Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCT6

Bap18, Chromatin complexes subunit BAP18, mousemouse

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Length 171 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bap18Q9DCT6 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Bap18Q9DCT6 H3f3b-202ENSMUST00000106454 2514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Bap18Q9DCT6 Galnt6-202ENSMUST00000159715 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Bap18Q9DCT6 Spock1-206ENSMUST00000189373 3128 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Bap18Q9DCT6 Nr2c2-201ENSMUST00000113460 7647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Bap18Q9DCT6 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Bap18Q9DCT6 Gm4782-201ENSMUST00000168705 2046 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Bap18Q9DCT6 Capn3-203ENSMUST00000090028 2640 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Bap18Q9DCT6 Ppara-202ENSMUST00000109422 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Bap18Q9DCT6 Myh3-201ENSMUST00000007301 5992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Bap18Q9DCT6 Mtmr2-201ENSMUST00000034396 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Bap18Q9DCT6 4921504A21Rik-201ENSMUST00000180594 2156 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Bap18Q9DCT6 9230110C19Rik-201ENSMUST00000065291 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Bap18Q9DCT6 Ercc5-201ENSMUST00000027214 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Bap18Q9DCT6 Cdc45-201ENSMUST00000000028 2143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Bap18Q9DCT6 Gm8337-201ENSMUST00000187358 1938 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Bap18Q9DCT6 Gm34006-202ENSMUST00000216467 1918 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Bap18Q9DCT6 Gm36356-201ENSMUST00000209224 2277 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Bap18Q9DCT6 2310007B03Rik-201ENSMUST00000043718 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Bap18Q9DCT6 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Bap18Q9DCT6 Bach2-202ENSMUST00000108180 8882 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Bap18Q9DCT6 Kcnk2-202ENSMUST00000110920 3572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Bap18Q9DCT6 2310022A10Rik-204ENSMUST00000187032 1871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Bap18Q9DCT6 Tcf4-204ENSMUST00000114978 2437 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Bap18Q9DCT6 Gm20700-201ENSMUST00000176749 2206 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Bap18Q9DCT6 Ppp4r3b-201ENSMUST00000020755 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Bap18Q9DCT6 Cckar-201ENSMUST00000031093 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Bap18Q9DCT6 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
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Bap18Q9DCT6 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Bap18Q9DCT6 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Bap18Q9DCT6 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Bap18Q9DCT6 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Bap18Q9DCT6 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Bap18Q9DCT6 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Bap18Q9DCT6 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Bap18Q9DCT6 1700120B22Rik-201ENSMUST00000054837 464 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Bap18Q9DCT6 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Bap18Q9DCT6 Atp8a1-201ENSMUST00000037380 8178 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Bap18Q9DCT6 Hlf-201ENSMUST00000004051 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Bap18Q9DCT6 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Bap18Q9DCT6 Bud13-201ENSMUST00000074957 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Bap18Q9DCT6 Actr8-204ENSMUST00000224797 2328 ntAPPRIS P1 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Bap18Q9DCT6 Nhlh2-203ENSMUST00000198675 3943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Bap18Q9DCT6 Il13ra1-201ENSMUST00000033418 3712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Bap18Q9DCT6 Asap1-217ENSMUST00000177371 6164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Bap18Q9DCT6 Zfp422-202ENSMUST00000079749 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Bap18Q9DCT6 Gm45751-201ENSMUST00000210185 1573 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Bap18Q9DCT6 Corin-201ENSMUST00000005352 4862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Bap18Q9DCT6 Myh14-203ENSMUST00000107900 6400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Bap18Q9DCT6 Gpd2-207ENSMUST00000169687 5745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Bap18Q9DCT6 Ints13-201ENSMUST00000032427 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Bap18Q9DCT6 Oxr1-204ENSMUST00000110297 4596 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Bap18Q9DCT6 4930453N24Rik-201ENSMUST00000076991 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Bap18Q9DCT6 Gsn-201ENSMUST00000028239 2653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Bap18Q9DCT6 Cnot3-201ENSMUST00000038913 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Bap18Q9DCT6 Pyroxd1-201ENSMUST00000041852 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Bap18Q9DCT6 Vps4b-201ENSMUST00000094646 4633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Bap18Q9DCT6 Gm45643-201ENSMUST00000211364 1484 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Bap18Q9DCT6 Lgals12-202ENSMUST00000099729 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Bap18Q9DCT6 Alox12e-201ENSMUST00000019051 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
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Bap18Q9DCT6 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
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Bap18Q9DCT6 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
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Bap18Q9DCT6 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
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Bap18Q9DCT6 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Bap18Q9DCT6 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Bap18Q9DCT6 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Bap18Q9DCT6 Gm30934-201ENSMUST00000215803 815 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Bap18Q9DCT6 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Bap18Q9DCT6 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Bap18Q9DCT6 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Bap18Q9DCT6 Kdm3a-214ENSMUST00000207023 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Bap18Q9DCT6 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Bap18Q9DCT6 Nfasc-207ENSMUST00000187861 4927 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Bap18Q9DCT6 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Bap18Q9DCT6 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Bap18Q9DCT6 Rasl12-201ENSMUST00000085453 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Bap18Q9DCT6 Fam187a-201ENSMUST00000100369 1563 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Bap18Q9DCT6 Zfp57-201ENSMUST00000069250 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Bap18Q9DCT6 Naaladl1-201ENSMUST00000044451 2491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Bap18Q9DCT6 Nup205-204ENSMUST00000201374 6411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Bap18Q9DCT6 Slc6a8-201ENSMUST00000033752 3964 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Bap18Q9DCT6 Pnck-201ENSMUST00000002087 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Bap18Q9DCT6 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Bap18Q9DCT6 Lmbr1l-202ENSMUST00000109127 2548 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Bap18Q9DCT6 Map2k6-202ENSMUST00000100260 2088 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Bap18Q9DCT6 Gm37105-201ENSMUST00000192251 2085 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Bap18Q9DCT6 Gnat2-201ENSMUST00000058669 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Bap18Q9DCT6 Gm18263-201ENSMUST00000220846 1928 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.5 ms