Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXD8

Limd1, LIM domain-containing protein 1, mousemouse

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Length 668 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Limd1Q9QXD8 Pef1-201ENSMUST00000030563 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Limd1Q9QXD8 Ccne2-202ENSMUST00000108324 2908 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Limd1Q9QXD8 Bend7-201ENSMUST00000056914 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Limd1Q9QXD8 Zfp354c-201ENSMUST00000000632 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Limd1Q9QXD8 Smarcb1-201ENSMUST00000000925 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Limd1Q9QXD8 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Limd1Q9QXD8 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Limd1Q9QXD8 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Limd1Q9QXD8 Syvn1-201ENSMUST00000025723 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Limd1Q9QXD8 Rprd1b-202ENSMUST00000103123 4504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Limd1Q9QXD8 Arl5c-202ENSMUST00000107563 823 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Limd1Q9QXD8 Htr2c-203ENSMUST00000112831 809 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Limd1Q9QXD8 Rab15-204ENSMUST00000122419 856 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Limd1Q9QXD8 Gm27206-201ENSMUST00000154038 979 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Limd1Q9QXD8 Oaz1-207ENSMUST00000180036 1044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Limd1Q9QXD8 Gm38144-201ENSMUST00000192790 465 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Limd1Q9QXD8 Trmt112-ps1-201ENSMUST00000202320 375 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Limd1Q9QXD8 0610005C13Rik-202ENSMUST00000209510 671 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Limd1Q9QXD8 Gm29705-201ENSMUST00000212598 474 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Limd1Q9QXD8 Mcrip1-201ENSMUST00000034913 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Limd1Q9QXD8 Scgb3a2-201ENSMUST00000043803 842 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Limd1Q9QXD8 Rpl10l-201ENSMUST00000081908 1023 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Limd1Q9QXD8 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Limd1Q9QXD8 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Limd1Q9QXD8 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Limd1Q9QXD8 Dera-207ENSMUST00000203693 1446 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Limd1Q9QXD8 1300002E11Rik-202ENSMUST00000181780 1650 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Limd1Q9QXD8 Ulk3-201ENSMUST00000053230 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Limd1Q9QXD8 Gm13016-201ENSMUST00000126252 1720 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Limd1Q9QXD8 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Limd1Q9QXD8 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Limd1Q9QXD8 Gstt3-201ENSMUST00000001715 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Limd1Q9QXD8 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Limd1Q9QXD8 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Limd1Q9QXD8 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Limd1Q9QXD8 Rhox2f-201ENSMUST00000115173 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Limd1Q9QXD8 Gm5187-201ENSMUST00000117317 991 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Limd1Q9QXD8 Pigyl-202ENSMUST00000148088 676 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Limd1Q9QXD8 Tmem52-204ENSMUST00000178188 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Limd1Q9QXD8 Tmem52-205ENSMUST00000178238 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Limd1Q9QXD8 1700065I16Rik-202ENSMUST00000185477 813 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Limd1Q9QXD8 Dnm3os-203ENSMUST00000185878 557 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Limd1Q9QXD8 Gm36198-201ENSMUST00000217490 416 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Limd1Q9QXD8 Rhog-202ENSMUST00000106923 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Limd1Q9QXD8 Tex13c2-201ENSMUST00000197237 1834 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Limd1Q9QXD8 E230013L22Rik-201ENSMUST00000180408 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Limd1Q9QXD8 Gm15850-201ENSMUST00000134998 2049 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Limd1Q9QXD8 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Limd1Q9QXD8 Tuft1-203ENSMUST00000196655 2156 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Limd1Q9QXD8 Slc39a2-201ENSMUST00000047726 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Limd1Q9QXD8 Ociad2-205ENSMUST00000201908 2378 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Limd1Q9QXD8 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Limd1Q9QXD8 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Limd1Q9QXD8 Rufy3-203ENSMUST00000196894 3703 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Limd1Q9QXD8 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Limd1Q9QXD8 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Limd1Q9QXD8 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Limd1Q9QXD8 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Limd1Q9QXD8 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Limd1Q9QXD8 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Limd1Q9QXD8 Me2-201ENSMUST00000025439 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Limd1Q9QXD8 Gypc-202ENSMUST00000174000 2072 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Limd1Q9QXD8 Alkbh3os1-201ENSMUST00000028621 1549 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Limd1Q9QXD8 Vax2os-201ENSMUST00000123402 1435 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Limd1Q9QXD8 Gm9755-201ENSMUST00000032981 1356 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Limd1Q9QXD8 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Limd1Q9QXD8 Gm8213-201ENSMUST00000118191 441 ntBASIC15.04■□□□□ -0
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Limd1Q9QXD8 Tnni1-205ENSMUST00000148201 1150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
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Limd1Q9QXD8 Klk11-202ENSMUST00000171458 1260 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
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Limd1Q9QXD8 Mturn-202ENSMUST00000187701 503 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Limd1Q9QXD8 Gm44974-201ENSMUST00000206387 1279 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Limd1Q9QXD8 Gm9803-202ENSMUST00000216543 456 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Limd1Q9QXD8 Mrto4-ps1-201ENSMUST00000220565 721 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Limd1Q9QXD8 Aspdh-201ENSMUST00000035929 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Limd1Q9QXD8 Upk2-201ENSMUST00000047740 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Limd1Q9QXD8 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Limd1Q9QXD8 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Limd1Q9QXD8 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Limd1Q9QXD8 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Limd1Q9QXD8 Slc25a22-202ENSMUST00000106006 2277 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Limd1Q9QXD8 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Limd1Q9QXD8 Zfp853-201ENSMUST00000180336 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Limd1Q9QXD8 Per1-203ENSMUST00000102605 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Limd1Q9QXD8 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Limd1Q9QXD8 Neil1-203ENSMUST00000190245 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Limd1Q9QXD8 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Limd1Q9QXD8 Scg2-201ENSMUST00000049972 2515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Limd1Q9QXD8 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Limd1Q9QXD8 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Limd1Q9QXD8 Spatc1l-202ENSMUST00000105414 1060 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Limd1Q9QXD8 Ypel3-202ENSMUST00000106356 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Limd1Q9QXD8 Tagln2-201ENSMUST00000111228 716 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Limd1Q9QXD8 Cabp5-202ENSMUST00000117400 1258 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Limd1Q9QXD8 Ecscr-204ENSMUST00000133064 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
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