Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER56

Capn12, Calpain-12, mousemouse

Predictions only

Length 720 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capn12Q9ER56 Mpp4-201ENSMUST00000066374 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Capn12Q9ER56 Mpp4-202ENSMUST00000078874 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Capn12Q9ER56 Tmem181b-ps-203ENSMUST00000188746 1626 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Capn12Q9ER56 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Capn12Q9ER56 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Capn12Q9ER56 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Capn12Q9ER56 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Capn12Q9ER56 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Capn12Q9ER56 Pbx2-205ENSMUST00000183827 1186 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Capn12Q9ER56 Gm43356-201ENSMUST00000196582 609 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Capn12Q9ER56 Gm44608-201ENSMUST00000206827 855 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Capn12Q9ER56 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Capn12Q9ER56 Arfgap1-205ENSMUST00000108862 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Capn12Q9ER56 Esrrb-202ENSMUST00000110203 2363 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Capn12Q9ER56 Efemp1-201ENSMUST00000020759 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Capn12Q9ER56 Ulk3-201ENSMUST00000053230 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Capn12Q9ER56 Gatad2a-206ENSMUST00000212478 3622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Capn12Q9ER56 Zfp57-211ENSMUST00000174524 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Capn12Q9ER56 Pak4-201ENSMUST00000032823 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Capn12Q9ER56 Sall4-201ENSMUST00000029061 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Capn12Q9ER56 Irak3-201ENSMUST00000020448 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Capn12Q9ER56 Tcirg1-201ENSMUST00000001801 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Capn12Q9ER56 Ppp1r13l-201ENSMUST00000047621 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Capn12Q9ER56 Sema6c-203ENSMUST00000107217 3595 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Capn12Q9ER56 Tcn2-204ENSMUST00000109990 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Capn12Q9ER56 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Capn12Q9ER56 Chrnd-202ENSMUST00000186373 2949 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Capn12Q9ER56 Rnf114-201ENSMUST00000078050 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Capn12Q9ER56 Kmt5c-203ENSMUST00000108583 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Capn12Q9ER56 Adam11-202ENSMUST00000103081 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Capn12Q9ER56 Aco1-201ENSMUST00000102973 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Capn12Q9ER56 Gm22065-201ENSMUST00000103753 110 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Capn12Q9ER56 Gm22066-201ENSMUST00000103761 110 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Capn12Q9ER56 Gm24932-201ENSMUST00000103763 110 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Capn12Q9ER56 Gm24115-201ENSMUST00000103799 110 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Capn12Q9ER56 Gm22190-201ENSMUST00000103827 110 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Capn12Q9ER56 Gm22191-201ENSMUST00000103831 110 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Capn12Q9ER56 Gm24721-201ENSMUST00000103849 110 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Capn12Q9ER56 Gm28018-201ENSMUST00000103869 110 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Capn12Q9ER56 Gm26399-201ENSMUST00000103937 110 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Capn12Q9ER56 Uqcrq-203ENSMUST00000109021 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Capn12Q9ER56 Gm5566-201ENSMUST00000116118 459 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Capn12Q9ER56 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Capn12Q9ER56 Mir1897-201ENSMUST00000122581 272 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Capn12Q9ER56 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Capn12Q9ER56 Rpl27a-203ENSMUST00000143107 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Capn12Q9ER56 3110053B16Rik-204ENSMUST00000145605 575 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Capn12Q9ER56 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Capn12Q9ER56 Gm25349-201ENSMUST00000177728 110 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
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Capn12Q9ER56 Gm25871-201ENSMUST00000177816 110 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Capn12Q9ER56 Gm24752-201ENSMUST00000178240 110 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Capn12Q9ER56 Gm24496-201ENSMUST00000178287 110 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Capn12Q9ER56 Gm25649-201ENSMUST00000178476 110 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Capn12Q9ER56 Gm25548-201ENSMUST00000178681 110 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Capn12Q9ER56 Gm23147-201ENSMUST00000178841 110 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
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Capn12Q9ER56 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Capn12Q9ER56 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Capn12Q9ER56 Nup205-204ENSMUST00000201374 6411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Capn12Q9ER56 Plch2-208ENSMUST00000145662 1818 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Capn12Q9ER56 Golim4-208ENSMUST00000167078 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Capn12Q9ER56 Ankrd34b-201ENSMUST00000061594 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Capn12Q9ER56 Hspa4-201ENSMUST00000020630 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Capn12Q9ER56 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Capn12Q9ER56 Eif1ad-201ENSMUST00000025759 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Capn12Q9ER56 Hid1-201ENSMUST00000044152 3236 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Capn12Q9ER56 Gm40765-201ENSMUST00000218612 1469 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Capn12Q9ER56 Esyt3-201ENSMUST00000042158 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Capn12Q9ER56 Klhl15-201ENSMUST00000096369 3944 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Capn12Q9ER56 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Capn12Q9ER56 Gm9920-204ENSMUST00000148544 2752 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Capn12Q9ER56 Maged2-203ENSMUST00000112699 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Capn12Q9ER56 Lrrc17-201ENSMUST00000035651 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Capn12Q9ER56 Camk2b-203ENSMUST00000066431 1603 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Capn12Q9ER56 Ctgf-201ENSMUST00000020171 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Capn12Q9ER56 Dda1-206ENSMUST00000138892 1738 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Capn12Q9ER56 Gsdmd-201ENSMUST00000023238 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Capn12Q9ER56 Alx4-202ENSMUST00000111254 7056 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Capn12Q9ER56 Atp9a-204ENSMUST00000109177 3456 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
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