Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1P4

Lgr5, Leucine-rich repeat-containing G-protein coupled receptor 5, mousemouse

Predictions only

Length 907 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lgr5Q9Z1P4 Hsd17b11-202ENSMUST00000119025 2234 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Lgr5Q9Z1P4 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Lgr5Q9Z1P4 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Lgr5Q9Z1P4 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Lgr5Q9Z1P4 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Lgr5Q9Z1P4 Sgce-201ENSMUST00000004750 1703 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Lgr5Q9Z1P4 Gm13786-201ENSMUST00000122371 333 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Lgr5Q9Z1P4 Gm45692-201ENSMUST00000131138 557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Lgr5Q9Z1P4 Gm17077-201ENSMUST00000133179 279 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Lgr5Q9Z1P4 9330198N18Rik-201ENSMUST00000146702 1247 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Lgr5Q9Z1P4 Gm37933-201ENSMUST00000193964 981 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Lgr5Q9Z1P4 Sox2ot-205ENSMUST00000196795 754 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Lgr5Q9Z1P4 Gm8227-201ENSMUST00000223306 571 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Lgr5Q9Z1P4 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Lgr5Q9Z1P4 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Lgr5Q9Z1P4 Gm6169-201ENSMUST00000071118 1030 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Lgr5Q9Z1P4 Pnck-203ENSMUST00000114473 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Lgr5Q9Z1P4 Mutyh-201ENSMUST00000102699 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Lgr5Q9Z1P4 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Lgr5Q9Z1P4 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Lgr5Q9Z1P4 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Lgr5Q9Z1P4 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Lgr5Q9Z1P4 Mpi-201ENSMUST00000034856 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Lgr5Q9Z1P4 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Lgr5Q9Z1P4 AC139350.1-201ENSMUST00000227064 1594 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Lgr5Q9Z1P4 Mcoln2-201ENSMUST00000011152 2520 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Lgr5Q9Z1P4 Irak1-204ENSMUST00000114352 3825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Lgr5Q9Z1P4 Scrn3-202ENSMUST00000112050 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Lgr5Q9Z1P4 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Lgr5Q9Z1P4 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Lgr5Q9Z1P4 Rad9a-201ENSMUST00000025740 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Lgr5Q9Z1P4 Tmem254b-202ENSMUST00000100806 1108 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Lgr5Q9Z1P4 Tmem254a-201ENSMUST00000100811 1108 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Lgr5Q9Z1P4 Gm22323-201ENSMUST00000103832 109 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Lgr5Q9Z1P4 Styxl1-202ENSMUST00000111161 963 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Lgr5Q9Z1P4 Pole-203ENSMUST00000112482 747 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Lgr5Q9Z1P4 Fam71f2-201ENSMUST00000115286 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Lgr5Q9Z1P4 4930579D09Rik-201ENSMUST00000132321 469 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Lgr5Q9Z1P4 Tmbim6-206ENSMUST00000161250 1148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Lgr5Q9Z1P4 1700080E11Rik-202ENSMUST00000190661 682 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Lgr5Q9Z1P4 Gm36937-201ENSMUST00000192957 429 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Lgr5Q9Z1P4 Gm37259-201ENSMUST00000193903 849 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Lgr5Q9Z1P4 Gm38341-201ENSMUST00000195357 515 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Lgr5Q9Z1P4 Gm18056-201ENSMUST00000207670 568 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Lgr5Q9Z1P4 Gm18061-201ENSMUST00000208350 562 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Lgr5Q9Z1P4 Gm18063-201ENSMUST00000208529 568 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Lgr5Q9Z1P4 Gm18052-201ENSMUST00000208750 559 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Lgr5Q9Z1P4 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Lgr5Q9Z1P4 AC173210.1-201ENSMUST00000222341 1131 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Lgr5Q9Z1P4 Cldnd2-201ENSMUST00000040227 664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Lgr5Q9Z1P4 Chchd1-201ENSMUST00000071215 616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Lgr5Q9Z1P4 AC096628.2-201ENSMUST00000225443 1413 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Lgr5Q9Z1P4 G6pc3-201ENSMUST00000070334 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Lgr5Q9Z1P4 Gm26604-201ENSMUST00000180926 1766 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Lgr5Q9Z1P4 Dnajb4-204ENSMUST00000144950 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Lgr5Q9Z1P4 Ap5z1-202ENSMUST00000196055 2965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Lgr5Q9Z1P4 Ankrd6-202ENSMUST00000084748 4354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Lgr5Q9Z1P4 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Lgr5Q9Z1P4 Wdr53-201ENSMUST00000023474 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Lgr5Q9Z1P4 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Lgr5Q9Z1P4 Evl-203ENSMUST00000109854 1870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Lgr5Q9Z1P4 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lgr5Q9Z1P4 Fpr1-201ENSMUST00000061516 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lgr5Q9Z1P4 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lgr5Q9Z1P4 Prg4-207ENSMUST00000162367 1480 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lgr5Q9Z1P4 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lgr5Q9Z1P4 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lgr5Q9Z1P4 Ap2m1-201ENSMUST00000007216 2937 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lgr5Q9Z1P4 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lgr5Q9Z1P4 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lgr5Q9Z1P4 Mypopos-201ENSMUST00000124897 560 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lgr5Q9Z1P4 4930502A04Rik-201ENSMUST00000214059 865 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lgr5Q9Z1P4 Pfdn1-201ENSMUST00000025204 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lgr5Q9Z1P4 Krtap4-7-201ENSMUST00000055121 984 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lgr5Q9Z1P4 Gm16372-201ENSMUST00000073088 450 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Lgr5Q9Z1P4 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lgr5Q9Z1P4 Ccdc190-201ENSMUST00000094348 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lgr5Q9Z1P4 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lgr5Q9Z1P4 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lgr5Q9Z1P4 Yap1-201ENSMUST00000065353 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lgr5Q9Z1P4 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lgr5Q9Z1P4 Uckl1-201ENSMUST00000057816 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lgr5Q9Z1P4 Rlbp1-201ENSMUST00000053718 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lgr5Q9Z1P4 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lgr5Q9Z1P4 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lgr5Q9Z1P4 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lgr5Q9Z1P4 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lgr5Q9Z1P4 Nr4a2-203ENSMUST00000112629 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lgr5Q9Z1P4 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lgr5Q9Z1P4 Gm26770-201ENSMUST00000180586 2237 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lgr5Q9Z1P4 4931406C07Rik-208ENSMUST00000216955 1750 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lgr5Q9Z1P4 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lgr5Q9Z1P4 Samd4b-204ENSMUST00000208199 4391 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lgr5Q9Z1P4 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lgr5Q9Z1P4 Xlr-202ENSMUST00000067782 1860 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lgr5Q9Z1P4 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lgr5Q9Z1P4 Gm8994-202ENSMUST00000204530 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lgr5Q9Z1P4 Gemin2-201ENSMUST00000021379 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lgr5Q9Z1P4 Krt17-201ENSMUST00000080893 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lgr5Q9Z1P4 Timm10-202ENSMUST00000111631 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 78.3 ms