Protein–RNA interactions for Protein: Q9D824

Fip1l1, Pre-mRNA 3'-end-processing factor FIP1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 581 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fip1l1Q9D824 Ddx31-201ENSMUST00000113853 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Fip1l1Q9D824 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Fip1l1Q9D824 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Fip1l1Q9D824 Kcnt1-204ENSMUST00000114176 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Fip1l1Q9D824 Bcl2l1-201ENSMUST00000007803 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Fip1l1Q9D824 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Fip1l1Q9D824 Rnf214-201ENSMUST00000058720 3964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Fip1l1Q9D824 Asxl1-205ENSMUST00000227428 6981 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Fip1l1Q9D824 Pi4kb-201ENSMUST00000072287 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Fip1l1Q9D824 Pde7b-202ENSMUST00000164195 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Fip1l1Q9D824 C2cd4c-201ENSMUST00000059699 6729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Fip1l1Q9D824 Cavin1-201ENSMUST00000060792 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Fip1l1Q9D824 Ahcyl2-205ENSMUST00000125911 2039 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Fip1l1Q9D824 Ube2g1-201ENSMUST00000021148 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Fip1l1Q9D824 Alx1-201ENSMUST00000040859 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Fip1l1Q9D824 AC115735.4-201ENSMUST00000227460 1944 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Fip1l1Q9D824 Ubqln5-201ENSMUST00000053743 1915 ntAPPRIS P1 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Fip1l1Q9D824 Tmem211-201ENSMUST00000086615 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Fip1l1Q9D824 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Fip1l1Q9D824 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Fip1l1Q9D824 C1qtnf1-202ENSMUST00000106286 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Fip1l1Q9D824 C1qtnf1-201ENSMUST00000017590 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Fip1l1Q9D824 Pex12-207ENSMUST00000176518 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Fip1l1Q9D824 Mfn2-203ENSMUST00000105715 4043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Fip1l1Q9D824 Got1-201ENSMUST00000026196 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Fip1l1Q9D824 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Fip1l1Q9D824 Rnd1-203ENSMUST00000120997 856 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Fip1l1Q9D824 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Fip1l1Q9D824 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Fip1l1Q9D824 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Fip1l1Q9D824 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Fip1l1Q9D824 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Fip1l1Q9D824 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Fip1l1Q9D824 Klhl18-201ENSMUST00000068025 4530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Fip1l1Q9D824 Corin-201ENSMUST00000005352 4862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Fip1l1Q9D824 Adck5-207ENSMUST00000160784 1998 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Fip1l1Q9D824 Scd2-201ENSMUST00000026221 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Fip1l1Q9D824 Ric8b-202ENSMUST00000095385 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Fip1l1Q9D824 Mapt-204ENSMUST00000106992 5253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Fip1l1Q9D824 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Fip1l1Q9D824 Rbm47-204ENSMUST00000113726 4703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Fip1l1Q9D824 Nfib-203ENSMUST00000107245 9116 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Fip1l1Q9D824 Adsl-206ENSMUST00000168756 1439 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Fip1l1Q9D824 Dhdds-204ENSMUST00000105887 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Fip1l1Q9D824 Olfr482-202ENSMUST00000217304 2612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Fip1l1Q9D824 Ptprk-203ENSMUST00000218359 4669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Fip1l1Q9D824 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Fip1l1Q9D824 Sv2c-203ENSMUST00000182289 2197 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Fip1l1Q9D824 Ppp6r1-201ENSMUST00000064099 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Fip1l1Q9D824 Gm36745-201ENSMUST00000213455 1594 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Fip1l1Q9D824 Per2-201ENSMUST00000069620 5833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Fip1l1Q9D824 Pex26-202ENSMUST00000118234 3778 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Fip1l1Q9D824 Mafk-202ENSMUST00000110836 3097 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Fip1l1Q9D824 Secisbp2-201ENSMUST00000040117 3328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Fip1l1Q9D824 Rnf224-202ENSMUST00000205192 1707 ntAPPRIS P1 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Fip1l1Q9D824 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Fip1l1Q9D824 Trp73-201ENSMUST00000097762 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Fip1l1Q9D824 Stk32b-201ENSMUST00000094836 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Fip1l1Q9D824 Jph2-201ENSMUST00000017961 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Fip1l1Q9D824 Phf21b-201ENSMUST00000016768 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Fip1l1Q9D824 Map1lc3b-201ENSMUST00000034270 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Fip1l1Q9D824 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Fip1l1Q9D824 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Fip1l1Q9D824 Edc3-201ENSMUST00000043990 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Fip1l1Q9D824 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Fip1l1Q9D824 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Fip1l1Q9D824 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Fip1l1Q9D824 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Fip1l1Q9D824 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Fip1l1Q9D824 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Fip1l1Q9D824 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Fip1l1Q9D824 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Fip1l1Q9D824 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Fip1l1Q9D824 Espn-213ENSMUST00000105659 3595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Fip1l1Q9D824 Bap1-201ENSMUST00000022458 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Fip1l1Q9D824 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Fip1l1Q9D824 Slc7a7-202ENSMUST00000195970 2057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Fip1l1Q9D824 Fam214b-202ENSMUST00000107956 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Fip1l1Q9D824 Pde8b-207ENSMUST00000162153 2474 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Fip1l1Q9D824 Ip6k1-201ENSMUST00000035214 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Fip1l1Q9D824 Ppl-201ENSMUST00000035672 6277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Fip1l1Q9D824 Sbsn-201ENSMUST00000080518 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Fip1l1Q9D824 Zbtb1-201ENSMUST00000042779 12190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Fip1l1Q9D824 Nfkb2-201ENSMUST00000073116 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Fip1l1Q9D824 Rad51b-202ENSMUST00000171210 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Fip1l1Q9D824 Rpl21-201ENSMUST00000035983 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Fip1l1Q9D824 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Fip1l1Q9D824 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Fip1l1Q9D824 Arhgef2-208ENSMUST00000175911 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Fip1l1Q9D824 Rnf224-201ENSMUST00000091318 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Fip1l1Q9D824 Reep3-201ENSMUST00000020023 5430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Fip1l1Q9D824 Rps6ka4-202ENSMUST00000170516 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Fip1l1Q9D824 Rps6ka4-201ENSMUST00000025903 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Fip1l1Q9D824 Pde4d-205ENSMUST00000119507 2163 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Fip1l1Q9D824 Egfem1-201ENSMUST00000118531 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Fip1l1Q9D824 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Fip1l1Q9D824 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Fip1l1Q9D824 Vrtn-201ENSMUST00000095551 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Fip1l1Q9D824 A530016L24Rik-201ENSMUST00000057465 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Fip1l1Q9D824 2410002F23Rik-203ENSMUST00000084937 2092 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.3 ms