Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2P8

Vamp5, Vesicle-associated membrane protein 5, mousemouse

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Length 102 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vamp5Q9Z2P8 Smad4-202ENSMUST00000114939 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Vamp5Q9Z2P8 9530077C05Rik-201ENSMUST00000058868 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Vamp5Q9Z2P8 Lrrc8c-201ENSMUST00000067924 6976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Vamp5Q9Z2P8 Aldh3a2-203ENSMUST00000108715 2578 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Vamp5Q9Z2P8 Fam234b-202ENSMUST00000111916 2927 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Vamp5Q9Z2P8 Sema7a-201ENSMUST00000043059 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Vamp5Q9Z2P8 Tnk2-205ENSMUST00000115124 4424 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Vamp5Q9Z2P8 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Vamp5Q9Z2P8 Mgat1-203ENSMUST00000109194 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Vamp5Q9Z2P8 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Vamp5Q9Z2P8 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Vamp5Q9Z2P8 Sv2a-201ENSMUST00000035371 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Vamp5Q9Z2P8 Dmp1-201ENSMUST00000066708 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Vamp5Q9Z2P8 Rai1-207ENSMUST00000171108 7125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Vamp5Q9Z2P8 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Vamp5Q9Z2P8 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Vamp5Q9Z2P8 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Vamp5Q9Z2P8 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Vamp5Q9Z2P8 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Vamp5Q9Z2P8 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Vamp5Q9Z2P8 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Vamp5Q9Z2P8 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Vamp5Q9Z2P8 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Vamp5Q9Z2P8 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Vamp5Q9Z2P8 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Vamp5Q9Z2P8 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Vamp5Q9Z2P8 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Vamp5Q9Z2P8 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Vamp5Q9Z2P8 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Vamp5Q9Z2P8 Gtf2ird1-224ENSMUST00000202280 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Vamp5Q9Z2P8 Mtmr10-201ENSMUST00000032736 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Vamp5Q9Z2P8 C230014O12Rik-201ENSMUST00000134921 2668 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Vamp5Q9Z2P8 Gm20465-201ENSMUST00000174768 1932 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Vamp5Q9Z2P8 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Vamp5Q9Z2P8 Alox8-202ENSMUST00000094078 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Vamp5Q9Z2P8 4930432E11Rik-202ENSMUST00000063585 10871 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Vamp5Q9Z2P8 Matn2-203ENSMUST00000226766 3252 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Vamp5Q9Z2P8 Pygo2-202ENSMUST00000107413 2911 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Vamp5Q9Z2P8 Accsl-201ENSMUST00000099690 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Vamp5Q9Z2P8 Ank3-201ENSMUST00000047061 2517 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Vamp5Q9Z2P8 Pogk-202ENSMUST00000128861 4848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Vamp5Q9Z2P8 Stard5-202ENSMUST00000117410 2832 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Vamp5Q9Z2P8 Tnn-202ENSMUST00000131919 3987 ntTSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Vamp5Q9Z2P8 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Vamp5Q9Z2P8 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Vamp5Q9Z2P8 Abcc10-201ENSMUST00000047970 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Vamp5Q9Z2P8 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Vamp5Q9Z2P8 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Vamp5Q9Z2P8 Ablim2-201ENSMUST00000054598 3564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Vamp5Q9Z2P8 Dag1-204ENSMUST00000191899 5662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Vamp5Q9Z2P8 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Vamp5Q9Z2P8 Srms-201ENSMUST00000016498 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Vamp5Q9Z2P8 Gm26616-202ENSMUST00000195676 3107 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Vamp5Q9Z2P8 Sirt3-210ENSMUST00000211179 1606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Vamp5Q9Z2P8 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Vamp5Q9Z2P8 Tmem86b-202ENSMUST00000205360 1344 ntTSL 2 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Vamp5Q9Z2P8 Gm9866-202ENSMUST00000182473 1882 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Vamp5Q9Z2P8 Phgdh-201ENSMUST00000065793 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Vamp5Q9Z2P8 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Vamp5Q9Z2P8 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Vamp5Q9Z2P8 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Vamp5Q9Z2P8 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Vamp5Q9Z2P8 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Vamp5Q9Z2P8 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Vamp5Q9Z2P8 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Vamp5Q9Z2P8 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Vamp5Q9Z2P8 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
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Vamp5Q9Z2P8 Dnmt3b-205ENSMUST00000103150 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
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Vamp5Q9Z2P8 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Vamp5Q9Z2P8 Mroh1-201ENSMUST00000092595 5111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
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Vamp5Q9Z2P8 Slc41a3-201ENSMUST00000032177 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Vamp5Q9Z2P8 Asap3-201ENSMUST00000047526 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Vamp5Q9Z2P8 Chd5-201ENSMUST00000005175 9122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Vamp5Q9Z2P8 Pi4kb-201ENSMUST00000072287 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Vamp5Q9Z2P8 Trim55-201ENSMUST00000029139 2595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Vamp5Q9Z2P8 Grm2-201ENSMUST00000023959 4711 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Vamp5Q9Z2P8 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Vamp5Q9Z2P8 Rxrg-204ENSMUST00000111386 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Vamp5Q9Z2P8 Ube2g1-201ENSMUST00000021148 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Vamp5Q9Z2P8 Pphln1-202ENSMUST00000068457 3816 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Vamp5Q9Z2P8 Grtp1-206ENSMUST00000210317 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Vamp5Q9Z2P8 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Vamp5Q9Z2P8 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Vamp5Q9Z2P8 Qrich2-201ENSMUST00000093909 2156 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Vamp5Q9Z2P8 Adcy8-201ENSMUST00000023007 6990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Vamp5Q9Z2P8 Triobp-203ENSMUST00000109689 7187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Vamp5Q9Z2P8 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Vamp5Q9Z2P8 Scn8a-208ENSMUST00000200963 5814 ntTSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Vamp5Q9Z2P8 Rubcn-202ENSMUST00000089684 5311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Vamp5Q9Z2P8 Cdc37l1-208ENSMUST00000225310 4079 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Vamp5Q9Z2P8 Slc39a8-205ENSMUST00000167390 3533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Vamp5Q9Z2P8 Myo18a-205ENSMUST00000100794 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Vamp5Q9Z2P8 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Vamp5Q9Z2P8 Slc6a8-201ENSMUST00000033752 3964 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Vamp5Q9Z2P8 Hexim1-201ENSMUST00000053063 3495 ntAPPRIS P1 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Vamp5Q9Z2P8 Capn2-201ENSMUST00000068505 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Vamp5Q9Z2P8 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
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