Protein–RNA interactions for Protein: A2ANU3

Syndig1, Synapse differentiation-inducing gene protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syndig1A2ANU3 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Syndig1A2ANU3 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Syndig1A2ANU3 Mrps9-201ENSMUST00000057208 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Syndig1A2ANU3 Gm20149-201ENSMUST00000214691 1667 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Syndig1A2ANU3 Gm9947-201ENSMUST00000067599 2920 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Syndig1A2ANU3 Tmem101-201ENSMUST00000021296 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Syndig1A2ANU3 Gk5-202ENSMUST00000122383 4455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Syndig1A2ANU3 Alg10b-201ENSMUST00000100309 3727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Syndig1A2ANU3 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Syndig1A2ANU3 Pcdha11-201ENSMUST00000115658 5359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Syndig1A2ANU3 Erc1-207ENSMUST00000183911 3865 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Syndig1A2ANU3 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Syndig1A2ANU3 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Syndig1A2ANU3 S100b-201ENSMUST00000036387 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Syndig1A2ANU3 Desi1-206ENSMUST00000152227 2934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Syndig1A2ANU3 Rbm33-201ENSMUST00000030920 3955 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Syndig1A2ANU3 Mfge8-202ENSMUST00000107409 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Syndig1A2ANU3 Efemp1-201ENSMUST00000020759 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Syndig1A2ANU3 Bscl2-206ENSMUST00000160556 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Syndig1A2ANU3 Sirt5-207ENSMUST00000221515 1793 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Syndig1A2ANU3 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Syndig1A2ANU3 Tcirg1-211ENSMUST00000145791 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Syndig1A2ANU3 Mecp2-203ENSMUST00000123362 1675 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Syndig1A2ANU3 Gpr153-202ENSMUST00000105650 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Syndig1A2ANU3 Fam53b-205ENSMUST00000106166 1270 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Syndig1A2ANU3 Gm15222-201ENSMUST00000127359 344 ntTSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Syndig1A2ANU3 3000002C10Rik-202ENSMUST00000133495 1008 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Syndig1A2ANU3 Gm11574-201ENSMUST00000139752 946 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Syndig1A2ANU3 Atp5j2-202ENSMUST00000161741 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Syndig1A2ANU3 Lce1j-202ENSMUST00000186525 703 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Syndig1A2ANU3 2310016G11Rik-202ENSMUST00000209111 733 ntTSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Syndig1A2ANU3 Coprs-202ENSMUST00000209371 601 ntTSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Syndig1A2ANU3 Gm33045-202ENSMUST00000210049 975 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Syndig1A2ANU3 AC124510.1-201ENSMUST00000222659 583 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Syndig1A2ANU3 AC139580.1-202ENSMUST00000223574 928 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Syndig1A2ANU3 Rsbn1-201ENSMUST00000051139 4762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Syndig1A2ANU3 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Syndig1A2ANU3 Hp1bp3-204ENSMUST00000105826 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Syndig1A2ANU3 Etfdh-201ENSMUST00000029386 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Syndig1A2ANU3 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Syndig1A2ANU3 Dnajc6-204ENSMUST00000106930 5127 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Syndig1A2ANU3 Rabep2-201ENSMUST00000106405 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Syndig1A2ANU3 Cybrd1-201ENSMUST00000028403 5339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Syndig1A2ANU3 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Syndig1A2ANU3 Kbtbd7-201ENSMUST00000061222 4526 ntAPPRIS P1 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Syndig1A2ANU3 Ahcyl2-201ENSMUST00000064872 2019 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Syndig1A2ANU3 D430041D05Rik-201ENSMUST00000089726 10124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Syndig1A2ANU3 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Syndig1A2ANU3 4930453N24Rik-201ENSMUST00000076991 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Syndig1A2ANU3 Reps2-201ENSMUST00000101102 7630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Syndig1A2ANU3 Igsf8-204ENSMUST00000139528 2866 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Syndig1A2ANU3 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Syndig1A2ANU3 Csk-209ENSMUST00000217314 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Syndig1A2ANU3 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Syndig1A2ANU3 Sirt3-210ENSMUST00000211179 1606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Syndig1A2ANU3 Eno1b-201ENSMUST00000076155 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Syndig1A2ANU3 Prrc2b-201ENSMUST00000036691 8612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Syndig1A2ANU3 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Syndig1A2ANU3 Golim4-202ENSMUST00000117242 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Syndig1A2ANU3 Gm5763-201ENSMUST00000155951 1530 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Syndig1A2ANU3 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Syndig1A2ANU3 Gm34376-201ENSMUST00000218529 2107 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Syndig1A2ANU3 Ccdc155-201ENSMUST00000121017 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Syndig1A2ANU3 Slc4a1ap-201ENSMUST00000114533 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Syndig1A2ANU3 Dnajc27-201ENSMUST00000020986 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Syndig1A2ANU3 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Syndig1A2ANU3 Plod1-202ENSMUST00000105712 1059 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Syndig1A2ANU3 Gm12585-201ENSMUST00000117307 290 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Syndig1A2ANU3 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Syndig1A2ANU3 Gm20499-201ENSMUST00000140374 444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Syndig1A2ANU3 Fbxo44-205ENSMUST00000151127 1403 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Syndig1A2ANU3 Tnfrsf12a-202ENSMUST00000167059 858 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Syndig1A2ANU3 Gsg1l2-202ENSMUST00000181566 1158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Syndig1A2ANU3 Gm26600-201ENSMUST00000181637 1256 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Syndig1A2ANU3 Ip6k2-210ENSMUST00000194875 748 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Syndig1A2ANU3 AC131690.1-201ENSMUST00000218406 374 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Syndig1A2ANU3 Gm19220-201ENSMUST00000222682 803 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Syndig1A2ANU3 Tnfrsf12a-201ENSMUST00000024698 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Syndig1A2ANU3 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Syndig1A2ANU3 Cd1d1-202ENSMUST00000063869 1421 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Syndig1A2ANU3 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Syndig1A2ANU3 Dnajb12-205ENSMUST00000147914 3041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Syndig1A2ANU3 Gm40765-201ENSMUST00000218612 1469 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Syndig1A2ANU3 Zfp574-202ENSMUST00000179556 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Syndig1A2ANU3 Endou-201ENSMUST00000023105 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Syndig1A2ANU3 Cbs-202ENSMUST00000078509 2403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Syndig1A2ANU3 Zfp711-202ENSMUST00000113409 4330 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Syndig1A2ANU3 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Syndig1A2ANU3 Ncor2-204ENSMUST00000111394 7452 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Syndig1A2ANU3 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Syndig1A2ANU3 Tmem9-201ENSMUST00000063719 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Syndig1A2ANU3 Slc35d1-203ENSMUST00000150285 4242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Syndig1A2ANU3 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Syndig1A2ANU3 Cdh7-206ENSMUST00000137092 2681 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Syndig1A2ANU3 Ubqln2-201ENSMUST00000060714 3344 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Syndig1A2ANU3 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Syndig1A2ANU3 Trim27-206ENSMUST00000222544 4312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Syndig1A2ANU3 Il18r1-204ENSMUST00000193391 1738 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Syndig1A2ANU3 Abtb2-201ENSMUST00000076212 4558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Syndig1A2ANU3 Hnf1b-201ENSMUST00000021016 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.7 ms