Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWX4

Rpusd4, Mitochondrial RNA pseudouridine synthase Rpusd4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpusd4Q9CWX4 Obsl1-201ENSMUST00000113565 3379 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rpusd4Q9CWX4 Inpp5a-202ENSMUST00000097975 2301 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rpusd4Q9CWX4 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rpusd4Q9CWX4 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rpusd4Q9CWX4 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rpusd4Q9CWX4 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rpusd4Q9CWX4 Eln-201ENSMUST00000015138 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rpusd4Q9CWX4 Mul1-201ENSMUST00000044058 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rpusd4Q9CWX4 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rpusd4Q9CWX4 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rpusd4Q9CWX4 Gm37644-201ENSMUST00000192190 2270 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Rpusd4Q9CWX4 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Rpusd4Q9CWX4 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rpusd4Q9CWX4 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rpusd4Q9CWX4 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Rpusd4Q9CWX4 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rpusd4Q9CWX4 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rpusd4Q9CWX4 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rpusd4Q9CWX4 4933434E20Rik-206ENSMUST00000160640 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rpusd4Q9CWX4 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rpusd4Q9CWX4 Myo6-204ENSMUST00000113268 7927 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rpusd4Q9CWX4 Chst3-201ENSMUST00000068690 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rpusd4Q9CWX4 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rpusd4Q9CWX4 Zscan20-202ENSMUST00000097877 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rpusd4Q9CWX4 Kdm2b-204ENSMUST00000118027 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rpusd4Q9CWX4 Atp1a2-201ENSMUST00000085913 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rpusd4Q9CWX4 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rpusd4Q9CWX4 Ncoa7-201ENSMUST00000068567 5105 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rpusd4Q9CWX4 Gm5639-201ENSMUST00000122305 2403 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Rpusd4Q9CWX4 Xrcc3-201ENSMUST00000021715 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rpusd4Q9CWX4 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rpusd4Q9CWX4 Osm-201ENSMUST00000075221 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rpusd4Q9CWX4 Cpxm2-201ENSMUST00000033149 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rpusd4Q9CWX4 Scd2-201ENSMUST00000026221 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rpusd4Q9CWX4 Olfr1428-203ENSMUST00000214103 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rpusd4Q9CWX4 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rpusd4Q9CWX4 Rab15-201ENSMUST00000021459 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rpusd4Q9CWX4 4930579G24Rik-201ENSMUST00000029388 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rpusd4Q9CWX4 S1pr3-201ENSMUST00000087978 4463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rpusd4Q9CWX4 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rpusd4Q9CWX4 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rpusd4Q9CWX4 Lrrc29-203ENSMUST00000210412 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rpusd4Q9CWX4 Gm19461-205ENSMUST00000191207 2566 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rpusd4Q9CWX4 Grip1-202ENSMUST00000077871 3720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rpusd4Q9CWX4 Nsd3-211ENSMUST00000155861 2834 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rpusd4Q9CWX4 Slc7a15-201ENSMUST00000036938 1907 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rpusd4Q9CWX4 Ctbp1-212ENSMUST00000202962 3595 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rpusd4Q9CWX4 Ppp4r3b-202ENSMUST00000102856 2410 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rpusd4Q9CWX4 Gm5566-201ENSMUST00000116118 459 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Rpusd4Q9CWX4 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Rpusd4Q9CWX4 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rpusd4Q9CWX4 Gm10275-202ENSMUST00000168697 495 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Rpusd4Q9CWX4 Gm10044-204ENSMUST00000170177 659 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rpusd4Q9CWX4 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rpusd4Q9CWX4 Gm25144-201ENSMUST00000179561 110 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Rpusd4Q9CWX4 Gm25352-201ENSMUST00000179815 110 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Rpusd4Q9CWX4 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rpusd4Q9CWX4 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rpusd4Q9CWX4 Gm10275-201ENSMUST00000092620 635 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Rpusd4Q9CWX4 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rpusd4Q9CWX4 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rpusd4Q9CWX4 Sema6c-201ENSMUST00000090821 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rpusd4Q9CWX4 Sorl1-201ENSMUST00000060989 10715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rpusd4Q9CWX4 Slc8b1-204ENSMUST00000111890 2775 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rpusd4Q9CWX4 Hid1-202ENSMUST00000106542 3276 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rpusd4Q9CWX4 Mboat2-201ENSMUST00000078902 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rpusd4Q9CWX4 Ugt1a8-201ENSMUST00000113139 2227 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rpusd4Q9CWX4 Ydjc-202ENSMUST00000115702 1713 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rpusd4Q9CWX4 Olfr95-202ENSMUST00000216318 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rpusd4Q9CWX4 Cux2-210ENSMUST00000168288 4697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rpusd4Q9CWX4 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rpusd4Q9CWX4 Zyx-202ENSMUST00000164375 3188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rpusd4Q9CWX4 Sp6-202ENSMUST00000107622 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rpusd4Q9CWX4 Fn1-211ENSMUST00000187938 7965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rpusd4Q9CWX4 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Rpusd4Q9CWX4 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rpusd4Q9CWX4 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rpusd4Q9CWX4 Mcph1-201ENSMUST00000039412 4662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rpusd4Q9CWX4 Tbc1d9b-201ENSMUST00000093138 4407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rpusd4Q9CWX4 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rpusd4Q9CWX4 Esrrb-202ENSMUST00000110203 2363 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rpusd4Q9CWX4 Cpt2-201ENSMUST00000030345 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rpusd4Q9CWX4 Edil3-203ENSMUST00000118731 2721 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rpusd4Q9CWX4 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rpusd4Q9CWX4 Dsp-201ENSMUST00000124830 9592 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rpusd4Q9CWX4 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rpusd4Q9CWX4 Zfyve28-201ENSMUST00000094868 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rpusd4Q9CWX4 Pip5k1c-201ENSMUST00000045469 4323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rpusd4Q9CWX4 Cad-201ENSMUST00000013773 7137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rpusd4Q9CWX4 1810030O07Rik-201ENSMUST00000060108 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rpusd4Q9CWX4 Gm12626-201ENSMUST00000117339 1983 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Rpusd4Q9CWX4 Gm12623-201ENSMUST00000119849 1983 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Rpusd4Q9CWX4 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rpusd4Q9CWX4 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rpusd4Q9CWX4 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rpusd4Q9CWX4 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rpusd4Q9CWX4 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rpusd4Q9CWX4 Ssty1-201ENSMUST00000180056 699 ntAPPRIS P1 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rpusd4Q9CWX4 Gm29310-201ENSMUST00000185468 696 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Rpusd4Q9CWX4 Gm21825-201ENSMUST00000185728 696 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56 ms