Protein–RNA interactions for Protein: A9JSM3

Tmem238, Transmembrane protein 238, mousemouse

Predictions only

Length 176 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem238A9JSM3 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Tmem238A9JSM3 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Tmem238A9JSM3 Evi5l-208ENSMUST00000176825 3728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Tmem238A9JSM3 Ttc14-201ENSMUST00000099153 9661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Tmem238A9JSM3 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Tmem238A9JSM3 Sec16a-202ENSMUST00000114082 8797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Tmem238A9JSM3 Gm26819-201ENSMUST00000180656 5128 ntTSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Tmem238A9JSM3 Tenm3-201ENSMUST00000033965 8961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Tmem238A9JSM3 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Tmem238A9JSM3 AC115735.4-201ENSMUST00000227460 1944 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Tmem238A9JSM3 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Tmem238A9JSM3 Gmppb-202ENSMUST00000112295 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Tmem238A9JSM3 Ldhd-201ENSMUST00000070004 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Tmem238A9JSM3 Fam214b-203ENSMUST00000107957 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Tmem238A9JSM3 Lamp5-201ENSMUST00000057503 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Tmem238A9JSM3 Terf2ip-201ENSMUST00000052138 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Tmem238A9JSM3 Plxna1-201ENSMUST00000049845 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Tmem238A9JSM3 Kcnt1-201ENSMUST00000037580 5881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Tmem238A9JSM3 Lrrc17-201ENSMUST00000035651 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Tmem238A9JSM3 Trim56-201ENSMUST00000054384 9279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Tmem238A9JSM3 Igsf9-201ENSMUST00000052629 4133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Tmem238A9JSM3 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC10.02□□□□□ -0.8
Tmem238A9JSM3 Sez6l-206ENSMUST00000212758 2664 ntTSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.8
Tmem238A9JSM3 Adam11-202ENSMUST00000103081 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Tmem238A9JSM3 Map1lc3b-201ENSMUST00000034270 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Tmem238A9JSM3 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.8
Tmem238A9JSM3 Pik3r1-202ENSMUST00000055518 7113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Tmem238A9JSM3 Dtnb-201ENSMUST00000077930 2376 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Tmem238A9JSM3 Rxrg-204ENSMUST00000111386 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.8
Tmem238A9JSM3 Ppp1r18-202ENSMUST00000122899 2743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Tmem238A9JSM3 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Tmem238A9JSM3 Gm16685-201ENSMUST00000181286 1592 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Tmem238A9JSM3 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Tmem238A9JSM3 Pold3-201ENSMUST00000032969 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Tmem238A9JSM3 Nr4a2-203ENSMUST00000112629 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Tmem238A9JSM3 Cpped1-201ENSMUST00000073371 1922 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Tmem238A9JSM3 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Tmem238A9JSM3 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Tmem238A9JSM3 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Tmem238A9JSM3 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Tmem238A9JSM3 Mirt1-203ENSMUST00000181539 2259 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Tmem238A9JSM3 Kcnj11-205ENSMUST00000211674 3142 ntAPPRIS P1 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Tmem238A9JSM3 Tmem163-205ENSMUST00000185560 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Tmem238A9JSM3 Gm16046-203ENSMUST00000150889 1001 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Tmem238A9JSM3 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Tmem238A9JSM3 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
Tmem238A9JSM3 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Tmem238A9JSM3 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Tmem238A9JSM3 Gm19817-201ENSMUST00000199764 2132 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
Tmem238A9JSM3 Tcf4-258ENSMUST00000202937 2103 ntTSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Tmem238A9JSM3 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
Tmem238A9JSM3 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Tmem238A9JSM3 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
Tmem238A9JSM3 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Tmem238A9JSM3 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Tmem238A9JSM3 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
Tmem238A9JSM3 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Tmem238A9JSM3 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Tmem238A9JSM3 Dennd4c-202ENSMUST00000082026 7940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Tmem238A9JSM3 Glp2r-202ENSMUST00000051765 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Tmem238A9JSM3 Reep3-201ENSMUST00000020023 5430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Tmem238A9JSM3 Gm12333-201ENSMUST00000155508 2669 ntTSL 3 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Tmem238A9JSM3 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Tmem238A9JSM3 Adam19-201ENSMUST00000011400 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Tmem238A9JSM3 Gm9008-201ENSMUST00000097218 2353 ntAPPRIS P1 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Tmem238A9JSM3 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Tmem238A9JSM3 Nckap5l-201ENSMUST00000023747 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Tmem238A9JSM3 Ric8b-202ENSMUST00000095385 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Tmem238A9JSM3 Ccdc85a-202ENSMUST00000093253 5431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Tmem238A9JSM3 Camsap3-209ENSMUST00000207970 3817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Tmem238A9JSM3 Abca7-202ENSMUST00000132517 6696 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Tmem238A9JSM3 CT025681.1-201ENSMUST00000225453 1855 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
Tmem238A9JSM3 Gm14451-201ENSMUST00000121581 1542 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
Tmem238A9JSM3 Elk3-201ENSMUST00000008542 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Tmem238A9JSM3 Atxn2l-201ENSMUST00000040202 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Tmem238A9JSM3 Fbxl12-201ENSMUST00000086458 2056 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Tmem238A9JSM3 Fbxl12-202ENSMUST00000086459 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Tmem238A9JSM3 Ddi2-202ENSMUST00000177592 3539 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Tmem238A9JSM3 Rbm4-206ENSMUST00000180248 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Tmem238A9JSM3 1700001L05Rik-201ENSMUST00000100370 2270 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Tmem238A9JSM3 Cep41-203ENSMUST00000115131 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Tmem238A9JSM3 Gm36957-201ENSMUST00000192982 2824 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
Tmem238A9JSM3 Ocln-201ENSMUST00000022140 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Tmem238A9JSM3 Asph-202ENSMUST00000078139 6694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Tmem238A9JSM3 Strip2-205ENSMUST00000151738 5281 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Tmem238A9JSM3 Mtus2-203ENSMUST00000085558 7543 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Tmem238A9JSM3 Cacna1c-201ENSMUST00000075591 7584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Tmem238A9JSM3 Zfp853-201ENSMUST00000180336 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Tmem238A9JSM3 Fbxo34-205ENSMUST00000168833 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Tmem238A9JSM3 Gm43463-201ENSMUST00000195967 1803 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Tmem238A9JSM3 Jade2-203ENSMUST00000109091 6099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Tmem238A9JSM3 Gm11992-201ENSMUST00000043285 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Tmem238A9JSM3 Brat1-202ENSMUST00000100505 3431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Tmem238A9JSM3 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Tmem238A9JSM3 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Tmem238A9JSM3 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Tmem238A9JSM3 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Tmem238A9JSM3 Lamtor2-202ENSMUST00000119002 568 ntTSL 2 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Tmem238A9JSM3 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Tmem238A9JSM3 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 75.9 ms