Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLB4

Cubn, Cubilin, mousemouse

Predictions only

Length 3,623 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CubnQ9JLB4 Gm19353-201ENSMUST00000184561 445 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
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CubnQ9JLB4 Myl6-205ENSMUST00000217969 608 ntTSL 2 BASIC10.31□□□□□ -0.76
CubnQ9JLB4 Ndufb4-201ENSMUST00000023514 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
CubnQ9JLB4 1700001J03Rik-201ENSMUST00000073721 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
CubnQ9JLB4 Pianp-207ENSMUST00000162170 2053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
CubnQ9JLB4 Txnrd3-201ENSMUST00000000828 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
CubnQ9JLB4 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
CubnQ9JLB4 Pcca-201ENSMUST00000038374 2592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
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CubnQ9JLB4 Elp4-202ENSMUST00000122965 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
CubnQ9JLB4 Set-202ENSMUST00000102866 2824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
CubnQ9JLB4 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
CubnQ9JLB4 Tekt2-201ENSMUST00000030658 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
CubnQ9JLB4 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
CubnQ9JLB4 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
CubnQ9JLB4 Nos1ap-202ENSMUST00000160456 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
CubnQ9JLB4 Mks1-201ENSMUST00000038196 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
CubnQ9JLB4 3110056K07Rik-202ENSMUST00000136690 1063 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
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CubnQ9JLB4 AC127270.1-201ENSMUST00000221441 491 ntTSL 3 BASIC10.31□□□□□ -0.76
CubnQ9JLB4 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
CubnQ9JLB4 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
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CubnQ9JLB4 Egr2-203ENSMUST00000127820 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
CubnQ9JLB4 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
CubnQ9JLB4 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
CubnQ9JLB4 Ctbp2-209ENSMUST00000166439 1997 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
CubnQ9JLB4 Gm17767-201ENSMUST00000189410 1470 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
CubnQ9JLB4 Nmral1-202ENSMUST00000079130 1459 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
CubnQ9JLB4 Pgbd5-203ENSMUST00000136892 1739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
CubnQ9JLB4 Gars-201ENSMUST00000003572 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
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CubnQ9JLB4 Gm11568-201ENSMUST00000107434 1145 ntAPPRIS P1 BASIC10.3□□□□□ -0.76
CubnQ9JLB4 Sgsm1-203ENSMUST00000112324 1102 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
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CubnQ9JLB4 Pmvk-203ENSMUST00000184515 1156 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
CubnQ9JLB4 AC099645.1-201ENSMUST00000226476 1105 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
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CubnQ9JLB4 Slc39a8-201ENSMUST00000029810 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
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CubnQ9JLB4 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
CubnQ9JLB4 Zfp575-201ENSMUST00000094705 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
CubnQ9JLB4 Rpl15-204ENSMUST00000112598 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
CubnQ9JLB4 Gm11831-201ENSMUST00000141538 629 ntTSL 3 BASIC10.3□□□□□ -0.76
CubnQ9JLB4 Gm15395-201ENSMUST00000153724 702 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
CubnQ9JLB4 Gm31256-201ENSMUST00000194705 506 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
CubnQ9JLB4 Gm32468-201ENSMUST00000214199 1040 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
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CubnQ9JLB4 Cox10-201ENSMUST00000049091 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
CubnQ9JLB4 Cabp7-201ENSMUST00000009219 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
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CubnQ9JLB4 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
CubnQ9JLB4 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
CubnQ9JLB4 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
CubnQ9JLB4 Ormdl1-201ENSMUST00000027266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
CubnQ9JLB4 9030407P20Rik-201ENSMUST00000180933 2310 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
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CubnQ9JLB4 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
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CubnQ9JLB4 Pomgnt1-201ENSMUST00000106494 2226 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
CubnQ9JLB4 Gm16046-203ENSMUST00000150889 1001 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
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CubnQ9JLB4 Polr2i-201ENSMUST00000019882 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
CubnQ9JLB4 9530020I12Rik-203ENSMUST00000219371 819 ntTSL 3 BASIC10.3□□□□□ -0.76
CubnQ9JLB4 Gm32141-201ENSMUST00000220189 488 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
CubnQ9JLB4 Gm33115-201ENSMUST00000220913 743 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
CubnQ9JLB4 Gm40576-201ENSMUST00000221773 1152 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
CubnQ9JLB4 AC161537.1-201ENSMUST00000226199 1015 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
CubnQ9JLB4 Rbp2-201ENSMUST00000035029 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
CubnQ9JLB4 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
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CubnQ9JLB4 Gm43908-201ENSMUST00000205074 1472 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
CubnQ9JLB4 Slc6a9-209ENSMUST00000163288 2107 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
CubnQ9JLB4 Rinl-206ENSMUST00000209035 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
CubnQ9JLB4 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
CubnQ9JLB4 Rec8-201ENSMUST00000002395 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
CubnQ9JLB4 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
CubnQ9JLB4 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
CubnQ9JLB4 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
CubnQ9JLB4 Tufm-201ENSMUST00000098048 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
CubnQ9JLB4 Ighv5-2-201ENSMUST00000103442 350 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
CubnQ9JLB4 Pla2g10-202ENSMUST00000115807 964 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
CubnQ9JLB4 Gm11930-201ENSMUST00000117788 190 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
CubnQ9JLB4 Gm26185-201ENSMUST00000157692 266 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
CubnQ9JLB4 Gm25043-201ENSMUST00000158604 212 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
CubnQ9JLB4 Coa3-202ENSMUST00000168089 291 ntTSL 3 BASIC10.29□□□□□ -0.76
CubnQ9JLB4 Gm9211-201ENSMUST00000182882 975 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
CubnQ9JLB4 Ovol3-201ENSMUST00000189482 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.8 ms