Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0B8

Ribc1, RIB43A-like with coiled-coils protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 379 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ribc1Q9D0B8 Prrxl1-202ENSMUST00000186452 2371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ribc1Q9D0B8 Pdlim2-210ENSMUST00000153735 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ribc1Q9D0B8 Msantd3-201ENSMUST00000061135 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ribc1Q9D0B8 Dtnb-223ENSMUST00000174547 2112 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ribc1Q9D0B8 Galns-203ENSMUST00000212319 2111 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ribc1Q9D0B8 Zmynd15-202ENSMUST00000092958 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ribc1Q9D0B8 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ribc1Q9D0B8 Osbpl9-202ENSMUST00000084366 3134 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ribc1Q9D0B8 Akap17b-201ENSMUST00000051906 6003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ribc1Q9D0B8 Unc5b-203ENSMUST00000218637 3653 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ribc1Q9D0B8 Tlk2-209ENSMUST00000145048 2776 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ribc1Q9D0B8 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ribc1Q9D0B8 Syncrip-209ENSMUST00000174361 1767 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ribc1Q9D0B8 Exd2-201ENSMUST00000038185 3310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ribc1Q9D0B8 Inpp5a-202ENSMUST00000097975 2301 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ribc1Q9D0B8 Serpinb2-201ENSMUST00000009356 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ribc1Q9D0B8 Dnmt3b-203ENSMUST00000081628 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ribc1Q9D0B8 Nub1-201ENSMUST00000068825 3269 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ribc1Q9D0B8 Mettl14-201ENSMUST00000029759 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ribc1Q9D0B8 Yes1-201ENSMUST00000072311 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ribc1Q9D0B8 Kif3c-205ENSMUST00000220210 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ribc1Q9D0B8 Cfp-201ENSMUST00000001156 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ribc1Q9D0B8 Cfap157-201ENSMUST00000102813 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ribc1Q9D0B8 Zbtb5-202ENSMUST00000107817 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ribc1Q9D0B8 Thnsl2-201ENSMUST00000074241 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ribc1Q9D0B8 Gm44065-201ENSMUST00000203184 3527 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Ribc1Q9D0B8 Gm45740-201ENSMUST00000212103 2003 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ribc1Q9D0B8 Rufy3-203ENSMUST00000196894 3703 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ribc1Q9D0B8 Dhrs3-202ENSMUST00000105744 1226 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ribc1Q9D0B8 Crybb3-203ENSMUST00000118226 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ribc1Q9D0B8 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ribc1Q9D0B8 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ribc1Q9D0B8 Gm12454-201ENSMUST00000139119 978 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ribc1Q9D0B8 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ribc1Q9D0B8 Cxcl17-202ENSMUST00000200880 760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ribc1Q9D0B8 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ribc1Q9D0B8 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ribc1Q9D0B8 Olfr283-201ENSMUST00000057386 1102 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ribc1Q9D0B8 Cxcl17-201ENSMUST00000074040 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ribc1Q9D0B8 Crybb3-201ENSMUST00000076069 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ribc1Q9D0B8 Spsb1-201ENSMUST00000038562 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ribc1Q9D0B8 Gm2762-202ENSMUST00000201517 2339 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ribc1Q9D0B8 Syce1-201ENSMUST00000026553 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ribc1Q9D0B8 Cd300lf-203ENSMUST00000106562 1762 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ribc1Q9D0B8 Arhgap33-203ENSMUST00000207858 4337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ribc1Q9D0B8 Mettl7a3-201ENSMUST00000075420 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ribc1Q9D0B8 Ces2f-201ENSMUST00000076384 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ribc1Q9D0B8 Tnfaip8-207ENSMUST00000148159 1921 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ribc1Q9D0B8 Slc38a1-201ENSMUST00000088452 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ribc1Q9D0B8 Hdgfl2-201ENSMUST00000002911 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ribc1Q9D0B8 5330406M23Rik-201ENSMUST00000195672 2094 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Ribc1Q9D0B8 Gatd1-201ENSMUST00000106008 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ribc1Q9D0B8 Zfp354c-201ENSMUST00000000632 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ribc1Q9D0B8 Bdh1-202ENSMUST00000115226 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ribc1Q9D0B8 Wfdc3-201ENSMUST00000103096 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ribc1Q9D0B8 Cmss1-201ENSMUST00000114371 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ribc1Q9D0B8 Gm6912-201ENSMUST00000117218 544 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Ribc1Q9D0B8 Fbxo41-203ENSMUST00000161546 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ribc1Q9D0B8 Mir7684-201ENSMUST00000183858 60 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Ribc1Q9D0B8 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ribc1Q9D0B8 4930502C17Rik-201ENSMUST00000200282 948 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Ribc1Q9D0B8 Gm8225-201ENSMUST00000090257 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ribc1Q9D0B8 Tcf12-202ENSMUST00000183404 6299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ribc1Q9D0B8 Ank-201ENSMUST00000022875 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ribc1Q9D0B8 Hells-201ENSMUST00000025965 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ribc1Q9D0B8 Osbpl11-201ENSMUST00000039733 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ribc1Q9D0B8 Gm16090-201ENSMUST00000130296 1704 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ribc1Q9D0B8 Mfap4-202ENSMUST00000064783 1722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ribc1Q9D0B8 Mff-201ENSMUST00000073025 1706 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ribc1Q9D0B8 Cacng3-201ENSMUST00000084615 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ribc1Q9D0B8 Slc35b1-201ENSMUST00000021243 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ribc1Q9D0B8 Gm29374-201ENSMUST00000187198 1340 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ribc1Q9D0B8 Ric8b-202ENSMUST00000095385 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ribc1Q9D0B8 Gm14379-201ENSMUST00000128858 1878 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ribc1Q9D0B8 Fermt2-201ENSMUST00000045905 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ribc1Q9D0B8 Ddx23-201ENSMUST00000003450 3187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ribc1Q9D0B8 Irak2-202ENSMUST00000089022 2974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ribc1Q9D0B8 Spag1-201ENSMUST00000047348 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ribc1Q9D0B8 Slc38a7-204ENSMUST00000212270 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ribc1Q9D0B8 Rprd1b-202ENSMUST00000103123 4504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ribc1Q9D0B8 Stk38-202ENSMUST00000119274 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ribc1Q9D0B8 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ribc1Q9D0B8 Clec16a-205ENSMUST00000115827 2949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ribc1Q9D0B8 Esrrb-202ENSMUST00000110203 2363 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ribc1Q9D0B8 Krtap1-3-201ENSMUST00000104930 879 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ribc1Q9D0B8 Rdm1-201ENSMUST00000010506 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ribc1Q9D0B8 Pla2g2e-202ENSMUST00000105803 381 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ribc1Q9D0B8 Ercc1-203ENSMUST00000160369 1175 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ribc1Q9D0B8 Mir8102-201ENSMUST00000184148 139 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Ribc1Q9D0B8 Mir7023-201ENSMUST00000185093 64 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Ribc1Q9D0B8 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ribc1Q9D0B8 Prtn3-201ENSMUST00000006679 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ribc1Q9D0B8 Nanos3-201ENSMUST00000070102 730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ribc1Q9D0B8 Me1-201ENSMUST00000034989 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ribc1Q9D0B8 Pnoc-201ENSMUST00000059339 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ribc1Q9D0B8 Gm2155-201ENSMUST00000181581 1974 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ribc1Q9D0B8 Higd1a-205ENSMUST00000215007 1980 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ribc1Q9D0B8 Pja1-203ENSMUST00000113792 3038 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ribc1Q9D0B8 Vwa3b-202ENSMUST00000067178 1769 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ribc1Q9D0B8 Gspt1-205ENSMUST00000167571 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 77.3 ms