Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA21

Smco2, Single-pass membrane and coiled-coil domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 347 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smco2Q9DA21 Wdr13-205ENSMUST00000130832 4374 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Smco2Q9DA21 Edc4-201ENSMUST00000040254 4780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Smco2Q9DA21 Trim15-201ENSMUST00000025329 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Smco2Q9DA21 Lrp8os2-204ENSMUST00000188737 3078 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Smco2Q9DA21 Cpne6-202ENSMUST00000163767 2004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Smco2Q9DA21 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Smco2Q9DA21 Cacna1g-203ENSMUST00000103166 8104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Smco2Q9DA21 Spns1-201ENSMUST00000032994 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Smco2Q9DA21 Cd3eap-201ENSMUST00000047036 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Smco2Q9DA21 Skida1-202ENSMUST00000091420 4376 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Smco2Q9DA21 Gm42878-202ENSMUST00000200170 4783 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Smco2Q9DA21 Gm10369-201ENSMUST00000100641 1148 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Smco2Q9DA21 Plod1-202ENSMUST00000105712 1059 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Smco2Q9DA21 Ggt6-203ENSMUST00000108499 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Smco2Q9DA21 Gm15678-201ENSMUST00000117573 960 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Smco2Q9DA21 Sumo2-204ENSMUST00000118155 884 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Smco2Q9DA21 Dhrs2-202ENSMUST00000165432 849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Smco2Q9DA21 Gm15494-202ENSMUST00000171665 451 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Smco2Q9DA21 1700029B24Rik-201ENSMUST00000194040 497 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Smco2Q9DA21 Wdr74-201ENSMUST00000049424 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Smco2Q9DA21 Supt6-201ENSMUST00000002121 6488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Smco2Q9DA21 Gm15557-201ENSMUST00000109629 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Smco2Q9DA21 Klk7-201ENSMUST00000032955 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Smco2Q9DA21 Hdac5-203ENSMUST00000107151 4852 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Smco2Q9DA21 Kcnh2-201ENSMUST00000036092 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Smco2Q9DA21 Mfrp-205ENSMUST00000206308 4037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Smco2Q9DA21 Prr18-201ENSMUST00000069742 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Smco2Q9DA21 Emb-201ENSMUST00000022242 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Smco2Q9DA21 Dnajb5-204ENSMUST00000107973 2300 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Smco2Q9DA21 Col6a2-202ENSMUST00000105413 4653 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Smco2Q9DA21 Sgce-207ENSMUST00000126151 1522 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Smco2Q9DA21 Yes1-201ENSMUST00000072311 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Smco2Q9DA21 Acp5-202ENSMUST00000115315 1349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Smco2Q9DA21 Rbm33-201ENSMUST00000030920 3955 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Smco2Q9DA21 Dlgap3-201ENSMUST00000046659 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Smco2Q9DA21 Ext1-201ENSMUST00000077273 7663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Smco2Q9DA21 Klhl12-203ENSMUST00000116528 3277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Smco2Q9DA21 Aatk-201ENSMUST00000064307 5336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Smco2Q9DA21 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Smco2Q9DA21 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Smco2Q9DA21 Gatd1-201ENSMUST00000106008 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Smco2Q9DA21 Pcdh7-203ENSMUST00000191837 8785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Smco2Q9DA21 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Smco2Q9DA21 Gm12960-201ENSMUST00000120017 1066 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Smco2Q9DA21 Chchd7-207ENSMUST00000121210 548 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Smco2Q9DA21 H2afb1-201ENSMUST00000122446 348 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Smco2Q9DA21 1700001C02Rik-203ENSMUST00000127815 660 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Smco2Q9DA21 Tmem80-205ENSMUST00000132061 667 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Smco2Q9DA21 Gm14224-201ENSMUST00000147187 864 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Smco2Q9DA21 Gm9002-201ENSMUST00000178437 499 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Smco2Q9DA21 Lamtor1-202ENSMUST00000193465 661 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Smco2Q9DA21 Smyd3-207ENSMUST00000194237 1047 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Smco2Q9DA21 Gm42921-201ENSMUST00000196670 655 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Smco2Q9DA21 Med10-201ENSMUST00000022089 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Smco2Q9DA21 Ndufs6-201ENSMUST00000022097 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Smco2Q9DA21 AC155252.1-201ENSMUST00000226462 1208 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Smco2Q9DA21 Fam192a-201ENSMUST00000034226 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Smco2Q9DA21 Secisbp2l-201ENSMUST00000053699 6797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Smco2Q9DA21 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Smco2Q9DA21 Prpf3-201ENSMUST00000015892 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Smco2Q9DA21 Ccnc-203ENSMUST00000108240 1406 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Smco2Q9DA21 Eci2-211ENSMUST00000171229 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Smco2Q9DA21 Cttnbp2nl-202ENSMUST00000098763 4834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Smco2Q9DA21 Gm16029-201ENSMUST00000161643 2427 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Smco2Q9DA21 Tjap1-211ENSMUST00000225080 2412 ntAPPRIS P2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Smco2Q9DA21 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Smco2Q9DA21 Rbm46-201ENSMUST00000048647 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Smco2Q9DA21 Mecp2-203ENSMUST00000123362 1675 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Smco2Q9DA21 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Smco2Q9DA21 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Smco2Q9DA21 Mettl3-201ENSMUST00000022767 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Smco2Q9DA21 Dysf-214ENSMUST00000204354 6432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Smco2Q9DA21 Hspa4-201ENSMUST00000020630 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Smco2Q9DA21 Ckmt2-201ENSMUST00000022122 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Smco2Q9DA21 Slco3a1-202ENSMUST00000098371 2709 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Smco2Q9DA21 9130008F23Rik-201ENSMUST00000068258 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Smco2Q9DA21 Ifnar2-203ENSMUST00000117836 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Smco2Q9DA21 C430049B03Rik-201ENSMUST00000129764 868 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Smco2Q9DA21 Gm11723-201ENSMUST00000155505 466 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Smco2Q9DA21 Alms1-ps2-201ENSMUST00000160606 1170 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Smco2Q9DA21 Gm24420-201ENSMUST00000176676 59 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Smco2Q9DA21 Lrcol1-202ENSMUST00000185691 764 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Smco2Q9DA21 Gm37748-201ENSMUST00000194379 1140 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Smco2Q9DA21 Gm43094-201ENSMUST00000196549 921 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Smco2Q9DA21 Tm2d3-207ENSMUST00000206517 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Smco2Q9DA21 Gm32926-202ENSMUST00000215162 1176 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Smco2Q9DA21 Ndufa4l2-201ENSMUST00000035735 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Smco2Q9DA21 Hdhd3-201ENSMUST00000037820 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Smco2Q9DA21 Upk3bl-201ENSMUST00000006303 1045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Smco2Q9DA21 Gm26847-201ENSMUST00000180407 2109 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Smco2Q9DA21 Hp1bp3-204ENSMUST00000105826 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Smco2Q9DA21 Emc7-201ENSMUST00000069747 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Smco2Q9DA21 Rprd1b-202ENSMUST00000103123 4504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Smco2Q9DA21 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Smco2Q9DA21 Krt36-201ENSMUST00000107416 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Smco2Q9DA21 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Smco2Q9DA21 Olfr317-203ENSMUST00000216196 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Smco2Q9DA21 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Smco2Q9DA21 2900026A02Rik-201ENSMUST00000050125 5876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Smco2Q9DA21 Fam76a-201ENSMUST00000030696 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.4 ms