Protein–RNA interactions for Protein: Q8K3P5

Cnot6, CCR4-NOT transcription complex subunit 6, mousemouse

Predictions only

Length 557 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnot6Q8K3P5 Gm25548-201ENSMUST00000178681 110 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Cnot6Q8K3P5 Gm23147-201ENSMUST00000178841 110 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Cnot6Q8K3P5 Gm26095-201ENSMUST00000179270 110 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Cnot6Q8K3P5 Gm22171-201ENSMUST00000179283 110 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Cnot6Q8K3P5 Gm23936-201ENSMUST00000179354 110 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Cnot6Q8K3P5 Gm22619-201ENSMUST00000179516 110 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Cnot6Q8K3P5 Gm25255-201ENSMUST00000179579 110 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Cnot6Q8K3P5 Gm24755-201ENSMUST00000179691 110 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Cnot6Q8K3P5 Gm26506-201ENSMUST00000179692 110 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Cnot6Q8K3P5 Gm25086-201ENSMUST00000179931 110 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Cnot6Q8K3P5 Gm23243-201ENSMUST00000180047 110 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Cnot6Q8K3P5 Gm24659-201ENSMUST00000180212 110 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Cnot6Q8K3P5 Gm24169-201ENSMUST00000180244 110 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Cnot6Q8K3P5 Gm23689-201ENSMUST00000180354 110 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Cnot6Q8K3P5 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cnot6Q8K3P5 Gm27359-201ENSMUST00000184153 110 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Cnot6Q8K3P5 Gm27785-201ENSMUST00000184268 110 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Cnot6Q8K3P5 Gm27466-201ENSMUST00000184396 110 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Cnot6Q8K3P5 Gm27703-201ENSMUST00000184836 110 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Cnot6Q8K3P5 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cnot6Q8K3P5 AC131690.1-201ENSMUST00000218406 374 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Cnot6Q8K3P5 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Cnot6Q8K3P5 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cnot6Q8K3P5 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cnot6Q8K3P5 Sgsm1-201ENSMUST00000048112 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cnot6Q8K3P5 AC117194.1-201ENSMUST00000224847 3002 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Cnot6Q8K3P5 Setdb2-201ENSMUST00000095775 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cnot6Q8K3P5 Siglecf-203ENSMUST00000122423 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cnot6Q8K3P5 Gm1113-201ENSMUST00000183573 2434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cnot6Q8K3P5 Phf21b-201ENSMUST00000016768 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cnot6Q8K3P5 Enc1-201ENSMUST00000041623 4737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cnot6Q8K3P5 Trim15-201ENSMUST00000025329 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cnot6Q8K3P5 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cnot6Q8K3P5 Cplx4-201ENSMUST00000025397 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cnot6Q8K3P5 Prss36-202ENSMUST00000118755 3028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cnot6Q8K3P5 Slitrk3-201ENSMUST00000059407 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cnot6Q8K3P5 Atg7-207ENSMUST00000182428 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cnot6Q8K3P5 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cnot6Q8K3P5 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cnot6Q8K3P5 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cnot6Q8K3P5 Ckmt1-202ENSMUST00000078222 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cnot6Q8K3P5 Zbtb7b-203ENSMUST00000107433 3650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cnot6Q8K3P5 Bach2-201ENSMUST00000037416 3462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cnot6Q8K3P5 Sbsn-201ENSMUST00000080518 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cnot6Q8K3P5 Lmod3-201ENSMUST00000095655 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cnot6Q8K3P5 Kmt5b-205ENSMUST00000113972 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cnot6Q8K3P5 Nob1-201ENSMUST00000003946 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cnot6Q8K3P5 Ap4b1-203ENSMUST00000106823 2741 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cnot6Q8K3P5 Gpr153-203ENSMUST00000105651 3777 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cnot6Q8K3P5 Gpr153-201ENSMUST00000055754 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cnot6Q8K3P5 C1qtnf1-202ENSMUST00000106286 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cnot6Q8K3P5 C1qtnf1-201ENSMUST00000017590 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cnot6Q8K3P5 Otud4-203ENSMUST00000173286 7213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cnot6Q8K3P5 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cnot6Q8K3P5 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cnot6Q8K3P5 Mmab-202ENSMUST00000112245 644 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cnot6Q8K3P5 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cnot6Q8K3P5 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cnot6Q8K3P5 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cnot6Q8K3P5 Dctn6-201ENSMUST00000033913 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cnot6Q8K3P5 Exoc6b-203ENSMUST00000160197 5439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cnot6Q8K3P5 Spock3-202ENSMUST00000117377 3066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cnot6Q8K3P5 Calcr-203ENSMUST00000168592 2064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cnot6Q8K3P5 Ralgapb-203ENSMUST00000109486 8383 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cnot6Q8K3P5 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cnot6Q8K3P5 Lrrc8a-202ENSMUST00000113654 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cnot6Q8K3P5 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cnot6Q8K3P5 Ankfn1-201ENSMUST00000050983 2665 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cnot6Q8K3P5 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cnot6Q8K3P5 Galnt6-201ENSMUST00000052069 3798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cnot6Q8K3P5 Alkbh3os1-201ENSMUST00000028621 1549 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cnot6Q8K3P5 Dsp-202ENSMUST00000127906 7761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cnot6Q8K3P5 Dido1-207ENSMUST00000130986 4898 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cnot6Q8K3P5 Mypn-202ENSMUST00000218978 1833 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cnot6Q8K3P5 Fam46a-201ENSMUST00000034802 5479 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cnot6Q8K3P5 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cnot6Q8K3P5 Nectin4-202ENSMUST00000094325 3245 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cnot6Q8K3P5 Micu1-202ENSMUST00000092508 2294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cnot6Q8K3P5 Pds5b-201ENSMUST00000016569 7417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cnot6Q8K3P5 Fam53b-201ENSMUST00000065371 5052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cnot6Q8K3P5 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cnot6Q8K3P5 Hlcs-202ENSMUST00000163193 5371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cnot6Q8K3P5 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cnot6Q8K3P5 Hnrnpf-210ENSMUST00000180341 1922 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cnot6Q8K3P5 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cnot6Q8K3P5 Tcf4-210ENSMUST00000128706 2066 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cnot6Q8K3P5 Mpp4-210ENSMUST00000191200 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cnot6Q8K3P5 Pex12-207ENSMUST00000176518 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cnot6Q8K3P5 Sema4a-213ENSMUST00000165898 3125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cnot6Q8K3P5 Ubr7-201ENSMUST00000046404 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cnot6Q8K3P5 Oasl1-202ENSMUST00000112143 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cnot6Q8K3P5 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Cnot6Q8K3P5 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cnot6Q8K3P5 Opa1-206ENSMUST00000160597 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cnot6Q8K3P5 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cnot6Q8K3P5 Gm20036-201ENSMUST00000177547 844 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cnot6Q8K3P5 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cnot6Q8K3P5 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cnot6Q8K3P5 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Cnot6Q8K3P5 AC123645.1-201ENSMUST00000228469 605 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.1 ms