Protein–RNA interactions for Protein: A2BFR3

H2al1j, Histone H2A, mousemouse

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Length 109 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2al1jA2BFR3 Abra-201ENSMUST00000054742 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
H2al1jA2BFR3 Vrtn-202ENSMUST00000166772 3098 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.68□□□□□ -0.7
H2al1jA2BFR3 Nars-201ENSMUST00000025483 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
H2al1jA2BFR3 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
H2al1jA2BFR3 Gm5678-201ENSMUST00000120115 939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
H2al1jA2BFR3 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
H2al1jA2BFR3 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
H2al1jA2BFR3 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
H2al1jA2BFR3 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
H2al1jA2BFR3 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
H2al1jA2BFR3 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
H2al1jA2BFR3 Gm44350-201ENSMUST00000197197 138 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
H2al1jA2BFR3 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
H2al1jA2BFR3 Gm44313-201ENSMUST00000198018 138 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
H2al1jA2BFR3 Gm44486-201ENSMUST00000198508 138 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
H2al1jA2BFR3 Gm44314-201ENSMUST00000199263 138 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
H2al1jA2BFR3 Gm44394-201ENSMUST00000199558 138 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
H2al1jA2BFR3 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
H2al1jA2BFR3 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
H2al1jA2BFR3 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
H2al1jA2BFR3 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
H2al1jA2BFR3 CT030704.2-201ENSMUST00000228887 494 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
H2al1jA2BFR3 1700120B22Rik-201ENSMUST00000054837 464 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
H2al1jA2BFR3 Zfp354c-201ENSMUST00000000632 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
H2al1jA2BFR3 Clcn6-201ENSMUST00000030879 3306 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
H2al1jA2BFR3 Zfp125-201ENSMUST00000079237 2488 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
H2al1jA2BFR3 4931428F04Rik-203ENSMUST00000212219 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
H2al1jA2BFR3 Oraov1-201ENSMUST00000033388 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
H2al1jA2BFR3 Kcnma1-212ENSMUST00000188285 4440 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
H2al1jA2BFR3 Ube2k-210ENSMUST00000202679 4682 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
H2al1jA2BFR3 Cpeb4-201ENSMUST00000020543 2312 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
H2al1jA2BFR3 Fam214b-201ENSMUST00000036462 3074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
H2al1jA2BFR3 Mllt6-202ENSMUST00000107586 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
H2al1jA2BFR3 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
H2al1jA2BFR3 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
H2al1jA2BFR3 Gm29052-201ENSMUST00000187700 1451 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
H2al1jA2BFR3 Rtl6-201ENSMUST00000069476 4426 ntAPPRIS P1 BASIC10.68□□□□□ -0.7
H2al1jA2BFR3 Gm26525-201ENSMUST00000180666 3616 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
H2al1jA2BFR3 AC116503.1-201ENSMUST00000215445 2192 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
H2al1jA2BFR3 Slc16a3-208ENSMUST00000168579 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
H2al1jA2BFR3 Tcf12-218ENSMUST00000184783 3489 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
H2al1jA2BFR3 Dpysl5-203ENSMUST00000114729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
H2al1jA2BFR3 Cd80-201ENSMUST00000099816 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
H2al1jA2BFR3 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
H2al1jA2BFR3 Lcmt2-202ENSMUST00000110674 3056 ntAPPRIS P1 BASIC10.67□□□□□ -0.7
H2al1jA2BFR3 Cecr2-202ENSMUST00000112686 9212 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
H2al1jA2BFR3 Sp2-201ENSMUST00000062652 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
H2al1jA2BFR3 Fnbp4-201ENSMUST00000013759 4691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
H2al1jA2BFR3 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
H2al1jA2BFR3 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
H2al1jA2BFR3 Cd33-201ENSMUST00000004728 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
H2al1jA2BFR3 Gm10176-201ENSMUST00000159707 2264 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
H2al1jA2BFR3 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
H2al1jA2BFR3 Ffar1-201ENSMUST00000052700 4175 ntAPPRIS P1 BASIC10.67□□□□□ -0.7
H2al1jA2BFR3 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
H2al1jA2BFR3 Gm10561-201ENSMUST00000181563 1943 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
H2al1jA2BFR3 Plcb2-202ENSMUST00000102524 5145 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
H2al1jA2BFR3 Gosr2-202ENSMUST00000107013 1044 ntTSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
H2al1jA2BFR3 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
H2al1jA2BFR3 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
H2al1jA2BFR3 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
H2al1jA2BFR3 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
H2al1jA2BFR3 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
H2al1jA2BFR3 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
H2al1jA2BFR3 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
H2al1jA2BFR3 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
H2al1jA2BFR3 AC139350.3-201ENSMUST00000226151 420 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
H2al1jA2BFR3 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
H2al1jA2BFR3 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
H2al1jA2BFR3 Rbm47-206ENSMUST00000200775 3180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
H2al1jA2BFR3 Atp8a1-201ENSMUST00000037380 8178 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
H2al1jA2BFR3 Fhl4-202ENSMUST00000216889 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
H2al1jA2BFR3 Ccdc170-201ENSMUST00000019901 2151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
H2al1jA2BFR3 Slc29a2-201ENSMUST00000025826 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
H2al1jA2BFR3 Eme1-201ENSMUST00000039949 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
H2al1jA2BFR3 Npepps-219ENSMUST00000172108 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
H2al1jA2BFR3 Armc8-201ENSMUST00000035043 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
H2al1jA2BFR3 Ptpn7-203ENSMUST00000187985 1990 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
H2al1jA2BFR3 D6Ertd527e-203ENSMUST00000203747 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
H2al1jA2BFR3 Eng-202ENSMUST00000113272 3021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
H2al1jA2BFR3 Arhgef16-207ENSMUST00000169623 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
H2al1jA2BFR3 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
H2al1jA2BFR3 Max-201ENSMUST00000082136 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
H2al1jA2BFR3 Prr18-202ENSMUST00000163887 3251 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.66□□□□□ -0.7
H2al1jA2BFR3 Sema7a-201ENSMUST00000043059 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
H2al1jA2BFR3 Tbc1d8-204ENSMUST00000193823 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
H2al1jA2BFR3 Nars2-201ENSMUST00000044466 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
H2al1jA2BFR3 Renbp-209ENSMUST00000155597 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
H2al1jA2BFR3 Prkce-201ENSMUST00000097274 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
H2al1jA2BFR3 BB123696-201ENSMUST00000222580 2056 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
H2al1jA2BFR3 Myoc-201ENSMUST00000028020 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
H2al1jA2BFR3 Pspc1-201ENSMUST00000022507 4114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
H2al1jA2BFR3 Slitrk3-201ENSMUST00000059407 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
H2al1jA2BFR3 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
H2al1jA2BFR3 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
H2al1jA2BFR3 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
H2al1jA2BFR3 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC10.66□□□□□ -0.7
H2al1jA2BFR3 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
H2al1jA2BFR3 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
H2al1jA2BFR3 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
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