Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2Q5

Mrpl40, 39S ribosomal protein L40, mitochondrial, mousemouse

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Length 206 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm9797-201ENSMUST00000052902 613 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
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Mrpl40Q9Z2Q5 Kcnip2-203ENSMUST00000086993 1005 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Mrpl40Q9Z2Q5 Zmat5-201ENSMUST00000009220 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Mrpl40Q9Z2Q5 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm10305-201ENSMUST00000195331 2475 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Mrpl40Q9Z2Q5 Yap1-202ENSMUST00000086580 4115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Mrpl40Q9Z2Q5 Pcdh19-202ENSMUST00000149154 10289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Mrpl40Q9Z2Q5 Nfatc4-201ENSMUST00000024179 3267 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm9252-201ENSMUST00000172364 1602 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Mrpl40Q9Z2Q5 Itga6-202ENSMUST00000112101 4156 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
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Mrpl40Q9Z2Q5 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm19461-205ENSMUST00000191207 2566 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Mrpl40Q9Z2Q5 Chml-201ENSMUST00000104984 6905 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Mrpl40Q9Z2Q5 Chml-202ENSMUST00000209720 6905 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Mrpl40Q9Z2Q5 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Mrpl40Q9Z2Q5 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Mrpl40Q9Z2Q5 Fgd6-201ENSMUST00000020208 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Mrpl40Q9Z2Q5 Klhl12-201ENSMUST00000027725 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Mrpl40Q9Z2Q5 Rbm47-204ENSMUST00000113726 4703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
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Mrpl40Q9Z2Q5 Mcur1-201ENSMUST00000021800 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Mrpl40Q9Z2Q5 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
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Mrpl40Q9Z2Q5 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Mrpl40Q9Z2Q5 Clstn2-202ENSMUST00000162295 4174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
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Mrpl40Q9Z2Q5 Tmem219-204ENSMUST00000121532 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Mrpl40Q9Z2Q5 1700072B07Rik-201ENSMUST00000191141 445 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
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Mrpl40Q9Z2Q5 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Mrpl40Q9Z2Q5 Tmem164-202ENSMUST00000101198 4443 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
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Mrpl40Q9Z2Q5 Dsp-202ENSMUST00000127906 7761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
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Mrpl40Q9Z2Q5 Fam83e-201ENSMUST00000129507 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
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Mrpl40Q9Z2Q5 Galns-203ENSMUST00000212319 2111 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
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Mrpl40Q9Z2Q5 Sectm1a-203ENSMUST00000106119 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
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Mrpl40Q9Z2Q5 Rnf113a1-201ENSMUST00000046433 1223 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Mrpl40Q9Z2Q5 Nup37-201ENSMUST00000052355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Mrpl40Q9Z2Q5 Oaz1-ps-201ENSMUST00000052440 681 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Mrpl40Q9Z2Q5 Odf3l2-201ENSMUST00000095464 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Mrpl40Q9Z2Q5 BC001981-202ENSMUST00000191393 1545 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Mrpl40Q9Z2Q5 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Mrpl40Q9Z2Q5 Rbmx-203ENSMUST00000114730 2019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Mrpl40Q9Z2Q5 Ppp3cb-205ENSMUST00000161445 3298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Mrpl40Q9Z2Q5 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Mrpl40Q9Z2Q5 Gk5-202ENSMUST00000122383 4455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Mrpl40Q9Z2Q5 Ccdc162-203ENSMUST00000099932 2742 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Mrpl40Q9Z2Q5 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Mrpl40Q9Z2Q5 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Mrpl40Q9Z2Q5 Edem3-203ENSMUST00000188145 3262 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Mrpl40Q9Z2Q5 Dido1-207ENSMUST00000130986 4898 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Mrpl40Q9Z2Q5 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Mrpl40Q9Z2Q5 Sphk2-201ENSMUST00000072836 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Mrpl40Q9Z2Q5 Gpr107-201ENSMUST00000056433 6134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
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