf3B2RUQ2 Tmem52-205ENSMUST00000178238 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Usf3B2RUQ2 Gm26871-201ENSMUST00000180593 700 ntTSL 3 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Usf3B2RUQ2 Gm26602-201ENSMUST00000181321 285 ntAPPRIS P1 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Usf3B2RUQ2 Inpp4a-213ENSMUST00000193774 1243 ntTSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Usf3B2RUQ2 C030018K13Rik-202ENSMUST00000196829 712 ntTSL 3 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Usf3B2RUQ2 Trib2-204ENSMUST00000221518 1192 ntTSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Usf3B2RUQ2 Hilpda-201ENSMUST00000054445 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Usf3B2RUQ2 Fxyd1-202ENSMUST00000071697 522 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Usf3B2RUQ2 Olfr373-201ENSMUST00000074540 945 ntAPPRIS P1 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Usf3B2RUQ2 Ptpn11-202ENSMUST00000100770 5599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Usf3B2RUQ2 Gpsm1-204ENSMUST00000114134 2043 ntTSL 3 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Usf3B2RUQ2 Gspt1-205ENSMUST00000167571 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Usf3B2RUQ2 Jaml-204ENSMUST00000215880 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Usf3B2RUQ2 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Usf3B2RUQ2 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Usf3B2RUQ2 Ddx31-201ENSMUST00000113853 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Usf3B2RUQ2 Nt5c2-202ENSMUST00000168536 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Usf3B2RUQ2 Trim80-201ENSMUST00000093914 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Usf3B2RUQ2 Rasl10b-203ENSMUST00000164425 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Usf3B2RUQ2 Gm42872-201ENSMUST00000200026 1967 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Usf3B2RUQ2 Sp9-201ENSMUST00000090813 4514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Usf3B2RUQ2 Krt26-201ENSMUST00000100482 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Usf3B2RUQ2 Gtf2i-206ENSMUST00000172715 4114 ntTSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Usf3B2RUQ2 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Usf3B2RUQ2 Ptp4a2-207ENSMUST00000165853 3382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Usf3B2RUQ2 Tpd52l2-203ENSMUST00000108799 985 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Usf3B2RUQ2 Prrx2-202ENSMUST00000113592 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Usf3B2RUQ2 Gm5303-201ENSMUST00000117943 1252 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Usf3B2RUQ2 Gm5678-201ENSMUST00000120115 939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Usf3B2RUQ2 Gm16122-201ENSMUST00000142625 1158 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Usf3B2RUQ2 Gm37424-201ENSMUST00000191727 561 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Usf3B2RUQ2 Tcf4-258ENSMUST00000202937 2103 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Usf3B2RUQ2 AC154171.1-201ENSMUST00000224610 643 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.7 ms