Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQA6

Chchd1, Coiled-coil-helix-coiled-coil-helix domain-containing protein 1, mousemouse

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Length 118 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chchd1Q9CQA6 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Chchd1Q9CQA6 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Chchd1Q9CQA6 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Chchd1Q9CQA6 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Chchd1Q9CQA6 Gabbr1-203ENSMUST00000172792 4036 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Chchd1Q9CQA6 Emilin1-201ENSMUST00000031055 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Chchd1Q9CQA6 Tfdp2-205ENSMUST00000179416 2408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Chchd1Q9CQA6 Cd33-201ENSMUST00000004728 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Chchd1Q9CQA6 Mamdc4-202ENSMUST00000114223 3998 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Chchd1Q9CQA6 Gm44851-201ENSMUST00000205735 2309 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Chchd1Q9CQA6 Tfe3-205ENSMUST00000115678 2658 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Chchd1Q9CQA6 Oasl1-202ENSMUST00000112143 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Chchd1Q9CQA6 Inpp4b-215ENSMUST00000217122 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Chchd1Q9CQA6 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Chchd1Q9CQA6 Zrsr2-201ENSMUST00000090840 3867 ntTSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Chchd1Q9CQA6 Hcls1-201ENSMUST00000023531 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Chchd1Q9CQA6 Armcx2-201ENSMUST00000035559 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Chchd1Q9CQA6 Tmem104-202ENSMUST00000100235 4561 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Chchd1Q9CQA6 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Chchd1Q9CQA6 Nyap1-202ENSMUST00000118326 4565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Chchd1Q9CQA6 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Chchd1Q9CQA6 Tmem104-201ENSMUST00000061450 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Chchd1Q9CQA6 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Chchd1Q9CQA6 Prpf19-203ENSMUST00000179297 6035 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Chchd1Q9CQA6 Hdac10-201ENSMUST00000082197 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Chchd1Q9CQA6 Fgfr3-211ENSMUST00000171509 4020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.76
Chchd1Q9CQA6 Arl13b-201ENSMUST00000089289 3528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Chchd1Q9CQA6 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Chchd1Q9CQA6 Ednrb-203ENSMUST00000227824 2669 ntAPPRIS P1 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Chchd1Q9CQA6 Gm28729-201ENSMUST00000190704 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Chchd1Q9CQA6 Fbf1-202ENSMUST00000106435 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Chchd1Q9CQA6 Rps6kb1-202ENSMUST00000058286 3250 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Chchd1Q9CQA6 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Chchd1Q9CQA6 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Chchd1Q9CQA6 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Chchd1Q9CQA6 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Chchd1Q9CQA6 Baiap2l2-205ENSMUST00000170955 1058 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Chchd1Q9CQA6 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Chchd1Q9CQA6 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Chchd1Q9CQA6 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Chchd1Q9CQA6 1700080E11Rik-202ENSMUST00000190661 682 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Chchd1Q9CQA6 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Chchd1Q9CQA6 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Chchd1Q9CQA6 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Chchd1Q9CQA6 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Chchd1Q9CQA6 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Chchd1Q9CQA6 Rgs12-207ENSMUST00000114285 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Chchd1Q9CQA6 Spata33-202ENSMUST00000212161 2941 ntTSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Chchd1Q9CQA6 Dmbt1-201ENSMUST00000084509 6243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Chchd1Q9CQA6 Wscd1-201ENSMUST00000021168 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Chchd1Q9CQA6 Slc26a6-201ENSMUST00000098376 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Chchd1Q9CQA6 Mul1-202ENSMUST00000105813 3944 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Chchd1Q9CQA6 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Chchd1Q9CQA6 Zfp57-201ENSMUST00000069250 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Chchd1Q9CQA6 Epm2aip1-202ENSMUST00000135807 4245 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Chchd1Q9CQA6 Gba-202ENSMUST00000167998 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Chchd1Q9CQA6 Pphln1-204ENSMUST00000165935 3473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Chchd1Q9CQA6 Thoc5-202ENSMUST00000101615 2116 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Chchd1Q9CQA6 Slc25a36-202ENSMUST00000085206 5227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Chchd1Q9CQA6 Rnf17-201ENSMUST00000095793 5264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Chchd1Q9CQA6 Dag1-204ENSMUST00000191899 5662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Chchd1Q9CQA6 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Chchd1Q9CQA6 Dcaf1-202ENSMUST00000159645 4945 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Chchd1Q9CQA6 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Chchd1Q9CQA6 Csrnp3-207ENSMUST00000145598 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Chchd1Q9CQA6 Ctbs-201ENSMUST00000029840 2629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Chchd1Q9CQA6 Ccdc134-201ENSMUST00000089174 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Chchd1Q9CQA6 Mypn-202ENSMUST00000218978 1833 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Chchd1Q9CQA6 Tppp-201ENSMUST00000022057 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Chchd1Q9CQA6 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Chchd1Q9CQA6 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Chchd1Q9CQA6 Sh3tc1-201ENSMUST00000070203 4549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Chchd1Q9CQA6 Gm28323-201ENSMUST00000186817 2499 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Chchd1Q9CQA6 Gm5608-201ENSMUST00000210253 2290 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Chchd1Q9CQA6 Rtn4rl1-201ENSMUST00000102514 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Chchd1Q9CQA6 Gprc5a-201ENSMUST00000050104 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Chchd1Q9CQA6 D030025P21Rik-202ENSMUST00000220643 3987 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Chchd1Q9CQA6 Mutyh-201ENSMUST00000102699 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Chchd1Q9CQA6 2810407A14Rik-201ENSMUST00000069809 1699 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Chchd1Q9CQA6 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Chchd1Q9CQA6 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Chchd1Q9CQA6 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Chchd1Q9CQA6 Ebf2-202ENSMUST00000176029 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Chchd1Q9CQA6 Gm10097-201ENSMUST00000180100 2784 ntAPPRIS P1 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Chchd1Q9CQA6 Slc25a40-201ENSMUST00000066921 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Chchd1Q9CQA6 Plekhb1-204ENSMUST00000107045 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Chchd1Q9CQA6 Hexim2-201ENSMUST00000062530 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Chchd1Q9CQA6 Zbtb2-202ENSMUST00000100078 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Chchd1Q9CQA6 F420014N23Rik-201ENSMUST00000181578 2396 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Chchd1Q9CQA6 Ackr4-202ENSMUST00000076147 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Chchd1Q9CQA6 2900026A02Rik-203ENSMUST00000212276 5864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Chchd1Q9CQA6 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Chchd1Q9CQA6 Camta2-202ENSMUST00000100933 4383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Chchd1Q9CQA6 Camta2-204ENSMUST00000108545 4377 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Chchd1Q9CQA6 Camta2-206ENSMUST00000120261 4398 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Chchd1Q9CQA6 Kif1a-202ENSMUST00000112958 5931 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Chchd1Q9CQA6 Cyp8b1-201ENSMUST00000062474 1950 ntAPPRIS P1 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Chchd1Q9CQA6 Rbm4b-201ENSMUST00000036744 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Chchd1Q9CQA6 Kif26b-201ENSMUST00000160789 6216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Chchd1Q9CQA6 Kdm4d-201ENSMUST00000058796 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
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