Protein–RNA interactions for Protein: Q8R4U6

Top1mt, DNA topoisomerase I, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 593 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top1mtQ8R4U6 Rbm47-206ENSMUST00000200775 3180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Top1mtQ8R4U6 Aurka-203ENSMUST00000109140 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Top1mtQ8R4U6 Brinp1-201ENSMUST00000030036 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Top1mtQ8R4U6 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Top1mtQ8R4U6 Kcnk13-202ENSMUST00000160413 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Top1mtQ8R4U6 Tmem30a-201ENSMUST00000034878 3658 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Top1mtQ8R4U6 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Top1mtQ8R4U6 Eml3-201ENSMUST00000096241 3322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Top1mtQ8R4U6 Ppp1r18-205ENSMUST00000187690 3185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Top1mtQ8R4U6 Nphp4-202ENSMUST00000081393 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Top1mtQ8R4U6 Tspyl5-201ENSMUST00000042021 4010 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Top1mtQ8R4U6 Mark2-201ENSMUST00000025921 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Top1mtQ8R4U6 Cabp7-201ENSMUST00000009219 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Top1mtQ8R4U6 Gm20632-201ENSMUST00000176760 2427 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Top1mtQ8R4U6 Ephx2-201ENSMUST00000070515 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Top1mtQ8R4U6 Sipa1-201ENSMUST00000071857 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Top1mtQ8R4U6 Mpped1-203ENSMUST00000109470 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Top1mtQ8R4U6 1600014C10Rik-205ENSMUST00000178876 3283 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Top1mtQ8R4U6 Nptn-206ENSMUST00000176557 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Top1mtQ8R4U6 Sdha-201ENSMUST00000022062 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Top1mtQ8R4U6 Myg1-202ENSMUST00000113682 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Top1mtQ8R4U6 Gosr2-202ENSMUST00000107013 1044 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Top1mtQ8R4U6 Gm14719-201ENSMUST00000121891 340 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Top1mtQ8R4U6 1700060J05Rik-201ENSMUST00000138377 1060 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Top1mtQ8R4U6 Gm15948-201ENSMUST00000150616 403 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Top1mtQ8R4U6 Gm21854-201ENSMUST00000179901 471 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Top1mtQ8R4U6 4833428L15Rik-201ENSMUST00000181230 1259 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Top1mtQ8R4U6 Gm43691-201ENSMUST00000196625 697 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Top1mtQ8R4U6 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Top1mtQ8R4U6 Mrpl36-201ENSMUST00000022098 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Top1mtQ8R4U6 AC154595.3-201ENSMUST00000224579 384 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Top1mtQ8R4U6 Car5a-201ENSMUST00000057653 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Top1mtQ8R4U6 Il11ra1-203ENSMUST00000108041 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Top1mtQ8R4U6 Gm13305-201ENSMUST00000098121 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Top1mtQ8R4U6 Aff2-201ENSMUST00000033532 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Top1mtQ8R4U6 AC154262.2-201ENSMUST00000224310 2293 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Top1mtQ8R4U6 Cmip-201ENSMUST00000095172 2276 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Top1mtQ8R4U6 Gm29154-231ENSMUST00000215120 1367 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Top1mtQ8R4U6 Prss23-201ENSMUST00000041761 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Top1mtQ8R4U6 Sema4b-201ENSMUST00000032754 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Top1mtQ8R4U6 Cdkn2aip-201ENSMUST00000038738 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Top1mtQ8R4U6 Srrm1-202ENSMUST00000084846 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Top1mtQ8R4U6 Syt6-203ENSMUST00000118117 1856 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Top1mtQ8R4U6 Kif21b-201ENSMUST00000075164 9115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Top1mtQ8R4U6 Tmed8-201ENSMUST00000037418 7409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Top1mtQ8R4U6 Ccser2-202ENSMUST00000090024 7509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Top1mtQ8R4U6 Tbx4-201ENSMUST00000000096 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Top1mtQ8R4U6 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Top1mtQ8R4U6 Cd99l2-204ENSMUST00000114587 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Top1mtQ8R4U6 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Top1mtQ8R4U6 Rnaseh2a-206ENSMUST00000128972 1141 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Top1mtQ8R4U6 Gm13994-201ENSMUST00000137397 513 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Top1mtQ8R4U6 Gm12352-201ENSMUST00000154452 760 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Top1mtQ8R4U6 Ppt2-202ENSMUST00000166040 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Top1mtQ8R4U6 Gm43303-201ENSMUST00000200133 669 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Top1mtQ8R4U6 AI463170-204ENSMUST00000220157 447 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Top1mtQ8R4U6 AC165157.4-201ENSMUST00000220587 139 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Top1mtQ8R4U6 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Top1mtQ8R4U6 Dnmt3b-209ENSMUST00000109773 4148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Top1mtQ8R4U6 Gypc-202ENSMUST00000174000 2072 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Top1mtQ8R4U6 Gm18244-201ENSMUST00000219747 1566 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Top1mtQ8R4U6 Mbp-207ENSMUST00000114674 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Top1mtQ8R4U6 Gan-201ENSMUST00000064488 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Top1mtQ8R4U6 A530083I20Rik-201ENSMUST00000180486 2421 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Top1mtQ8R4U6 CT030684.3-201ENSMUST00000227308 2445 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Top1mtQ8R4U6 Art3-208ENSMUST00000121096 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Top1mtQ8R4U6 Mfsd4b4-202ENSMUST00000178563 3523 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Top1mtQ8R4U6 Wapl-205ENSMUST00000169910 4066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Top1mtQ8R4U6 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Top1mtQ8R4U6 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Top1mtQ8R4U6 Shmt2-206ENSMUST00000219239 2238 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Top1mtQ8R4U6 Ugt1a5-201ENSMUST00000097659 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Top1mtQ8R4U6 Aurkc-204ENSMUST00000208049 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Top1mtQ8R4U6 Degs2-202ENSMUST00000167978 1729 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Top1mtQ8R4U6 Iffo2-202ENSMUST00000123827 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Top1mtQ8R4U6 1700065D16Rik-205ENSMUST00000190890 2903 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Top1mtQ8R4U6 Stpg2-202ENSMUST00000106239 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Top1mtQ8R4U6 Hapln4-201ENSMUST00000007738 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Top1mtQ8R4U6 Pip5k1c-201ENSMUST00000045469 4323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Top1mtQ8R4U6 Col6a2-202ENSMUST00000105413 4653 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Top1mtQ8R4U6 Pltp-203ENSMUST00000109317 1575 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Top1mtQ8R4U6 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Top1mtQ8R4U6 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Top1mtQ8R4U6 Mcee-203ENSMUST00000206194 532 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Top1mtQ8R4U6 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Top1mtQ8R4U6 Mrps21-202ENSMUST00000072587 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Top1mtQ8R4U6 Gtf2ird1-229ENSMUST00000202554 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Top1mtQ8R4U6 Gm37691-201ENSMUST00000192147 2573 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Top1mtQ8R4U6 4933430H06Rik-201ENSMUST00000200924 1343 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Top1mtQ8R4U6 Epb41l2-201ENSMUST00000053748 4385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Top1mtQ8R4U6 Pbrm1-203ENSMUST00000052239 5065 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Top1mtQ8R4U6 Tcirg1-211ENSMUST00000145791 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Top1mtQ8R4U6 Rnf114-201ENSMUST00000078050 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Top1mtQ8R4U6 Endov-202ENSMUST00000106244 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Top1mtQ8R4U6 Mief1-201ENSMUST00000023048 5081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Top1mtQ8R4U6 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Top1mtQ8R4U6 Opa3-201ENSMUST00000063976 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Top1mtQ8R4U6 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Top1mtQ8R4U6 Ldlrad3-201ENSMUST00000058790 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Top1mtQ8R4U6 Agpat4-201ENSMUST00000024594 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.9 ms