Protein–RNA interactions for Protein: Q9D439

Cfap53, Cilia- and flagella-associated protein 53, mousemouse

Predictions only

Length 514 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cfap53Q9D439 Ino80e-214ENSMUST00000206349 883 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Cfap53Q9D439 Calml4-201ENSMUST00000034777 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cfap53Q9D439 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cfap53Q9D439 Ftl1-201ENSMUST00000094434 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cfap53Q9D439 Nipa2-204ENSMUST00000119201 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cfap53Q9D439 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cfap53Q9D439 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cfap53Q9D439 Slc25a54-201ENSMUST00000029478 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cfap53Q9D439 Cfap157-201ENSMUST00000102813 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cfap53Q9D439 Ppt2-201ENSMUST00000064953 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cfap53Q9D439 Gm37133-201ENSMUST00000192705 1922 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Cfap53Q9D439 Crat-202ENSMUST00000102854 2160 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Cfap53Q9D439 Scg2-201ENSMUST00000049972 2515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Cfap53Q9D439 Ska1-201ENSMUST00000040188 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cfap53Q9D439 Mzf1-204ENSMUST00000182490 2872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cfap53Q9D439 Akna-201ENSMUST00000035724 5387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Cfap53Q9D439 Ret-201ENSMUST00000032201 5456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cfap53Q9D439 Tcp11l1-201ENSMUST00000028597 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cfap53Q9D439 Wnt3a-201ENSMUST00000010044 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cfap53Q9D439 Pbx3-202ENSMUST00000113132 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cfap53Q9D439 Ilvbl-201ENSMUST00000105384 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cfap53Q9D439 AW209491-202ENSMUST00000178289 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cfap53Q9D439 Rtn3-203ENSMUST00000088169 1709 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Cfap53Q9D439 Necab1-201ENSMUST00000041606 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cfap53Q9D439 Awat2-201ENSMUST00000033567 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cfap53Q9D439 Dpysl5-202ENSMUST00000101442 1309 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cfap53Q9D439 Krtap1-3-201ENSMUST00000104930 879 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Cfap53Q9D439 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cfap53Q9D439 Crip3-202ENSMUST00000113465 1035 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cfap53Q9D439 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cfap53Q9D439 Tmem219-202ENSMUST00000119781 1118 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Cfap53Q9D439 Gm11557-201ENSMUST00000120200 1008 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Cfap53Q9D439 Tmem219-204ENSMUST00000121532 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cfap53Q9D439 Cmc4-203ENSMUST00000149863 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Cfap53Q9D439 Gm8927-201ENSMUST00000181978 981 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Cfap53Q9D439 Gm27306-201ENSMUST00000183970 107 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Cfap53Q9D439 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cfap53Q9D439 Gm4971-201ENSMUST00000205991 1108 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Cfap53Q9D439 Gm7390-201ENSMUST00000212452 1216 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Cfap53Q9D439 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Cfap53Q9D439 2310002L09Rik-201ENSMUST00000030101 958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cfap53Q9D439 Tmem219-201ENSMUST00000032926 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cfap53Q9D439 Gm3222-201ENSMUST00000071282 990 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Cfap53Q9D439 Krtap6-5-201ENSMUST00000074637 600 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Cfap53Q9D439 Peli3-202ENSMUST00000120475 2988 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cfap53Q9D439 Rgs12-202ENSMUST00000087684 4713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Cfap53Q9D439 Siglecf-203ENSMUST00000122423 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cfap53Q9D439 Tmc8-201ENSMUST00000050874 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cfap53Q9D439 Vars-201ENSMUST00000087315 4137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cfap53Q9D439 Nfe2l1-204ENSMUST00000107659 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cfap53Q9D439 Olfr533-203ENSMUST00000215308 2345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Cfap53Q9D439 Spns1-201ENSMUST00000032994 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cfap53Q9D439 Nfatc2-202ENSMUST00000074618 6637 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cfap53Q9D439 Fam57b-202ENSMUST00000098032 1894 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Cfap53Q9D439 Mettl11b-201ENSMUST00000159679 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cfap53Q9D439 Syncrip-209ENSMUST00000174361 1767 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Cfap53Q9D439 Sema3d-201ENSMUST00000030868 6307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cfap53Q9D439 Kcna5-201ENSMUST00000060972 2862 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Cfap53Q9D439 Cfp-201ENSMUST00000001156 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cfap53Q9D439 Mgat3-201ENSMUST00000044970 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cfap53Q9D439 Crybg1-202ENSMUST00000200401 7525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Cfap53Q9D439 Bdh1-202ENSMUST00000115226 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cfap53Q9D439 Art3-205ENSMUST00000120193 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cfap53Q9D439 Shf-202ENSMUST00000110530 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Cfap53Q9D439 Ifnar2-203ENSMUST00000117836 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cfap53Q9D439 Gm13385-201ENSMUST00000121089 220 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Cfap53Q9D439 Cenpa-206ENSMUST00000149759 346 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Cfap53Q9D439 Ercc1-203ENSMUST00000160369 1175 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cfap53Q9D439 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cfap53Q9D439 Gm26935-201ENSMUST00000182686 519 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Cfap53Q9D439 Agrp-202ENSMUST00000194091 734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Cfap53Q9D439 AC238811.1-201ENSMUST00000225302 441 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Cfap53Q9D439 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cfap53Q9D439 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cfap53Q9D439 Fut7-202ENSMUST00000100320 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cfap53Q9D439 Pfkfb3-203ENSMUST00000100411 2008 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Cfap53Q9D439 Cep131-201ENSMUST00000106227 3578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cfap53Q9D439 Cep131-202ENSMUST00000106229 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cfap53Q9D439 Cep131-207ENSMUST00000180242 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Cfap53Q9D439 Tlk2-209ENSMUST00000145048 2776 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cfap53Q9D439 Zfp142-203ENSMUST00000113737 7473 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cfap53Q9D439 Lzts1-204ENSMUST00000185176 5019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Cfap53Q9D439 Zfp202-201ENSMUST00000026693 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cfap53Q9D439 Adamts16-201ENSMUST00000080145 4981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cfap53Q9D439 Abhd3-202ENSMUST00000117726 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cfap53Q9D439 Plekhg2-202ENSMUST00000119990 4880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cfap53Q9D439 Tmem218-201ENSMUST00000034632 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cfap53Q9D439 Rbbp5-206ENSMUST00000190825 2456 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cfap53Q9D439 Hcrtr1-202ENSMUST00000119423 2439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Cfap53Q9D439 Nwd2-201ENSMUST00000159584 8534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cfap53Q9D439 Prpf3-201ENSMUST00000015892 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cfap53Q9D439 Vasp-201ENSMUST00000032561 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Cfap53Q9D439 Pdlim2-210ENSMUST00000153735 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Cfap53Q9D439 Lrrc17-201ENSMUST00000035651 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Cfap53Q9D439 Pcdha11-203ENSMUST00000192447 4583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Cfap53Q9D439 Cyp11a1-201ENSMUST00000034874 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Cfap53Q9D439 Actn4-201ENSMUST00000068045 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Cfap53Q9D439 Efemp1-201ENSMUST00000020759 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Cfap53Q9D439 Ntn4-201ENSMUST00000020204 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Cfap53Q9D439 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.4 ms