Protein–RNA interactions for Protein: Q99MR6

Srrt, Serrate RNA effector molecule homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 875 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrrtQ99MR6 Neu2-204ENSMUST00000165109 1824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SrrtQ99MR6 Gnb5-202ENSMUST00000213990 1803 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SrrtQ99MR6 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SrrtQ99MR6 Bcas3-201ENSMUST00000074875 2814 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SrrtQ99MR6 Shc1-203ENSMUST00000107417 3079 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SrrtQ99MR6 Adamts20-204ENSMUST00000155907 6886 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SrrtQ99MR6 Gm44414-201ENSMUST00000203660 2109 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
SrrtQ99MR6 Lrrc34-201ENSMUST00000029252 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SrrtQ99MR6 C530008M17Rik-202ENSMUST00000120639 6826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SrrtQ99MR6 C530008M17Rik-211ENSMUST00000163347 6835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SrrtQ99MR6 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SrrtQ99MR6 Esr2-201ENSMUST00000076634 3288 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SrrtQ99MR6 Higd1a-205ENSMUST00000215007 1980 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SrrtQ99MR6 Adgrv1-205ENSMUST00000126444 3823 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SrrtQ99MR6 Gm10176-201ENSMUST00000159707 2264 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
SrrtQ99MR6 Hnrnpf-203ENSMUST00000167182 2271 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SrrtQ99MR6 Spin1-201ENSMUST00000095797 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SrrtQ99MR6 Eef1d-206ENSMUST00000109975 2842 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SrrtQ99MR6 Dnpep-203ENSMUST00000185419 2833 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SrrtQ99MR6 4931428F04Rik-203ENSMUST00000212219 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SrrtQ99MR6 Epha8-201ENSMUST00000030420 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SrrtQ99MR6 Enc1-201ENSMUST00000041623 4737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SrrtQ99MR6 Ddx39b-202ENSMUST00000172549 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SrrtQ99MR6 Uqcrq-201ENSMUST00000061326 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SrrtQ99MR6 Gm12786-201ENSMUST00000129617 644 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SrrtQ99MR6 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SrrtQ99MR6 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SrrtQ99MR6 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
SrrtQ99MR6 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
SrrtQ99MR6 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SrrtQ99MR6 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SrrtQ99MR6 Plagl1-202ENSMUST00000121646 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SrrtQ99MR6 Gm45751-201ENSMUST00000210185 1573 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
SrrtQ99MR6 Arhgap28-201ENSMUST00000024840 5322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SrrtQ99MR6 Gdap1l1-202ENSMUST00000109420 2475 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SrrtQ99MR6 Gm34006-202ENSMUST00000216467 1918 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SrrtQ99MR6 Def8-203ENSMUST00000093049 1909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SrrtQ99MR6 Phldb1-218ENSMUST00000156918 3485 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SrrtQ99MR6 Lnx1-205ENSMUST00000117525 2259 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SrrtQ99MR6 Ablim2-209ENSMUST00000129347 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SrrtQ99MR6 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SrrtQ99MR6 Gm4782-201ENSMUST00000168705 2046 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
SrrtQ99MR6 1810008I18Rik-201ENSMUST00000185464 2419 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
SrrtQ99MR6 Pag1-204ENSMUST00000161949 8256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SrrtQ99MR6 Hmga2-203ENSMUST00000159699 3810 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SrrtQ99MR6 Lctl-201ENSMUST00000034969 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SrrtQ99MR6 Prkce-202ENSMUST00000097275 6254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SrrtQ99MR6 Gm43134-201ENSMUST00000199434 1886 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
SrrtQ99MR6 Ugt1a8-201ENSMUST00000113139 2227 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SrrtQ99MR6 Tmem201-202ENSMUST00000103208 3620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SrrtQ99MR6 Zbtb7b-203ENSMUST00000107433 3650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SrrtQ99MR6 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SrrtQ99MR6 Epb41l2-201ENSMUST00000053748 4385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SrrtQ99MR6 Rgs12-202ENSMUST00000087684 4713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SrrtQ99MR6 Tmem132e-202ENSMUST00000092852 4105 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SrrtQ99MR6 Polr3g-201ENSMUST00000048993 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SrrtQ99MR6 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SrrtQ99MR6 Gm15917-201ENSMUST00000162771 487 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SrrtQ99MR6 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SrrtQ99MR6 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
SrrtQ99MR6 Gm44241-201ENSMUST00000203230 1662 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
SrrtQ99MR6 Tmprss9-203ENSMUST00000219817 3581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SrrtQ99MR6 5930412G12Rik-203ENSMUST00000134673 2087 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SrrtQ99MR6 Slc38a10-204ENSMUST00000103018 4578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SrrtQ99MR6 Nfat5-201ENSMUST00000075922 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SrrtQ99MR6 Anapc11-201ENSMUST00000026128 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SrrtQ99MR6 Acin1-219ENSMUST00000148754 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
SrrtQ99MR6 Dgcr14-201ENSMUST00000003621 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SrrtQ99MR6 Acbd5-213ENSMUST00000227809 1986 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
SrrtQ99MR6 Eme1-201ENSMUST00000039949 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SrrtQ99MR6 Ahcyl2-205ENSMUST00000125911 2039 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
SrrtQ99MR6 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SrrtQ99MR6 Ciz1-202ENSMUST00000113331 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SrrtQ99MR6 Shroom1-201ENSMUST00000018531 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SrrtQ99MR6 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
SrrtQ99MR6 Muc6-202ENSMUST00000189314 5087 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SrrtQ99MR6 Tmem186-201ENSMUST00000052505 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SrrtQ99MR6 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
SrrtQ99MR6 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SrrtQ99MR6 Wfdc2-201ENSMUST00000017867 849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SrrtQ99MR6 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SrrtQ99MR6 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
SrrtQ99MR6 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SrrtQ99MR6 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SrrtQ99MR6 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SrrtQ99MR6 Rap1gap2-202ENSMUST00000102521 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SrrtQ99MR6 Sarm1-201ENSMUST00000061174 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SrrtQ99MR6 Prss36-202ENSMUST00000118755 3028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SrrtQ99MR6 Zbtb20-201ENSMUST00000079441 3086 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SrrtQ99MR6 Kcnn2-201ENSMUST00000066890 3682 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SrrtQ99MR6 Ext1-201ENSMUST00000077273 7663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SrrtQ99MR6 Phka1-206ENSMUST00000122022 6115 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SrrtQ99MR6 Phka1-202ENSMUST00000052012 6115 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SrrtQ99MR6 Pdlim3-203ENSMUST00000210422 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SrrtQ99MR6 Rab11fip1-202ENSMUST00000054212 7965 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SrrtQ99MR6 Zmynd15-202ENSMUST00000092958 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SrrtQ99MR6 Ehd1-201ENSMUST00000025684 3353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SrrtQ99MR6 AC114543.1-201ENSMUST00000226451 1558 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
SrrtQ99MR6 Sgce-205ENSMUST00000115579 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SrrtQ99MR6 Spock3-201ENSMUST00000093480 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.1 ms