Protein–RNA interactions for Protein: Q9CYC3

Tmem39a, Transmembrane protein 39A, mousemouse

Predictions only

Length 486 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem39aQ9CYC3 Nek7-201ENSMUST00000027642 3737 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmem39aQ9CYC3 Fam20a-201ENSMUST00000020938 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmem39aQ9CYC3 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmem39aQ9CYC3 Slc45a1-201ENSMUST00000037827 3387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmem39aQ9CYC3 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmem39aQ9CYC3 Gm10863-205ENSMUST00000148028 905 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmem39aQ9CYC3 Gm15429-201ENSMUST00000151268 798 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmem39aQ9CYC3 Gm16282-201ENSMUST00000162641 451 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmem39aQ9CYC3 Gm2495-201ENSMUST00000191160 466 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmem39aQ9CYC3 Gm43179-201ENSMUST00000198797 275 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmem39aQ9CYC3 Gm43403-202ENSMUST00000198830 370 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmem39aQ9CYC3 Sox2ot-216ENSMUST00000200092 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmem39aQ9CYC3 Gm9299-201ENSMUST00000206392 1140 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmem39aQ9CYC3 Ccdc159-204ENSMUST00000216710 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmem39aQ9CYC3 Fam241b-202ENSMUST00000064050 1096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmem39aQ9CYC3 Krtap6-5-201ENSMUST00000074637 600 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmem39aQ9CYC3 Ap2a1-203ENSMUST00000166972 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmem39aQ9CYC3 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmem39aQ9CYC3 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmem39aQ9CYC3 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmem39aQ9CYC3 Mmp2-201ENSMUST00000034187 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmem39aQ9CYC3 5730409E04Rik-201ENSMUST00000097886 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmem39aQ9CYC3 Nphs2-201ENSMUST00000027896 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmem39aQ9CYC3 Lzts3-203ENSMUST00000110260 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmem39aQ9CYC3 Xrra1-201ENSMUST00000036155 2731 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmem39aQ9CYC3 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmem39aQ9CYC3 Gm26732-201ENSMUST00000181807 2771 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmem39aQ9CYC3 Cd3d-201ENSMUST00000034602 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmem39aQ9CYC3 Twf1-201ENSMUST00000023087 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmem39aQ9CYC3 Angel2-202ENSMUST00000066632 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmem39aQ9CYC3 Slc22a20-201ENSMUST00000041827 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmem39aQ9CYC3 Lhx1-201ENSMUST00000018842 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmem39aQ9CYC3 Gtpbp1-201ENSMUST00000046463 3398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmem39aQ9CYC3 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmem39aQ9CYC3 Hsd3b3-201ENSMUST00000090743 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmem39aQ9CYC3 Qsox1-202ENSMUST00000111764 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmem39aQ9CYC3 Tcirg1-211ENSMUST00000145791 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmem39aQ9CYC3 Rhbdl3-201ENSMUST00000017836 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmem39aQ9CYC3 Pdgfc-201ENSMUST00000029652 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmem39aQ9CYC3 Rnaseh2a-210ENSMUST00000147812 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmem39aQ9CYC3 Nudt1-203ENSMUST00000110825 599 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmem39aQ9CYC3 Gm15821-201ENSMUST00000121995 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmem39aQ9CYC3 Srgn-201ENSMUST00000020271 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmem39aQ9CYC3 Tgif2-ps1-201ENSMUST00000203590 713 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmem39aQ9CYC3 Gm8463-201ENSMUST00000208573 613 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmem39aQ9CYC3 Gm7561-201ENSMUST00000211203 886 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmem39aQ9CYC3 Mal-201ENSMUST00000028853 486 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmem39aQ9CYC3 Ttr-201ENSMUST00000075312 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmem39aQ9CYC3 Lyzl4-201ENSMUST00000077706 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmem39aQ9CYC3 Gm6091-201ENSMUST00000098307 165 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmem39aQ9CYC3 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmem39aQ9CYC3 Zfp385b-203ENSMUST00000111830 2642 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmem39aQ9CYC3 Tmem101-201ENSMUST00000021296 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmem39aQ9CYC3 Erg-203ENSMUST00000113848 2139 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmem39aQ9CYC3 Rbmx-202ENSMUST00000114726 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmem39aQ9CYC3 A230077H06Rik-201ENSMUST00000188579 2918 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmem39aQ9CYC3 Klk7-201ENSMUST00000032955 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmem39aQ9CYC3 Csk-209ENSMUST00000217314 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmem39aQ9CYC3 Trim80-201ENSMUST00000093914 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmem39aQ9CYC3 Rbbp8-201ENSMUST00000047322 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmem39aQ9CYC3 Glud1-201ENSMUST00000022322 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmem39aQ9CYC3 AW209491-202ENSMUST00000178289 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmem39aQ9CYC3 Tmem164-202ENSMUST00000101198 4443 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmem39aQ9CYC3 Itpripl1-203ENSMUST00000154021 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmem39aQ9CYC3 Mgat1-202ENSMUST00000101293 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmem39aQ9CYC3 AL645783.1-201ENSMUST00000221416 1832 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmem39aQ9CYC3 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmem39aQ9CYC3 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmem39aQ9CYC3 Trib1-202ENSMUST00000118228 3081 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmem39aQ9CYC3 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmem39aQ9CYC3 Radil-201ENSMUST00000063635 3700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmem39aQ9CYC3 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmem39aQ9CYC3 Ypel3-203ENSMUST00000106357 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmem39aQ9CYC3 Rbbp7-201ENSMUST00000033720 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmem39aQ9CYC3 Timm10b-202ENSMUST00000106780 671 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmem39aQ9CYC3 Shf-202ENSMUST00000110530 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmem39aQ9CYC3 Gm8584-201ENSMUST00000171982 758 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmem39aQ9CYC3 Gm27572-201ENSMUST00000183702 255 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmem39aQ9CYC3 Gm7287-201ENSMUST00000205267 602 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmem39aQ9CYC3 Gm44780-201ENSMUST00000205409 581 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmem39aQ9CYC3 Pomc-202ENSMUST00000218089 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmem39aQ9CYC3 Fam192a-201ENSMUST00000034226 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmem39aQ9CYC3 Pef1-202ENSMUST00000118199 1915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmem39aQ9CYC3 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmem39aQ9CYC3 Aire-216ENSMUST00000156417 1627 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmem39aQ9CYC3 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmem39aQ9CYC3 Slc39a2-201ENSMUST00000047726 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmem39aQ9CYC3 Il17rd-203ENSMUST00000225146 3366 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmem39aQ9CYC3 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmem39aQ9CYC3 Zfp467-203ENSMUST00000114558 3115 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmem39aQ9CYC3 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmem39aQ9CYC3 Dera-207ENSMUST00000203693 1446 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmem39aQ9CYC3 Atp6v1h-204ENSMUST00000192698 1811 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Tmem39aQ9CYC3 Arhgap8-205ENSMUST00000168811 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Tmem39aQ9CYC3 B3gntl1-201ENSMUST00000062654 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Tmem39aQ9CYC3 Eml3-201ENSMUST00000096241 3322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Tmem39aQ9CYC3 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Tmem39aQ9CYC3 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Tmem39aQ9CYC3 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Tmem39aQ9CYC3 Tifa-203ENSMUST00000164447 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.5 ms