Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM13

Rabgef1, Rab5 GDP/GTP exchange factor, mousemouse

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Length 491 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rabgef1Q9JM13 Slco4a1-202ENSMUST00000038259 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Rabgef1Q9JM13 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Rabgef1Q9JM13 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Rabgef1Q9JM13 Map3k20-201ENSMUST00000090824 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Rabgef1Q9JM13 Pde4d-205ENSMUST00000119507 2163 ntTSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Rabgef1Q9JM13 Ddx27-205ENSMUST00000150571 2151 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Rabgef1Q9JM13 Prickle3-203ENSMUST00000129662 2376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Rabgef1Q9JM13 Hnf1b-201ENSMUST00000021016 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Rabgef1Q9JM13 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Rabgef1Q9JM13 Grb10-201ENSMUST00000093321 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Rabgef1Q9JM13 Mier3-203ENSMUST00000109272 5279 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Rabgef1Q9JM13 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Rabgef1Q9JM13 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Rabgef1Q9JM13 Tcf4-248ENSMUST00000202354 2120 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Rabgef1Q9JM13 Tcf4-257ENSMUST00000202772 2125 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Rabgef1Q9JM13 Zfp94-201ENSMUST00000032673 2529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Rabgef1Q9JM13 Bcas3-201ENSMUST00000074875 2814 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Rabgef1Q9JM13 Tmem41b-201ENSMUST00000094097 3840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Rabgef1Q9JM13 Slitrk3-201ENSMUST00000059407 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Rabgef1Q9JM13 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Rabgef1Q9JM13 1600002D24Rik-202ENSMUST00000136744 1854 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Rabgef1Q9JM13 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Rabgef1Q9JM13 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Rabgef1Q9JM13 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Rabgef1Q9JM13 Lcn5-202ENSMUST00000100312 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Rabgef1Q9JM13 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Rabgef1Q9JM13 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Rabgef1Q9JM13 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
Rabgef1Q9JM13 AI463170-203ENSMUST00000219353 430 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Rabgef1Q9JM13 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Rabgef1Q9JM13 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Rabgef1Q9JM13 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Rabgef1Q9JM13 Colgalt1-201ENSMUST00000047903 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Rabgef1Q9JM13 Gtf2ird1-212ENSMUST00000200944 3133 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Rabgef1Q9JM13 Mllt6-202ENSMUST00000107586 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Rabgef1Q9JM13 Rab11fip1-202ENSMUST00000054212 7965 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Rabgef1Q9JM13 0610010F05Rik-208ENSMUST00000180260 4128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Rabgef1Q9JM13 Hmga2-203ENSMUST00000159699 3810 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Rabgef1Q9JM13 Lhx1-201ENSMUST00000018842 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Rabgef1Q9JM13 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Rabgef1Q9JM13 Il7-205ENSMUST00000194279 4858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Rabgef1Q9JM13 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Rabgef1Q9JM13 Smim13-201ENSMUST00000165561 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Rabgef1Q9JM13 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC14.15□□□□□ -0.15
Rabgef1Q9JM13 Snx22-201ENSMUST00000044711 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Rabgef1Q9JM13 Adk-201ENSMUST00000045376 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Rabgef1Q9JM13 Pex2-202ENSMUST00000071280 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Rabgef1Q9JM13 Edrf1-202ENSMUST00000128901 4380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Rabgef1Q9JM13 Dok7-203ENSMUST00000114270 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Rabgef1Q9JM13 Pja1-202ENSMUST00000113790 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Rabgef1Q9JM13 Dhx37-201ENSMUST00000169485 4760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Rabgef1Q9JM13 D630014O11Rik-201ENSMUST00000160562 3019 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Rabgef1Q9JM13 Gm9754-201ENSMUST00000031305 3004 ntTSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Rabgef1Q9JM13 Adcyap1r1-202ENSMUST00000070756 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Rabgef1Q9JM13 Socs5-201ENSMUST00000041369 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Rabgef1Q9JM13 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Rabgef1Q9JM13 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Rabgef1Q9JM13 Hist1h2br-202ENSMUST00000110476 381 ntAPPRIS P1 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Rabgef1Q9JM13 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Rabgef1Q9JM13 Gm27437-201ENSMUST00000183429 107 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
Rabgef1Q9JM13 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Rabgef1Q9JM13 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Rabgef1Q9JM13 Ino80e-214ENSMUST00000206349 883 ntTSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Rabgef1Q9JM13 Gm34030-202ENSMUST00000211434 1126 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Rabgef1Q9JM13 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Rabgef1Q9JM13 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Rabgef1Q9JM13 Hist1h2bq-201ENSMUST00000078156 381 ntAPPRIS P1 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Rabgef1Q9JM13 Pla2g5-204ENSMUST00000102513 2289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Rabgef1Q9JM13 Plcd1-203ENSMUST00000214470 2706 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Rabgef1Q9JM13 Lrrc17-201ENSMUST00000035651 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Rabgef1Q9JM13 Noto-201ENSMUST00000089578 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Rabgef1Q9JM13 Ctbs-202ENSMUST00000061937 2892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Rabgef1Q9JM13 Micu1-204ENSMUST00000165563 2442 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Rabgef1Q9JM13 Ppp1r13l-201ENSMUST00000047621 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Rabgef1Q9JM13 Otx2-209ENSMUST00000226501 2592 ntAPPRIS P1 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Rabgef1Q9JM13 Mtdh-201ENSMUST00000022865 6919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Rabgef1Q9JM13 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Rabgef1Q9JM13 Dusp13-202ENSMUST00000119866 1342 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Rabgef1Q9JM13 Wnt7a-201ENSMUST00000032180 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Rabgef1Q9JM13 Gm44241-201ENSMUST00000203230 1662 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
Rabgef1Q9JM13 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Rabgef1Q9JM13 Vav1-203ENSMUST00000112870 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Rabgef1Q9JM13 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Rabgef1Q9JM13 Cfap69-201ENSMUST00000054865 4956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Rabgef1Q9JM13 Rab11fip1-201ENSMUST00000033878 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Rabgef1Q9JM13 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Rabgef1Q9JM13 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Rabgef1Q9JM13 Blzf1-203ENSMUST00000120447 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Rabgef1Q9JM13 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Rabgef1Q9JM13 Gm15747-202ENSMUST00000151096 524 ntTSL 3 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Rabgef1Q9JM13 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Rabgef1Q9JM13 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Rabgef1Q9JM13 AC125206.2-201ENSMUST00000217454 574 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
Rabgef1Q9JM13 AC140375.2-201ENSMUST00000225283 584 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
Rabgef1Q9JM13 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Rabgef1Q9JM13 Ubr7-201ENSMUST00000046404 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Rabgef1Q9JM13 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Rabgef1Q9JM13 Rfx1-204ENSMUST00000211046 3677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Rabgef1Q9JM13 Zfp354a-202ENSMUST00000102766 2592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Rabgef1Q9JM13 Apaf1-207ENSMUST00000161987 2710 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
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