Protein–RNA interactions for Protein: Q99ME6

Atp1b4, Protein ATP1B4, mousemouse

Predictions only

Length 356 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp1b4Q99ME6 Gstt3-201ENSMUST00000001715 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Atp1b4Q99ME6 Zmynd15-202ENSMUST00000092958 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Atp1b4Q99ME6 Casp7-201ENSMUST00000026062 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Atp1b4Q99ME6 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Atp1b4Q99ME6 Canx-201ENSMUST00000020637 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Atp1b4Q99ME6 Mir686-201ENSMUST00000102174 109 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Atp1b4Q99ME6 Styxl1-202ENSMUST00000111161 963 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Atp1b4Q99ME6 Mypopos-201ENSMUST00000124897 560 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Atp1b4Q99ME6 Dgcr6-203ENSMUST00000143343 1280 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Atp1b4Q99ME6 Gm2164-201ENSMUST00000184062 424 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Atp1b4Q99ME6 Gm18056-201ENSMUST00000207670 568 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Atp1b4Q99ME6 Gm18061-201ENSMUST00000208350 562 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Atp1b4Q99ME6 Gm18063-201ENSMUST00000208529 568 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Atp1b4Q99ME6 Gm18052-201ENSMUST00000208750 559 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Atp1b4Q99ME6 Gm17870-201ENSMUST00000219489 1174 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Atp1b4Q99ME6 Cryba4-201ENSMUST00000086629 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Atp1b4Q99ME6 Gm11563-201ENSMUST00000092695 1012 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Atp1b4Q99ME6 Olfr61-202ENSMUST00000210241 1348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Atp1b4Q99ME6 Socs5-201ENSMUST00000041369 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Atp1b4Q99ME6 Syt10-201ENSMUST00000029441 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Atp1b4Q99ME6 Knop1-204ENSMUST00000106550 5524 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Atp1b4Q99ME6 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Atp1b4Q99ME6 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Atp1b4Q99ME6 Cand1-201ENSMUST00000020315 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Atp1b4Q99ME6 Megf6-201ENSMUST00000030897 6851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Atp1b4Q99ME6 Gm38577-201ENSMUST00000221531 4545 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Atp1b4Q99ME6 Fam76a-201ENSMUST00000030696 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Atp1b4Q99ME6 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Atp1b4Q99ME6 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Atp1b4Q99ME6 Zkscan14-203ENSMUST00000198959 2243 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Atp1b4Q99ME6 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Atp1b4Q99ME6 Pex2-202ENSMUST00000071280 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Atp1b4Q99ME6 Nbeal2-206ENSMUST00000133191 8782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Atp1b4Q99ME6 Neurog3-201ENSMUST00000050103 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Atp1b4Q99ME6 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Atp1b4Q99ME6 Tmem159-202ENSMUST00000118737 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Atp1b4Q99ME6 Tmem254b-202ENSMUST00000100806 1108 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Atp1b4Q99ME6 Tmem254a-201ENSMUST00000100811 1108 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Atp1b4Q99ME6 Mapkapk5-205ENSMUST00000111786 975 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Atp1b4Q99ME6 Gm16124-201ENSMUST00000146938 516 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Atp1b4Q99ME6 Gm17344-201ENSMUST00000171173 1159 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Atp1b4Q99ME6 Gm18827-201ENSMUST00000188341 790 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Atp1b4Q99ME6 Gm28511-201ENSMUST00000191594 450 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Atp1b4Q99ME6 Myl10-202ENSMUST00000196068 911 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Atp1b4Q99ME6 Myl10-203ENSMUST00000196436 598 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Atp1b4Q99ME6 Myl10-204ENSMUST00000197186 607 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Atp1b4Q99ME6 Gm33474-201ENSMUST00000199486 1231 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Atp1b4Q99ME6 1110006O24Rik-201ENSMUST00000201728 768 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Atp1b4Q99ME6 Gm43763-201ENSMUST00000201761 683 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Atp1b4Q99ME6 Gm7783-201ENSMUST00000204795 781 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Atp1b4Q99ME6 AC133598.1-201ENSMUST00000224327 660 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Atp1b4Q99ME6 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Atp1b4Q99ME6 P4hb-201ENSMUST00000026122 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Atp1b4Q99ME6 Dnmt3b-205ENSMUST00000103150 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Atp1b4Q99ME6 Sipa1-202ENSMUST00000080824 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Atp1b4Q99ME6 Mllt10-203ENSMUST00000114671 5063 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Atp1b4Q99ME6 Rpn1-201ENSMUST00000032143 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Atp1b4Q99ME6 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Atp1b4Q99ME6 Adcyap1r1-202ENSMUST00000070756 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Atp1b4Q99ME6 Gm17705-201ENSMUST00000172285 1555 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Atp1b4Q99ME6 Tbx6-202ENSMUST00000172352 1529 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Atp1b4Q99ME6 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Atp1b4Q99ME6 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Atp1b4Q99ME6 Gm13342-201ENSMUST00000121055 207 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Atp1b4Q99ME6 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Atp1b4Q99ME6 Gm12945-201ENSMUST00000140080 674 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Atp1b4Q99ME6 Crb3-204ENSMUST00000163763 868 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Atp1b4Q99ME6 Gm42627-201ENSMUST00000197347 224 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Atp1b4Q99ME6 Dkkl1-204ENSMUST00000210741 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Atp1b4Q99ME6 Gm18935-201ENSMUST00000212692 664 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Atp1b4Q99ME6 AC131997.1-201ENSMUST00000228611 1229 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Atp1b4Q99ME6 Fuom-201ENSMUST00000026539 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Atp1b4Q99ME6 Rwdd3-201ENSMUST00000039761 1145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Atp1b4Q99ME6 Tmem40-201ENSMUST00000072933 1272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Atp1b4Q99ME6 Cep170b-201ENSMUST00000092279 3817 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Atp1b4Q99ME6 Prmt2-201ENSMUST00000020452 2016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Atp1b4Q99ME6 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Atp1b4Q99ME6 Vapb-201ENSMUST00000067530 7029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Atp1b4Q99ME6 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Atp1b4Q99ME6 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Atp1b4Q99ME6 Atp2a3-202ENSMUST00000108484 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Atp1b4Q99ME6 Dhdds-204ENSMUST00000105887 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Atp1b4Q99ME6 1700029H14Rik-205ENSMUST00000187391 1408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Atp1b4Q99ME6 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Atp1b4Q99ME6 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Atp1b4Q99ME6 Krt40-201ENSMUST00000074253 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Atp1b4Q99ME6 Adal-204ENSMUST00000110665 2356 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Atp1b4Q99ME6 Psme2b-201ENSMUST00000104958 837 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Atp1b4Q99ME6 Inca1-203ENSMUST00000108542 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Atp1b4Q99ME6 Gm14508-201ENSMUST00000127049 901 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Atp1b4Q99ME6 Gm12315-201ENSMUST00000151599 911 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Atp1b4Q99ME6 Gm5741-201ENSMUST00000177563 328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Atp1b4Q99ME6 Gm45233-201ENSMUST00000203633 898 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Atp1b4Q99ME6 AC164612.1-201ENSMUST00000216699 517 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Atp1b4Q99ME6 AC159747.1-201ENSMUST00000219903 265 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Atp1b4Q99ME6 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Atp1b4Q99ME6 Aspdh-201ENSMUST00000035929 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Atp1b4Q99ME6 Tldc2-201ENSMUST00000099140 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Atp1b4Q99ME6 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Atp1b4Q99ME6 Ccdc190-201ENSMUST00000094348 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.7 ms