Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCH8

Ubxn4, UBX domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 506 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubxn4Q8VCH8 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ubxn4Q8VCH8 Lmntd2-201ENSMUST00000026573 2095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ubxn4Q8VCH8 5031415H12Rik-201ENSMUST00000181546 2481 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ubxn4Q8VCH8 Scin-202ENSMUST00000078481 2654 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ubxn4Q8VCH8 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ubxn4Q8VCH8 Bap1-201ENSMUST00000022458 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ubxn4Q8VCH8 Setdb1-203ENSMUST00000107171 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ubxn4Q8VCH8 Itga3-203ENSMUST00000120375 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ubxn4Q8VCH8 Ggnbp1-203ENSMUST00000133257 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ubxn4Q8VCH8 Sox17-206ENSMUST00000192650 3242 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ubxn4Q8VCH8 Alg2-201ENSMUST00000044148 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ubxn4Q8VCH8 Abi1-201ENSMUST00000078977 3027 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ubxn4Q8VCH8 Txlng-203ENSMUST00000112315 2525 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ubxn4Q8VCH8 Tceanc2-202ENSMUST00000057043 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ubxn4Q8VCH8 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ubxn4Q8VCH8 Clec18a-203ENSMUST00000188466 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ubxn4Q8VCH8 Clec18a-201ENSMUST00000039597 1998 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ubxn4Q8VCH8 Gm7899-201ENSMUST00000192935 1897 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Ubxn4Q8VCH8 Pdpn-201ENSMUST00000030317 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ubxn4Q8VCH8 Il34-204ENSMUST00000150680 1796 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ubxn4Q8VCH8 Ppt2-201ENSMUST00000064953 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ubxn4Q8VCH8 Mutyh-201ENSMUST00000102699 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ubxn4Q8VCH8 Olfr160-203ENSMUST00000215727 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ubxn4Q8VCH8 Bcat1-202ENSMUST00000048252 1642 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ubxn4Q8VCH8 Map4k2-201ENSMUST00000025897 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ubxn4Q8VCH8 Oxr1-204ENSMUST00000110297 4596 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ubxn4Q8VCH8 Wasl-201ENSMUST00000031695 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ubxn4Q8VCH8 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ubxn4Q8VCH8 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ubxn4Q8VCH8 Ccdc24-209ENSMUST00000171052 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ubxn4Q8VCH8 Gm27631-201ENSMUST00000184163 466 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Ubxn4Q8VCH8 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ubxn4Q8VCH8 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ubxn4Q8VCH8 Mark2-201ENSMUST00000025921 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ubxn4Q8VCH8 Ppip5k2-202ENSMUST00000112845 6239 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ubxn4Q8VCH8 Rims1-205ENSMUST00000097811 6446 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ubxn4Q8VCH8 Kars-202ENSMUST00000093120 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ubxn4Q8VCH8 Pgpep1-201ENSMUST00000070173 4883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ubxn4Q8VCH8 Lrriq4-201ENSMUST00000108265 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ubxn4Q8VCH8 Ces2e-202ENSMUST00000109410 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ubxn4Q8VCH8 Mrgprh-201ENSMUST00000075296 1809 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ubxn4Q8VCH8 Tmem132e-202ENSMUST00000092852 4105 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ubxn4Q8VCH8 Pi4kb-201ENSMUST00000072287 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ubxn4Q8VCH8 Ctsa-203ENSMUST00000103093 2534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ubxn4Q8VCH8 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ubxn4Q8VCH8 Fam43a-201ENSMUST00000059078 3075 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ubxn4Q8VCH8 Dysf-213ENSMUST00000203803 6590 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ubxn4Q8VCH8 Evi5l-203ENSMUST00000176149 3938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ubxn4Q8VCH8 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ubxn4Q8VCH8 Park7-205ENSMUST00000105676 582 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ubxn4Q8VCH8 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ubxn4Q8VCH8 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Ubxn4Q8VCH8 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ubxn4Q8VCH8 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Ubxn4Q8VCH8 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Ubxn4Q8VCH8 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Ubxn4Q8VCH8 Cox10-201ENSMUST00000049091 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ubxn4Q8VCH8 Ccdc185-201ENSMUST00000060041 2055 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ubxn4Q8VCH8 Gm35339-201ENSMUST00000208833 5090 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ubxn4Q8VCH8 Cbl-206ENSMUST00000206147 3452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ubxn4Q8VCH8 Mettl11b-201ENSMUST00000159679 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ubxn4Q8VCH8 Sesn3-207ENSMUST00000209187 1700 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ubxn4Q8VCH8 Gm5422-202ENSMUST00000216161 2928 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ubxn4Q8VCH8 Sv2c-203ENSMUST00000182289 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ubxn4Q8VCH8 Tcf4-258ENSMUST00000202937 2103 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ubxn4Q8VCH8 Exd2-201ENSMUST00000038185 3310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ubxn4Q8VCH8 Ankrd13c-201ENSMUST00000040787 3903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ubxn4Q8VCH8 Nfic-202ENSMUST00000078185 3163 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ubxn4Q8VCH8 Gpc2-205ENSMUST00000161827 2586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ubxn4Q8VCH8 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ubxn4Q8VCH8 Tnrc6c-201ENSMUST00000026658 8724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ubxn4Q8VCH8 Oxa1l-201ENSMUST00000000985 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ubxn4Q8VCH8 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ubxn4Q8VCH8 C77080-203ENSMUST00000106051 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ubxn4Q8VCH8 C77080-202ENSMUST00000097873 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ubxn4Q8VCH8 Sertad2-203ENSMUST00000109586 5515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ubxn4Q8VCH8 Irx6-201ENSMUST00000034185 3370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ubxn4Q8VCH8 Smim17-203ENSMUST00000161855 664 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ubxn4Q8VCH8 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ubxn4Q8VCH8 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Ubxn4Q8VCH8 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Ubxn4Q8VCH8 Armcx1-202ENSMUST00000051256 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ubxn4Q8VCH8 Spef1-202ENSMUST00000110218 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ubxn4Q8VCH8 Gm45242-201ENSMUST00000210666 2129 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Ubxn4Q8VCH8 Igfals-201ENSMUST00000050714 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ubxn4Q8VCH8 Esyt3-201ENSMUST00000042158 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ubxn4Q8VCH8 Spon1-201ENSMUST00000046687 6161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ubxn4Q8VCH8 Rbl1-201ENSMUST00000029170 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ubxn4Q8VCH8 Igf2r-201ENSMUST00000024599 8887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ubxn4Q8VCH8 Il20ra-201ENSMUST00000020185 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ubxn4Q8VCH8 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ubxn4Q8VCH8 Apbb1-212ENSMUST00000189072 2085 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ubxn4Q8VCH8 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ubxn4Q8VCH8 Sema6c-203ENSMUST00000107217 3595 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ubxn4Q8VCH8 Gpsm2-201ENSMUST00000029482 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ubxn4Q8VCH8 Phkg1-201ENSMUST00000026617 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ubxn4Q8VCH8 Gm10369-201ENSMUST00000100641 1148 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ubxn4Q8VCH8 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Ubxn4Q8VCH8 Nudcd2-203ENSMUST00000127382 727 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ubxn4Q8VCH8 Gm15701-201ENSMUST00000129559 573 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.2 ms