Protein–RNA interactions for Protein: Q922J3

Clip1, CAP-Gly domain-containing linker protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clip1Q922J3 Mlx-202ENSMUST00000107302 1826 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Clip1Q922J3 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
Clip1Q922J3 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Clip1Q922J3 Ccdc185-201ENSMUST00000060041 2055 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
Clip1Q922J3 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Clip1Q922J3 Alas1-201ENSMUST00000074082 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Clip1Q922J3 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Clip1Q922J3 Dnajb6-210ENSMUST00000196528 1018 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Clip1Q922J3 Gm44069-201ENSMUST00000204898 506 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Clip1Q922J3 Msra-205ENSMUST00000210428 1180 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Clip1Q922J3 Fgf2-201ENSMUST00000038885 462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Clip1Q922J3 Gm16372-201ENSMUST00000073088 450 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Clip1Q922J3 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Clip1Q922J3 Gm43650-201ENSMUST00000197337 1382 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Clip1Q922J3 Gm30214-201ENSMUST00000199271 1383 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Clip1Q922J3 Skp1a-201ENSMUST00000037324 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Clip1Q922J3 Mettl17-206ENSMUST00000164902 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Clip1Q922J3 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Clip1Q922J3 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Clip1Q922J3 Gm38197-201ENSMUST00000192320 2122 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Clip1Q922J3 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Clip1Q922J3 Lsm14b-202ENSMUST00000058764 2566 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Clip1Q922J3 Gm2895-201ENSMUST00000171591 3194 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Clip1Q922J3 Lrguk-202ENSMUST00000101564 967 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Clip1Q922J3 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Clip1Q922J3 Nt5c3b-203ENSMUST00000107397 1348 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Clip1Q922J3 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Clip1Q922J3 Fgf8-203ENSMUST00000111924 630 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Clip1Q922J3 Rasgrp2-207ENSMUST00000113475 573 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Clip1Q922J3 Isg20-204ENSMUST00000121645 1087 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Clip1Q922J3 Prss41-202ENSMUST00000122936 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Clip1Q922J3 Borcs5-202ENSMUST00000166591 792 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Clip1Q922J3 Gm45720-201ENSMUST00000211881 484 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
Clip1Q922J3 AI463170-204ENSMUST00000220157 447 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
Clip1Q922J3 Gm4935-201ENSMUST00000221316 1198 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Clip1Q922J3 AC173210.1-201ENSMUST00000222341 1131 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Clip1Q922J3 Rwdd3-201ENSMUST00000039761 1145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Clip1Q922J3 7420426K07Rik-201ENSMUST00000098460 1504 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
Clip1Q922J3 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Clip1Q922J3 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Clip1Q922J3 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Clip1Q922J3 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Clip1Q922J3 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Clip1Q922J3 Sf3a2-203ENSMUST00000148665 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Clip1Q922J3 Scrn3-202ENSMUST00000112050 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Clip1Q922J3 Gm15684-201ENSMUST00000160605 1814 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Clip1Q922J3 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC21.27■■□□□ 1
Clip1Q922J3 AC139350.1-201ENSMUST00000227064 1594 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Clip1Q922J3 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Clip1Q922J3 Krt40-201ENSMUST00000074253 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Clip1Q922J3 Rpl3-ps2-201ENSMUST00000117131 1214 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Clip1Q922J3 Gm25261-201ENSMUST00000157416 134 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Clip1Q922J3 Asgr1-201ENSMUST00000018699 1259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Clip1Q922J3 Gm5850-201ENSMUST00000192923 1206 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Clip1Q922J3 AC140406.1-201ENSMUST00000226481 465 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Clip1Q922J3 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Clip1Q922J3 Gal3st4-203ENSMUST00000161647 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Clip1Q922J3 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Clip1Q922J3 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Clip1Q922J3 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Clip1Q922J3 5830462O15Rik-201ENSMUST00000214603 1655 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Clip1Q922J3 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Clip1Q922J3 4933431E20Rik-209ENSMUST00000146337 1636 ntTSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
Clip1Q922J3 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Clip1Q922J3 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Clip1Q922J3 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Clip1Q922J3 Pja1-203ENSMUST00000113792 3038 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
Clip1Q922J3 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Clip1Q922J3 Rasgef1b-209ENSMUST00000168092 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Clip1Q922J3 Rasgef1b-201ENSMUST00000031276 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Clip1Q922J3 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Clip1Q922J3 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Clip1Q922J3 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Clip1Q922J3 Dlgap4-201ENSMUST00000000094 1411 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Clip1Q922J3 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Clip1Q922J3 Gm6447-201ENSMUST00000118905 835 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Clip1Q922J3 Hoxb5os-202ENSMUST00000150698 596 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Clip1Q922J3 Pced1c-ps-201ENSMUST00000187740 751 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Clip1Q922J3 2310040G24Rik-202ENSMUST00000189386 775 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Clip1Q922J3 2610300A13Rik-201ENSMUST00000192930 503 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Clip1Q922J3 Il15-202ENSMUST00000209363 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Clip1Q922J3 Hbb-bs-201ENSMUST00000023934 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Clip1Q922J3 2010300F17Rik-202ENSMUST00000181758 2493 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Clip1Q922J3 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Clip1Q922J3 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Clip1Q922J3 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Clip1Q922J3 Ric8b-202ENSMUST00000095385 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Clip1Q922J3 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Clip1Q922J3 Klhl12-203ENSMUST00000116528 3277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Clip1Q922J3 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Clip1Q922J3 Nab1-204ENSMUST00000170269 1371 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Clip1Q922J3 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Clip1Q922J3 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Clip1Q922J3 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Clip1Q922J3 Gm12329-201ENSMUST00000120829 1007 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Clip1Q922J3 Pcp2-206ENSMUST00000144977 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Clip1Q922J3 Cd180-203ENSMUST00000170878 842 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Clip1Q922J3 Cd180-205ENSMUST00000172138 518 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Clip1Q922J3 Gm2164-201ENSMUST00000184062 424 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Clip1Q922J3 Gm27516-201ENSMUST00000184237 98 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42 ms