Protein–RNA interactions for Protein: Q9QYF1

Rdh11, Retinol dehydrogenase 11, mousemouse

Predictions only

Length 316 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Rdh11Q9QYF1 Hcrtr1-201ENSMUST00000030562 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rdh11Q9QYF1 Slc39a8-202ENSMUST00000081978 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
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Rdh11Q9QYF1 Boll-202ENSMUST00000114423 1106 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
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Rdh11Q9QYF1 Gm11918-201ENSMUST00000121660 179 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Rdh11Q9QYF1 Gm14617-202ENSMUST00000144208 607 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rdh11Q9QYF1 Gm26600-201ENSMUST00000181637 1256 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
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Rdh11Q9QYF1 Gm38094-201ENSMUST00000195864 2978 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Rdh11Q9QYF1 Gm42722-201ENSMUST00000198855 940 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rdh11Q9QYF1 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
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