Protein–RNA interactions for Protein: Q9CVR1

Gm26657, Predicted gene, 26657 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 127 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm26657Q9CVR1 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm26657Q9CVR1 Tm7sf2-203ENSMUST00000159084 1351 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm26657Q9CVR1 Zbtb33-201ENSMUST00000049740 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm26657Q9CVR1 Gosr2-202ENSMUST00000107013 1044 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm26657Q9CVR1 Rhox2d-201ENSMUST00000115179 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm26657Q9CVR1 Crybb3-205ENSMUST00000120506 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm26657Q9CVR1 Snap47-202ENSMUST00000120940 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm26657Q9CVR1 4930527A07Rik-201ENSMUST00000130677 559 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm26657Q9CVR1 Gm17344-202ENSMUST00000173980 621 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm26657Q9CVR1 Gm29542-201ENSMUST00000186876 704 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm26657Q9CVR1 Lcmt1-204ENSMUST00000206574 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm26657Q9CVR1 Gm11149-204ENSMUST00000216483 1275 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm26657Q9CVR1 Gm6218-201ENSMUST00000219812 628 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm26657Q9CVR1 Gm5626-201ENSMUST00000222151 1058 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm26657Q9CVR1 Pdlim7-202ENSMUST00000069929 899 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm26657Q9CVR1 Odf3l2-201ENSMUST00000095464 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm26657Q9CVR1 Nek7-201ENSMUST00000027642 3737 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm26657Q9CVR1 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm26657Q9CVR1 Lrrc8a-202ENSMUST00000113654 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm26657Q9CVR1 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm26657Q9CVR1 Fgfr1-202ENSMUST00000117179 4046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm26657Q9CVR1 Ap2m1-201ENSMUST00000007216 2937 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm26657Q9CVR1 Sipa1-202ENSMUST00000080824 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm26657Q9CVR1 Txnrd3-201ENSMUST00000000828 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm26657Q9CVR1 Mrgprh-201ENSMUST00000075296 1809 ntAPPRIS P1 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm26657Q9CVR1 Grk4-201ENSMUST00000001112 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm26657Q9CVR1 Ypel3-203ENSMUST00000106357 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm26657Q9CVR1 Pltp-203ENSMUST00000109317 1575 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm26657Q9CVR1 Arfgap1-203ENSMUST00000108860 2326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm26657Q9CVR1 Angel2-202ENSMUST00000066632 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm26657Q9CVR1 Gm20488-201ENSMUST00000201641 2996 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm26657Q9CVR1 Ldb3-207ENSMUST00000227819 1499 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm26657Q9CVR1 Gale-202ENSMUST00000102541 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm26657Q9CVR1 2600006K01Rik-201ENSMUST00000047607 1406 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm26657Q9CVR1 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm26657Q9CVR1 1700037C18Rik-202ENSMUST00000115859 2592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm26657Q9CVR1 Gm15770-201ENSMUST00000117498 584 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm26657Q9CVR1 Ptgr2-205ENSMUST00000135001 1286 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm26657Q9CVR1 Gm13568-201ENSMUST00000156099 446 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm26657Q9CVR1 B3gat1-204ENSMUST00000160899 3801 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm26657Q9CVR1 Cpsf4l-205ENSMUST00000173655 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm26657Q9CVR1 Tbc1d17-209ENSMUST00000207293 692 ntTSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm26657Q9CVR1 Armc12-201ENSMUST00000025060 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm26657Q9CVR1 Eya4-206ENSMUST00000219315 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm26657Q9CVR1 Tbx3-201ENSMUST00000018748 4856 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm26657Q9CVR1 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm26657Q9CVR1 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm26657Q9CVR1 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm26657Q9CVR1 Gigyf2-201ENSMUST00000027475 5724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm26657Q9CVR1 Slc25a22-202ENSMUST00000106006 2277 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm26657Q9CVR1 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm26657Q9CVR1 Gng4-201ENSMUST00000021734 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm26657Q9CVR1 Nrxn1-201ENSMUST00000054059 4697 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm26657Q9CVR1 Tmc8-201ENSMUST00000050874 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm26657Q9CVR1 AC161252.3-201ENSMUST00000225465 1549 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm26657Q9CVR1 Car6-202ENSMUST00000105683 1460 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm26657Q9CVR1 Elf4-202ENSMUST00000114958 6088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm26657Q9CVR1 Arap1-204ENSMUST00000107010 5147 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm26657Q9CVR1 Tcirg1-201ENSMUST00000001801 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm26657Q9CVR1 Trpc7-206ENSMUST00000173513 2241 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm26657Q9CVR1 Ace3-201ENSMUST00000190995 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm26657Q9CVR1 Jazf1-201ENSMUST00000074541 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm26657Q9CVR1 Folr1-204ENSMUST00000106985 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm26657Q9CVR1 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm26657Q9CVR1 Mrap2-202ENSMUST00000113149 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm26657Q9CVR1 Gfpt1-202ENSMUST00000113655 1255 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm26657Q9CVR1 Pja1-202ENSMUST00000113790 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm26657Q9CVR1 Ccl25-205ENSMUST00000127460 867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm26657Q9CVR1 Arf5-202ENSMUST00000169841 768 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm26657Q9CVR1 2410002F23Rik-214ENSMUST00000186606 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm26657Q9CVR1 C330022C24Rik-201ENSMUST00000190581 1077 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm26657Q9CVR1 Aip-201ENSMUST00000025767 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm26657Q9CVR1 Rlbp1-201ENSMUST00000053718 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm26657Q9CVR1 Olfr1410-201ENSMUST00000079790 969 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm26657Q9CVR1 Vwc2-202ENSMUST00000109681 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm26657Q9CVR1 Rnpepl1-201ENSMUST00000027487 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm26657Q9CVR1 Wdr5-201ENSMUST00000113952 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm26657Q9CVR1 Inpp4a-209ENSMUST00000140264 3676 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm26657Q9CVR1 0610006L08Rik-201ENSMUST00000205326 1589 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm26657Q9CVR1 Trim27-206ENSMUST00000222544 4312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm26657Q9CVR1 Cacna2d1-205ENSMUST00000167946 7436 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm26657Q9CVR1 Kcnq2-208ENSMUST00000103051 4200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm26657Q9CVR1 Vldlr-207ENSMUST00000167487 7971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm26657Q9CVR1 Grtp1-206ENSMUST00000210317 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm26657Q9CVR1 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm26657Q9CVR1 2310022A10Rik-204ENSMUST00000187032 1871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm26657Q9CVR1 Lrrc34-201ENSMUST00000029252 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm26657Q9CVR1 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm26657Q9CVR1 Klf12-201ENSMUST00000097079 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm26657Q9CVR1 Gm19863-201ENSMUST00000192480 2218 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm26657Q9CVR1 Dpysl5-203ENSMUST00000114729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm26657Q9CVR1 Cyp2ab1-205ENSMUST00000182741 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm26657Q9CVR1 Scn4b-201ENSMUST00000060125 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm26657Q9CVR1 Adk-201ENSMUST00000045376 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm26657Q9CVR1 Gm20632-201ENSMUST00000176760 2427 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm26657Q9CVR1 Lpar2-202ENSMUST00000164890 5800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm26657Q9CVR1 Tfe3-211ENSMUST00000137467 3390 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm26657Q9CVR1 Scyl3-201ENSMUST00000027876 4368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm26657Q9CVR1 I730028E13Rik-201ENSMUST00000216012 1959 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm26657Q9CVR1 Mcm9-206ENSMUST00000220007 3513 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
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