Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXH7

Sgo1, Shugoshin 1, mousemouse

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Length 517 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sgo1Q9CXH7 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Sgo1Q9CXH7 AC149588.3-201ENSMUST00000227515 150 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Sgo1Q9CXH7 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Sgo1Q9CXH7 H2bfm-201ENSMUST00000059808 1052 ntAPPRIS P1 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Sgo1Q9CXH7 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Sgo1Q9CXH7 Hk1-202ENSMUST00000099691 4278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Sgo1Q9CXH7 Hectd1-201ENSMUST00000042052 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Sgo1Q9CXH7 Nrd1-202ENSMUST00000102736 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
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Sgo1Q9CXH7 Trim80-201ENSMUST00000093914 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Sgo1Q9CXH7 Zfp319-201ENSMUST00000057717 7232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Sgo1Q9CXH7 Ngef-201ENSMUST00000027477 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Sgo1Q9CXH7 Slc52a3-204ENSMUST00000109861 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Sgo1Q9CXH7 Fam43a-201ENSMUST00000059078 3075 ntAPPRIS P1 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Sgo1Q9CXH7 Emc3-201ENSMUST00000032425 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Sgo1Q9CXH7 Gm27194-201ENSMUST00000175753 2936 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Sgo1Q9CXH7 B230206H07Rik-202ENSMUST00000134845 3269 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Sgo1Q9CXH7 Sgo2a-201ENSMUST00000027202 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Sgo1Q9CXH7 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Sgo1Q9CXH7 Atp2a3-203ENSMUST00000108485 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Sgo1Q9CXH7 Slc37a1-201ENSMUST00000165149 3354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Sgo1Q9CXH7 Trp73-201ENSMUST00000097762 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Sgo1Q9CXH7 Edil3-203ENSMUST00000118731 2721 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Sgo1Q9CXH7 Gm45751-201ENSMUST00000210185 1573 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Sgo1Q9CXH7 Zfp672-204ENSMUST00000108829 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Sgo1Q9CXH7 Grb10-201ENSMUST00000093321 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Sgo1Q9CXH7 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Sgo1Q9CXH7 Fam46a-201ENSMUST00000034802 5479 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Sgo1Q9CXH7 Ralgds-202ENSMUST00000100241 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
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Sgo1Q9CXH7 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
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Sgo1Q9CXH7 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Sgo1Q9CXH7 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Sgo1Q9CXH7 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Sgo1Q9CXH7 Chst4-202ENSMUST00000211894 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
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Sgo1Q9CXH7 C77080-203ENSMUST00000106051 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Sgo1Q9CXH7 C77080-202ENSMUST00000097873 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Sgo1Q9CXH7 Gm20633-201ENSMUST00000176742 2831 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Sgo1Q9CXH7 Atp6v1b1-201ENSMUST00000006431 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Sgo1Q9CXH7 Tmem9-201ENSMUST00000063719 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
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Sgo1Q9CXH7 Ces2e-202ENSMUST00000109410 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
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Sgo1Q9CXH7 Syt1-202ENSMUST00000105276 4820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Sgo1Q9CXH7 Kcnj3-203ENSMUST00000112633 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Sgo1Q9CXH7 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Sgo1Q9CXH7 Slc7a7-202ENSMUST00000195970 2057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Sgo1Q9CXH7 Bhmt-201ENSMUST00000099309 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Sgo1Q9CXH7 Olfr607-202ENSMUST00000214347 5706 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Sgo1Q9CXH7 Fam214b-202ENSMUST00000107956 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Sgo1Q9CXH7 Hnrnpa1-201ENSMUST00000036004 1918 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Sgo1Q9CXH7 C530008M17Rik-202ENSMUST00000120639 6826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Sgo1Q9CXH7 C530008M17Rik-211ENSMUST00000163347 6835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Sgo1Q9CXH7 Gga3-202ENSMUST00000106508 3582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Sgo1Q9CXH7 Ispd-205ENSMUST00000221895 4022 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Sgo1Q9CXH7 Vwf-202ENSMUST00000112253 2184 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Sgo1Q9CXH7 Ube2k-210ENSMUST00000202679 4682 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Sgo1Q9CXH7 Diaph1-204ENSMUST00000115631 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Sgo1Q9CXH7 Rgs12-205ENSMUST00000114283 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
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