Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9N2

Cldn34b2, Claudin 34B2, mousemouse

Predictions only

Length 209 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn34b2Q9D9N2 Kif3c-205ENSMUST00000220210 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cldn34b2Q9D9N2 Lrrc34-201ENSMUST00000029252 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cldn34b2Q9D9N2 Mmp21-201ENSMUST00000033278 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cldn34b2Q9D9N2 Fbxo41-202ENSMUST00000161078 6562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cldn34b2Q9D9N2 Slc6a4-202ENSMUST00000108402 2796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cldn34b2Q9D9N2 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cldn34b2Q9D9N2 Gak-201ENSMUST00000046603 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cldn34b2Q9D9N2 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cldn34b2Q9D9N2 Rinl-206ENSMUST00000209035 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cldn34b2Q9D9N2 Reep5-201ENSMUST00000006027 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cldn34b2Q9D9N2 Rhbdl3-201ENSMUST00000017836 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cldn34b2Q9D9N2 Mafg-203ENSMUST00000106181 840 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cldn34b2Q9D9N2 Ly6g6e-203ENSMUST00000172678 750 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cldn34b2Q9D9N2 Smyd3-207ENSMUST00000194237 1047 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cldn34b2Q9D9N2 Letm2-213ENSMUST00000211422 738 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cldn34b2Q9D9N2 Isca2-201ENSMUST00000021667 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cldn34b2Q9D9N2 Fuom-201ENSMUST00000026539 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cldn34b2Q9D9N2 Csk-209ENSMUST00000217314 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cldn34b2Q9D9N2 Ccdc106-202ENSMUST00000108571 1318 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cldn34b2Q9D9N2 H1fnt-201ENSMUST00000060855 1326 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cldn34b2Q9D9N2 Ppp1r18-206ENSMUST00000190496 1395 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cldn34b2Q9D9N2 Apol7a-201ENSMUST00000010745 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cldn34b2Q9D9N2 Cd1d1-202ENSMUST00000063869 1421 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cldn34b2Q9D9N2 Pank1-201ENSMUST00000036584 3460 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cldn34b2Q9D9N2 Ctsk-201ENSMUST00000015664 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cldn34b2Q9D9N2 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cldn34b2Q9D9N2 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cldn34b2Q9D9N2 Atrip-201ENSMUST00000045011 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cldn34b2Q9D9N2 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cldn34b2Q9D9N2 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cldn34b2Q9D9N2 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cldn34b2Q9D9N2 Zfp574-202ENSMUST00000179556 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cldn34b2Q9D9N2 Socs5-201ENSMUST00000041369 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cldn34b2Q9D9N2 Trim80-201ENSMUST00000093914 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Cldn34b2Q9D9N2 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Cldn34b2Q9D9N2 Nfatc1-202ENSMUST00000078049 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Cldn34b2Q9D9N2 Togaram2-205ENSMUST00000153445 3302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Cldn34b2Q9D9N2 Pfkfb3-203ENSMUST00000100411 2008 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Cldn34b2Q9D9N2 Pigg-201ENSMUST00000031189 3427 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Cldn34b2Q9D9N2 Slc52a3-202ENSMUST00000109858 2094 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Cldn34b2Q9D9N2 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Cldn34b2Q9D9N2 Arhgef25-202ENSMUST00000167353 2189 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Cldn34b2Q9D9N2 Ylpm1-207ENSMUST00000168977 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Cldn34b2Q9D9N2 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Cldn34b2Q9D9N2 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Cldn34b2Q9D9N2 Ppp1r18-205ENSMUST00000187690 3185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Cldn34b2Q9D9N2 1700037H04Rik-202ENSMUST00000103188 1241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cldn34b2Q9D9N2 Vps29-204ENSMUST00000118830 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cldn34b2Q9D9N2 Gm12490-201ENSMUST00000120255 560 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Cldn34b2Q9D9N2 Gm14224-201ENSMUST00000147187 864 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cldn34b2Q9D9N2 Rab40c-203ENSMUST00000164982 789 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cldn34b2Q9D9N2 Gm27701-201ENSMUST00000184498 110 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Cldn34b2Q9D9N2 Gm7446-201ENSMUST00000221035 1240 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Cldn34b2Q9D9N2 Syt8-201ENSMUST00000097939 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cldn34b2Q9D9N2 Zbtb5-201ENSMUST00000055028 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cldn34b2Q9D9N2 Rita1-201ENSMUST00000031599 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cldn34b2Q9D9N2 Tnks1bp1-202ENSMUST00000111605 5747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cldn34b2Q9D9N2 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cldn34b2Q9D9N2 Psmd8-207ENSMUST00000209034 1983 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cldn34b2Q9D9N2 Gpsm1-204ENSMUST00000114134 2043 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cldn34b2Q9D9N2 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cldn34b2Q9D9N2 Mcur1-201ENSMUST00000021800 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cldn34b2Q9D9N2 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cldn34b2Q9D9N2 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cldn34b2Q9D9N2 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cldn34b2Q9D9N2 Ska1-201ENSMUST00000040188 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cldn34b2Q9D9N2 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cldn34b2Q9D9N2 Entpd2-201ENSMUST00000028328 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cldn34b2Q9D9N2 2310022A10Rik-204ENSMUST00000187032 1871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cldn34b2Q9D9N2 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cldn34b2Q9D9N2 Gm12280-201ENSMUST00000155836 1624 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cldn34b2Q9D9N2 Gm5779-202ENSMUST00000219564 1477 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cldn34b2Q9D9N2 Slc38a1-201ENSMUST00000088452 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cldn34b2Q9D9N2 Plod1-202ENSMUST00000105712 1059 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cldn34b2Q9D9N2 Gm15678-201ENSMUST00000117573 960 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Cldn34b2Q9D9N2 2310016G11Rik-202ENSMUST00000209111 733 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cldn34b2Q9D9N2 0610005C13Rik-202ENSMUST00000209510 671 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cldn34b2Q9D9N2 AC151971.1-201ENSMUST00000217329 993 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cldn34b2Q9D9N2 AC155252.1-201ENSMUST00000226462 1208 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Cldn34b2Q9D9N2 Cby3-201ENSMUST00000052596 703 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cldn34b2Q9D9N2 Ttr-201ENSMUST00000075312 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cldn34b2Q9D9N2 Gm648-201ENSMUST00000081133 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cldn34b2Q9D9N2 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cldn34b2Q9D9N2 Jph3-201ENSMUST00000026357 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cldn34b2Q9D9N2 Ltbp4-201ENSMUST00000038618 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cldn34b2Q9D9N2 Aptx-201ENSMUST00000030119 5250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cldn34b2Q9D9N2 Peli3-202ENSMUST00000120475 2988 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cldn34b2Q9D9N2 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cldn34b2Q9D9N2 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cldn34b2Q9D9N2 Pdcd6ip-201ENSMUST00000035086 5951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cldn34b2Q9D9N2 Trim27-201ENSMUST00000021761 4204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cldn34b2Q9D9N2 Gins3-201ENSMUST00000034094 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cldn34b2Q9D9N2 Camk2d-202ENSMUST00000066466 4075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cldn34b2Q9D9N2 Zfyve27-207ENSMUST00000169536 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cldn34b2Q9D9N2 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cldn34b2Q9D9N2 Zfp784-201ENSMUST00000062428 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cldn34b2Q9D9N2 Slc35c2-202ENSMUST00000109298 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cldn34b2Q9D9N2 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cldn34b2Q9D9N2 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cldn34b2Q9D9N2 Cdk11b-203ENSMUST00000105600 3170 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37 ms