Protein–RNA interactions for Protein: Q9ES97

Rtn3, Reticulon-3, mousemouse

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Length 964 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rtn3Q9ES97 Cyp11a1-201ENSMUST00000034874 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rtn3Q9ES97 Tmem131l-202ENSMUST00000191758 5555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rtn3Q9ES97 Pnck-201ENSMUST00000002087 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rtn3Q9ES97 Tmem269-202ENSMUST00000212054 1504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rtn3Q9ES97 Yes1-201ENSMUST00000072311 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rtn3Q9ES97 Map7d1-202ENSMUST00000106132 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rtn3Q9ES97 Tcf12-201ENSMUST00000034755 4621 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rtn3Q9ES97 Metap2-206ENSMUST00000180840 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rtn3Q9ES97 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rtn3Q9ES97 Pfkfb3-212ENSMUST00000170196 2163 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rtn3Q9ES97 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rtn3Q9ES97 Sirt5-207ENSMUST00000221515 1793 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rtn3Q9ES97 Eno1b-201ENSMUST00000076155 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rtn3Q9ES97 Sipa1-201ENSMUST00000071857 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rtn3Q9ES97 Gm38346-201ENSMUST00000192379 2639 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Rtn3Q9ES97 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rtn3Q9ES97 Gm28230-201ENSMUST00000053932 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rtn3Q9ES97 Zfp367-201ENSMUST00000059817 3532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rtn3Q9ES97 Gm42928-201ENSMUST00000197338 3339 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Rtn3Q9ES97 Krt26-201ENSMUST00000100482 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rtn3Q9ES97 Osbpl9-202ENSMUST00000084366 3134 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rtn3Q9ES97 Rabep2-201ENSMUST00000106405 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rtn3Q9ES97 Sirt3-210ENSMUST00000211179 1606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rtn3Q9ES97 Eloa-201ENSMUST00000030427 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rtn3Q9ES97 Pfkl-201ENSMUST00000020522 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rtn3Q9ES97 Kansl2-ps-201ENSMUST00000181818 1461 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Rtn3Q9ES97 Col6a2-202ENSMUST00000105413 4653 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rtn3Q9ES97 Sesn3-207ENSMUST00000209187 1700 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rtn3Q9ES97 Crip3-202ENSMUST00000113465 1035 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rtn3Q9ES97 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
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Rtn3Q9ES97 2210408F21Rik-214ENSMUST00000155345 1022 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rtn3Q9ES97 Gm5108-201ENSMUST00000177891 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rtn3Q9ES97 Gm34866-201ENSMUST00000196146 515 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rtn3Q9ES97 Ighv8-14-201ENSMUST00000196781 358 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
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Rtn3Q9ES97 AI463170-203ENSMUST00000219353 430 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rtn3Q9ES97 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rtn3Q9ES97 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rtn3Q9ES97 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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Rtn3Q9ES97 Nrp2-204ENSMUST00000102822 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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Rtn3Q9ES97 Colgalt1-201ENSMUST00000047903 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rtn3Q9ES97 Fnbp1-209ENSMUST00000113562 4515 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rtn3Q9ES97 Ash2l-204ENSMUST00000110610 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rtn3Q9ES97 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rtn3Q9ES97 Ptbp2-201ENSMUST00000029780 3364 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rtn3Q9ES97 Fer-202ENSMUST00000038080 2365 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rtn3Q9ES97 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rtn3Q9ES97 Gad2-201ENSMUST00000028123 5744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rtn3Q9ES97 Spock2-201ENSMUST00000121820 5238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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Rtn3Q9ES97 Dlst-201ENSMUST00000053811 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
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Rtn3Q9ES97 Gdf10-201ENSMUST00000168727 5210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rtn3Q9ES97 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rtn3Q9ES97 Pla2g5-204ENSMUST00000102513 2289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rtn3Q9ES97 Art3-205ENSMUST00000120193 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rtn3Q9ES97 Vars-201ENSMUST00000087315 4137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rtn3Q9ES97 Edc4-201ENSMUST00000040254 4780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rtn3Q9ES97 Gm13848-201ENSMUST00000130777 2047 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rtn3Q9ES97 Alx1-205ENSMUST00000218282 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rtn3Q9ES97 Nr2f2-201ENSMUST00000032768 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rtn3Q9ES97 Ccser2-202ENSMUST00000090024 7509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rtn3Q9ES97 Ate1-202ENSMUST00000035458 4685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rtn3Q9ES97 Hoxd3-202ENSMUST00000111982 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rtn3Q9ES97 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rtn3Q9ES97 Slc7a7-209ENSMUST00000226753 2126 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rtn3Q9ES97 Cct6a-202ENSMUST00000201414 2454 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rtn3Q9ES97 Map2k7-206ENSMUST00000110998 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rtn3Q9ES97 Leo1-201ENSMUST00000048937 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rtn3Q9ES97 Sall4-202ENSMUST00000075044 2534 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rtn3Q9ES97 Sntb1-201ENSMUST00000039769 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rtn3Q9ES97 Ace3-201ENSMUST00000190995 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rtn3Q9ES97 Jazf1-201ENSMUST00000074541 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rtn3Q9ES97 Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rtn3Q9ES97 Top1mt-201ENSMUST00000000958 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rtn3Q9ES97 Ncor2-203ENSMUST00000111393 8661 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
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