Protein–RNA interactions for Protein: A3KMN5

Prr16, Protein Largen, mousemouse

Predictions only

Length 304 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prr16A3KMN5 Gm6460-202ENSMUST00000163787 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Prr16A3KMN5 Gm8879-201ENSMUST00000170260 1125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Prr16A3KMN5 4933402N22Rik-202ENSMUST00000170301 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Prr16A3KMN5 Ube2i-211ENSMUST00000173713 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Prr16A3KMN5 Gm26854-201ENSMUST00000180418 705 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Prr16A3KMN5 Ighv5-13-201ENSMUST00000193550 290 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Prr16A3KMN5 4933405L10Rik-202ENSMUST00000211852 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Prr16A3KMN5 Gm17330-201ENSMUST00000221047 165 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
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Prr16A3KMN5 Nupr1-201ENSMUST00000032961 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Prr16A3KMN5 Ngf-201ENSMUST00000035952 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Prr16A3KMN5 Dlgap3-201ENSMUST00000046659 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Prr16A3KMN5 Gm2155-201ENSMUST00000181581 1974 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Prr16A3KMN5 Slc52a3-202ENSMUST00000109858 2094 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Prr16A3KMN5 Trim27-201ENSMUST00000021761 4204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
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Prr16A3KMN5 9330182L06Rik-201ENSMUST00000069538 4688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Prr16A3KMN5 Cdk19-202ENSMUST00000095743 3973 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Prr16A3KMN5 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Prr16A3KMN5 Atxn7l1-202ENSMUST00000090597 2563 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Prr16A3KMN5 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Prr16A3KMN5 Erfe-201ENSMUST00000086861 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Prr16A3KMN5 Mzf1-204ENSMUST00000182490 2872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Prr16A3KMN5 Gm20488-201ENSMUST00000201641 2996 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
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Prr16A3KMN5 Kmt5c-203ENSMUST00000108583 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Prr16A3KMN5 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
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Prr16A3KMN5 Dhrs3-206ENSMUST00000154208 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Prr16A3KMN5 Gm5639-201ENSMUST00000122305 2403 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Prr16A3KMN5 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Prr16A3KMN5 Eogt-202ENSMUST00000113387 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Prr16A3KMN5 Gm20412-201ENSMUST00000173249 633 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
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Prr16A3KMN5 Smyd3-207ENSMUST00000194237 1047 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Prr16A3KMN5 Gm648-201ENSMUST00000081133 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Prr16A3KMN5 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Prr16A3KMN5 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Prr16A3KMN5 4732463B04Rik-201ENSMUST00000180751 2932 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
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Prr16A3KMN5 Spock2-201ENSMUST00000121820 5238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Prr16A3KMN5 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Prr16A3KMN5 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Prr16A3KMN5 Entpd2-201ENSMUST00000028328 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Prr16A3KMN5 Lrrc8a-202ENSMUST00000113654 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Prr16A3KMN5 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Prr16A3KMN5 Gm26559-201ENSMUST00000181939 2481 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Prr16A3KMN5 Cgn-201ENSMUST00000107272 4963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Prr16A3KMN5 H3f3b-202ENSMUST00000106454 2514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Prr16A3KMN5 Grb10-201ENSMUST00000093321 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Prr16A3KMN5 Pus7-201ENSMUST00000119946 3407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Prr16A3KMN5 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Prr16A3KMN5 Abr-205ENSMUST00000108408 3534 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Prr16A3KMN5 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Prr16A3KMN5 Trim45-203ENSMUST00000106980 3337 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Prr16A3KMN5 Wdr5-201ENSMUST00000113952 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
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Prr16A3KMN5 Naaa-202ENSMUST00000159345 1629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
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Prr16A3KMN5 Unc5d-204ENSMUST00000210785 3404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Prr16A3KMN5 AC087891.2-201ENSMUST00000219293 658 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Prr16A3KMN5 AI463170-204ENSMUST00000220157 447 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Prr16A3KMN5 Fuom-201ENSMUST00000026539 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Prr16A3KMN5 Ngef-201ENSMUST00000027477 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Prr16A3KMN5 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Prr16A3KMN5 Haus7-201ENSMUST00000033737 1380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Prr16A3KMN5 C130050O18Rik-201ENSMUST00000052176 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Prr16A3KMN5 Btrc-201ENSMUST00000065601 2978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Prr16A3KMN5 A730061H03Rik-201ENSMUST00000066106 465 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Prr16A3KMN5 Ttr-201ENSMUST00000075312 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Prr16A3KMN5 B3galt4-201ENSMUST00000087543 1569 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Prr16A3KMN5 Phka1-204ENSMUST00000119229 6025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Prr16A3KMN5 Tle3-215ENSMUST00000162583 4299 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Prr16A3KMN5 Kcng1-202ENSMUST00000109191 4089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Prr16A3KMN5 Atp13a2-203ENSMUST00000127833 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Prr16A3KMN5 Stxbp1-202ENSMUST00000077458 3616 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Prr16A3KMN5 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Prr16A3KMN5 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Prr16A3KMN5 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
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