Protein–RNA interactions for Protein: Q99JY6

Higd1b, HIG1 domain family member 1B, mousemouse

Predictions only

Length 98 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Higd1bQ99JY6 Golim4-202ENSMUST00000117242 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Higd1bQ99JY6 2310035C23Rik-201ENSMUST00000039173 4328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Higd1bQ99JY6 Bcl7a-201ENSMUST00000031391 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Higd1bQ99JY6 Akr1d1-201ENSMUST00000040987 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Higd1bQ99JY6 Scin-202ENSMUST00000078481 2654 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Higd1bQ99JY6 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Higd1bQ99JY6 Trpv4-202ENSMUST00000112217 2436 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Higd1bQ99JY6 Pou2f2-203ENSMUST00000108415 7095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Higd1bQ99JY6 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Higd1bQ99JY6 Tnfaip8-207ENSMUST00000148159 1921 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Higd1bQ99JY6 Zfp207-206ENSMUST00000165565 2311 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Higd1bQ99JY6 Fbln1-201ENSMUST00000057410 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Higd1bQ99JY6 5930412G12Rik-203ENSMUST00000134673 2087 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Higd1bQ99JY6 AC122228.1-201ENSMUST00000223113 2057 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Higd1bQ99JY6 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Higd1bQ99JY6 Vps4b-201ENSMUST00000094646 4633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Higd1bQ99JY6 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Higd1bQ99JY6 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Higd1bQ99JY6 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Higd1bQ99JY6 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Higd1bQ99JY6 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Higd1bQ99JY6 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Higd1bQ99JY6 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Higd1bQ99JY6 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Higd1bQ99JY6 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Higd1bQ99JY6 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Higd1bQ99JY6 Gm30934-201ENSMUST00000215803 815 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Higd1bQ99JY6 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Higd1bQ99JY6 Erg-201ENSMUST00000077773 2232 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Higd1bQ99JY6 Neu2-204ENSMUST00000165109 1824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Higd1bQ99JY6 Gm10728-201ENSMUST00000194292 1829 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Higd1bQ99JY6 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Higd1bQ99JY6 Tlk2-209ENSMUST00000145048 2776 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Higd1bQ99JY6 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Higd1bQ99JY6 4930453N24Rik-201ENSMUST00000076991 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Higd1bQ99JY6 Setdb1-203ENSMUST00000107171 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Higd1bQ99JY6 Tspan5-202ENSMUST00000119993 2107 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Higd1bQ99JY6 Pyroxd1-201ENSMUST00000041852 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Higd1bQ99JY6 Edc3-201ENSMUST00000043990 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Higd1bQ99JY6 Mff-201ENSMUST00000073025 1706 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Higd1bQ99JY6 Fhl4-202ENSMUST00000216889 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Higd1bQ99JY6 Tcp10b-202ENSMUST00000116666 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Higd1bQ99JY6 Renbp-209ENSMUST00000155597 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Higd1bQ99JY6 Crhr2-208ENSMUST00000212633 2041 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Higd1bQ99JY6 Zfp575-201ENSMUST00000094705 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Higd1bQ99JY6 2810430I11Rik-201ENSMUST00000154246 3416 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Higd1bQ99JY6 Gtf2a1l-201ENSMUST00000024970 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Higd1bQ99JY6 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Higd1bQ99JY6 Parp16-201ENSMUST00000069000 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Higd1bQ99JY6 Zer1-202ENSMUST00000113677 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Higd1bQ99JY6 Max-201ENSMUST00000082136 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Higd1bQ99JY6 Def8-203ENSMUST00000093049 1909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Higd1bQ99JY6 Cwc27-201ENSMUST00000022228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Higd1bQ99JY6 Draxin-201ENSMUST00000030862 5200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Higd1bQ99JY6 Csnk1a1-202ENSMUST00000163205 3204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Higd1bQ99JY6 BC030867-201ENSMUST00000100392 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Higd1bQ99JY6 Tspan32-206ENSMUST00000105925 1376 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Higd1bQ99JY6 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Higd1bQ99JY6 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Higd1bQ99JY6 Fermt2-201ENSMUST00000045905 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Higd1bQ99JY6 Clcn3-201ENSMUST00000004430 4175 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Higd1bQ99JY6 Kdm3a-214ENSMUST00000207023 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Higd1bQ99JY6 Rps6kb1-207ENSMUST00000154617 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Higd1bQ99JY6 Col14a1-203ENSMUST00000110221 5679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Higd1bQ99JY6 Galnt6-202ENSMUST00000159715 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Higd1bQ99JY6 Dpp8-201ENSMUST00000034960 4808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Higd1bQ99JY6 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Higd1bQ99JY6 1500015A07Rik-201ENSMUST00000184181 1865 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Higd1bQ99JY6 Hhipl2-202ENSMUST00000192527 2310 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Higd1bQ99JY6 Gm29741-201ENSMUST00000192667 421 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Higd1bQ99JY6 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Higd1bQ99JY6 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Higd1bQ99JY6 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Higd1bQ99JY6 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Higd1bQ99JY6 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Higd1bQ99JY6 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Higd1bQ99JY6 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Higd1bQ99JY6 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Higd1bQ99JY6 Myo1d-202ENSMUST00000070997 3106 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Higd1bQ99JY6 C3-201ENSMUST00000024988 5136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Higd1bQ99JY6 Slc12a8-202ENSMUST00000117134 2081 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Higd1bQ99JY6 H2-Q6-202ENSMUST00000174699 2085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Higd1bQ99JY6 Strada-201ENSMUST00000007444 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Higd1bQ99JY6 Evc2-201ENSMUST00000056365 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Higd1bQ99JY6 Cep295nl-201ENSMUST00000103024 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Higd1bQ99JY6 Gm34006-202ENSMUST00000216467 1918 ntTSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Higd1bQ99JY6 Leng8-203ENSMUST00000121270 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Higd1bQ99JY6 Rcsd1-202ENSMUST00000097474 5001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Higd1bQ99JY6 Bcl11a-202ENSMUST00000109514 5989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Higd1bQ99JY6 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Higd1bQ99JY6 Srms-201ENSMUST00000016498 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Higd1bQ99JY6 Cacna1c-225ENSMUST00000219223 7483 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Higd1bQ99JY6 Rlbp1-201ENSMUST00000053718 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Higd1bQ99JY6 Kcnt1-204ENSMUST00000114176 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Higd1bQ99JY6 Gm17435-202ENSMUST00000212699 1998 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Higd1bQ99JY6 I730028E13Rik-201ENSMUST00000216012 1959 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Higd1bQ99JY6 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Higd1bQ99JY6 Klhl18-201ENSMUST00000068025 4530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Higd1bQ99JY6 Eif5b-201ENSMUST00000027252 7797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Higd1bQ99JY6 Vmn1r45-207ENSMUST00000228492 2849 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.6 ms