Protein–RNA interactions for Protein: Q9WU22

Ptpn4, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 4, mousemouse

Predictions only

Length 926 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptpn4Q9WU22 Sp2-201ENSMUST00000062652 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ptpn4Q9WU22 Hid1-202ENSMUST00000106542 3276 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ptpn4Q9WU22 Nectin4-202ENSMUST00000094325 3245 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ptpn4Q9WU22 Pdgfra-205ENSMUST00000201711 4088 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ptpn4Q9WU22 Dhx37-201ENSMUST00000169485 4760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ptpn4Q9WU22 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ptpn4Q9WU22 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ptpn4Q9WU22 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ptpn4Q9WU22 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Ptpn4Q9WU22 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Ptpn4Q9WU22 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ptpn4Q9WU22 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ptpn4Q9WU22 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ptpn4Q9WU22 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Ptpn4Q9WU22 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ptpn4Q9WU22 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ptpn4Q9WU22 AC123645.1-201ENSMUST00000228469 605 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Ptpn4Q9WU22 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ptpn4Q9WU22 Fktn-204ENSMUST00000221657 6241 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ptpn4Q9WU22 Cops7b-202ENSMUST00000121534 5383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ptpn4Q9WU22 Lrpprc-201ENSMUST00000112308 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ptpn4Q9WU22 Pus7-201ENSMUST00000119946 3407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ptpn4Q9WU22 Pik3cd-201ENSMUST00000038859 4905 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ptpn4Q9WU22 Pigq-209ENSMUST00000140304 1835 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ptpn4Q9WU22 Smarca4-204ENSMUST00000174008 5405 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ptpn4Q9WU22 Anapc11-201ENSMUST00000026128 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ptpn4Q9WU22 Rab11fip1-201ENSMUST00000033878 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ptpn4Q9WU22 Slc29a2-201ENSMUST00000025826 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ptpn4Q9WU22 Prkce-201ENSMUST00000097274 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ptpn4Q9WU22 Mpp3-204ENSMUST00000107168 3094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ptpn4Q9WU22 AC125108.1-201ENSMUST00000218986 2330 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Ptpn4Q9WU22 Slitrk3-201ENSMUST00000059407 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ptpn4Q9WU22 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ptpn4Q9WU22 Nars-201ENSMUST00000025483 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ptpn4Q9WU22 Trim27-205ENSMUST00000221464 1400 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ptpn4Q9WU22 Naa15-205ENSMUST00000193266 7480 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ptpn4Q9WU22 Klhl26-205ENSMUST00000210250 2974 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ptpn4Q9WU22 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ptpn4Q9WU22 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ptpn4Q9WU22 Sass6-206ENSMUST00000198386 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ptpn4Q9WU22 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ptpn4Q9WU22 Trim15-201ENSMUST00000025329 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ptpn4Q9WU22 Spin1-201ENSMUST00000095797 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ptpn4Q9WU22 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ptpn4Q9WU22 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ptpn4Q9WU22 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Ptpn4Q9WU22 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ptpn4Q9WU22 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ptpn4Q9WU22 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ptpn4Q9WU22 Ins2-209ENSMUST00000210288 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ptpn4Q9WU22 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ptpn4Q9WU22 AC151828.1-201ENSMUST00000219552 661 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ptpn4Q9WU22 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ptpn4Q9WU22 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ptpn4Q9WU22 Spidr-201ENSMUST00000040248 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ptpn4Q9WU22 Ccdc162-208ENSMUST00000179614 2739 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ptpn4Q9WU22 Olfr667-202ENSMUST00000217177 2695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ptpn4Q9WU22 Oasl1-202ENSMUST00000112143 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ptpn4Q9WU22 Mnt-201ENSMUST00000000291 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ptpn4Q9WU22 Dnmt3b-205ENSMUST00000103150 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ptpn4Q9WU22 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ptpn4Q9WU22 Camk2b-203ENSMUST00000066431 1603 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ptpn4Q9WU22 Adcyap1r1-206ENSMUST00000167234 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ptpn4Q9WU22 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ptpn4Q9WU22 Ephx2-201ENSMUST00000070515 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ptpn4Q9WU22 Hif3a-202ENSMUST00000108492 6402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ptpn4Q9WU22 Abat-203ENSMUST00000115839 2414 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ptpn4Q9WU22 Nmral1-204ENSMUST00000120056 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ptpn4Q9WU22 Tjap1-203ENSMUST00000180283 2368 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ptpn4Q9WU22 Pag1-204ENSMUST00000161949 8256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ptpn4Q9WU22 Parp2-201ENSMUST00000036126 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ptpn4Q9WU22 Epha5-204ENSMUST00000113401 5158 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ptpn4Q9WU22 Asb10-202ENSMUST00000117900 1432 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ptpn4Q9WU22 Hsd3b7-201ENSMUST00000046863 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ptpn4Q9WU22 Aco1-201ENSMUST00000102973 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ptpn4Q9WU22 Foxb1-201ENSMUST00000071281 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ptpn4Q9WU22 Gm42480-201ENSMUST00000198434 2595 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Ptpn4Q9WU22 Chst4-202ENSMUST00000211894 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ptpn4Q9WU22 Nrf1-210ENSMUST00000115211 3295 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ptpn4Q9WU22 Tbc1d9b-201ENSMUST00000093138 4407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ptpn4Q9WU22 Mfn2-203ENSMUST00000105715 4043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ptpn4Q9WU22 Phf21a-206ENSMUST00000111292 2461 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ptpn4Q9WU22 Dhtkd1-202ENSMUST00000095147 5480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ptpn4Q9WU22 Dgcr14-201ENSMUST00000003621 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ptpn4Q9WU22 Gm26551-201ENSMUST00000181262 2432 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ptpn4Q9WU22 Slc6a4-202ENSMUST00000108402 2796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ptpn4Q9WU22 Actn4-201ENSMUST00000068045 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ptpn4Q9WU22 Matr3-206ENSMUST00000187389 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ptpn4Q9WU22 AC154747.3-201ENSMUST00000224471 3470 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Ptpn4Q9WU22 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ptpn4Q9WU22 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ptpn4Q9WU22 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ptpn4Q9WU22 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Ptpn4Q9WU22 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ptpn4Q9WU22 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ptpn4Q9WU22 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ptpn4Q9WU22 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ptpn4Q9WU22 Cep295nl-202ENSMUST00000168100 1602 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ptpn4Q9WU22 Ciz1-202ENSMUST00000113331 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ptpn4Q9WU22 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
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