Protein–RNA interactions for Protein: W8DXL4

Lrit3, Leucine-rich repeat, immunoglobulin-like domain and transmembrane domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 681 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrit3W8DXL4 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Lrit3W8DXL4 Lman2-201ENSMUST00000021940 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Lrit3W8DXL4 Kcnj3-203ENSMUST00000112633 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Lrit3W8DXL4 Snx29-207ENSMUST00000180792 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Lrit3W8DXL4 Fgfr3-210ENSMUST00000169212 4245 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Lrit3W8DXL4 Prcd-202ENSMUST00000116318 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Lrit3W8DXL4 Gm14660-201ENSMUST00000119809 575 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Lrit3W8DXL4 Rapgef3os2-201ENSMUST00000124374 920 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Lrit3W8DXL4 Pisd-ps2-202ENSMUST00000142526 1175 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Lrit3W8DXL4 Rnf2-203ENSMUST00000186415 1106 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Lrit3W8DXL4 Wdr45-225ENSMUST00000208443 1172 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Lrit3W8DXL4 AC139350.3-201ENSMUST00000226151 420 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Lrit3W8DXL4 Ndufc2-201ENSMUST00000032882 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Lrit3W8DXL4 Mrps17-201ENSMUST00000042191 832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Lrit3W8DXL4 Elane-201ENSMUST00000046091 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Lrit3W8DXL4 1700120B22Rik-201ENSMUST00000054837 464 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Lrit3W8DXL4 Hist1h2aa-201ENSMUST00000072391 390 ntAPPRIS P1 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Lrit3W8DXL4 Mdk-203ENSMUST00000090602 714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Lrit3W8DXL4 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Lrit3W8DXL4 Mpzl2-201ENSMUST00000034600 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Lrit3W8DXL4 Tmem220-201ENSMUST00000061786 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Lrit3W8DXL4 AU040320-202ENSMUST00000102607 4191 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Lrit3W8DXL4 Umad1-208ENSMUST00000162034 2015 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Lrit3W8DXL4 Jph3-201ENSMUST00000026357 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Lrit3W8DXL4 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Lrit3W8DXL4 9330182L06Rik-201ENSMUST00000069538 4688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Lrit3W8DXL4 Metap1d-201ENSMUST00000037210 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Lrit3W8DXL4 S100b-201ENSMUST00000036387 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Lrit3W8DXL4 Ccdc157-201ENSMUST00000093381 5015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Lrit3W8DXL4 Vasp-201ENSMUST00000032561 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Lrit3W8DXL4 Rreb1-202ENSMUST00000110237 4617 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Lrit3W8DXL4 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Lrit3W8DXL4 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.35
Lrit3W8DXL4 Trim15-201ENSMUST00000025329 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Lrit3W8DXL4 Tmem9-201ENSMUST00000063719 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Lrit3W8DXL4 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Lrit3W8DXL4 Lrrc17-201ENSMUST00000035651 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Lrit3W8DXL4 Tmed5-202ENSMUST00000061203 2194 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Lrit3W8DXL4 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Lrit3W8DXL4 Nsd3-211ENSMUST00000155861 2834 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Lrit3W8DXL4 Gm11405-201ENSMUST00000118689 1556 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Lrit3W8DXL4 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Lrit3W8DXL4 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Lrit3W8DXL4 Gm9816-201ENSMUST00000122292 1414 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Lrit3W8DXL4 Rad17-202ENSMUST00000177848 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Lrit3W8DXL4 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Lrit3W8DXL4 Tmem254b-202ENSMUST00000100806 1108 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Lrit3W8DXL4 Tmem254a-201ENSMUST00000100811 1108 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Lrit3W8DXL4 Hist1h4d-201ENSMUST00000102968 1138 ntAPPRIS P1 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Lrit3W8DXL4 Pkig-203ENSMUST00000109400 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Lrit3W8DXL4 Fam219aos-201ENSMUST00000151164 708 ntTSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Lrit3W8DXL4 Hist1h3h-201ENSMUST00000188775 411 ntAPPRIS P1 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Lrit3W8DXL4 Hist1h3i-201ENSMUST00000189457 411 ntAPPRIS P1 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Lrit3W8DXL4 Ighv8-14-201ENSMUST00000196781 358 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Lrit3W8DXL4 CT485787.1-201ENSMUST00000225617 968 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Lrit3W8DXL4 Cd37-201ENSMUST00000033063 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Lrit3W8DXL4 Trpt1-201ENSMUST00000088223 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Lrit3W8DXL4 Tmem256-201ENSMUST00000094065 492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Lrit3W8DXL4 Lsm14b-202ENSMUST00000058764 2566 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Lrit3W8DXL4 Fam122b-203ENSMUST00000114841 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Lrit3W8DXL4 Tial1-203ENSMUST00000106228 2835 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Lrit3W8DXL4 Tpk1-201ENSMUST00000067888 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Lrit3W8DXL4 Ccdc151-201ENSMUST00000044926 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Lrit3W8DXL4 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Lrit3W8DXL4 Dgki-202ENSMUST00000090314 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Lrit3W8DXL4 Slc52a3-204ENSMUST00000109861 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Lrit3W8DXL4 Hnrnpm-202ENSMUST00000114385 2550 ntTSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Lrit3W8DXL4 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Lrit3W8DXL4 Ccne2-202ENSMUST00000108324 2908 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Lrit3W8DXL4 Jaml-204ENSMUST00000215880 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Lrit3W8DXL4 Cep295nl-201ENSMUST00000103024 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Lrit3W8DXL4 Pnpla2-203ENSMUST00000164016 2625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Lrit3W8DXL4 Gm45751-201ENSMUST00000210185 1573 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Lrit3W8DXL4 Trim80-201ENSMUST00000093914 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Lrit3W8DXL4 Tmem164-202ENSMUST00000101198 4443 ntTSL 3 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Lrit3W8DXL4 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Lrit3W8DXL4 Gm13055-201ENSMUST00000127875 1961 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Lrit3W8DXL4 Gm28729-201ENSMUST00000190704 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Lrit3W8DXL4 Slc5a6-202ENSMUST00000114668 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Lrit3W8DXL4 Tspan12-202ENSMUST00000120965 2157 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Lrit3W8DXL4 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Lrit3W8DXL4 Nudt17-202ENSMUST00000171249 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Lrit3W8DXL4 Gm29481-201ENSMUST00000189080 1049 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Lrit3W8DXL4 Gm33045-202ENSMUST00000210049 975 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Lrit3W8DXL4 AC139580.1-202ENSMUST00000223574 928 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Lrit3W8DXL4 AC110817.1-201ENSMUST00000225706 605 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Lrit3W8DXL4 Atp6v0c-201ENSMUST00000024932 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Lrit3W8DXL4 Ngf-201ENSMUST00000035952 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Lrit3W8DXL4 Fbxo41-202ENSMUST00000161078 6562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Lrit3W8DXL4 Prpf3-201ENSMUST00000015892 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Lrit3W8DXL4 Gm38391-201ENSMUST00000191720 4069 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Lrit3W8DXL4 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Lrit3W8DXL4 Tmem218-201ENSMUST00000034632 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Lrit3W8DXL4 Gpr153-202ENSMUST00000105650 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Lrit3W8DXL4 Add3-202ENSMUST00000050096 4488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Lrit3W8DXL4 Kcnq2-207ENSMUST00000103050 2713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Lrit3W8DXL4 Fbxw17-201ENSMUST00000046974 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Lrit3W8DXL4 Urm1-201ENSMUST00000091142 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Lrit3W8DXL4 Sh2b3-202ENSMUST00000086310 4195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Lrit3W8DXL4 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
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