Protein–RNA interactions for Protein: Q8K330

Ssh3, Protein phosphatase Slingshot homolog 3, mousemouse

Predictions only

Length 649 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssh3Q8K330 Lhx1-201ENSMUST00000018842 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Ssh3Q8K330 Hist1h3h-201ENSMUST00000188775 411 ntAPPRIS P1 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Ssh3Q8K330 Hist1h3i-201ENSMUST00000189457 411 ntAPPRIS P1 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Ssh3Q8K330 Ighv8-14-201ENSMUST00000196781 358 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
Ssh3Q8K330 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
Ssh3Q8K330 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Ssh3Q8K330 Ndufc2-201ENSMUST00000032882 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Ssh3Q8K330 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Ssh3Q8K330 Gstm1-201ENSMUST00000004140 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Ssh3Q8K330 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Ssh3Q8K330 Cep97-202ENSMUST00000117468 2887 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Ssh3Q8K330 Fnbp1-209ENSMUST00000113562 4515 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Ssh3Q8K330 Snx29-207ENSMUST00000180792 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Ssh3Q8K330 Men1-207ENSMUST00000113503 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Ssh3Q8K330 AC121801.1-201ENSMUST00000225363 1899 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
Ssh3Q8K330 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Ssh3Q8K330 Atg16l1-202ENSMUST00000113186 3004 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Ssh3Q8K330 Zdhhc23-201ENSMUST00000036321 1380 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Ssh3Q8K330 Adra1b-201ENSMUST00000067258 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Ssh3Q8K330 Otop2-202ENSMUST00000106544 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Ssh3Q8K330 Ints13-201ENSMUST00000032427 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Ssh3Q8K330 Spata21-201ENSMUST00000051907 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Ssh3Q8K330 G3bp2-203ENSMUST00000167918 4232 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Ssh3Q8K330 Rap2b-201ENSMUST00000049064 6793 ntAPPRIS P1 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Ssh3Q8K330 Samd7-201ENSMUST00000108262 3144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Ssh3Q8K330 Tshz2-202ENSMUST00000109159 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Ssh3Q8K330 Pnkd-201ENSMUST00000027370 2937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Ssh3Q8K330 Magi1-206ENSMUST00000203688 4969 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Ssh3Q8K330 Egfem1-201ENSMUST00000118531 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Ssh3Q8K330 Gm38355-201ENSMUST00000192514 1570 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
Ssh3Q8K330 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Ssh3Q8K330 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
Ssh3Q8K330 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
Ssh3Q8K330 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Ssh3Q8K330 1700110K17Rik-202ENSMUST00000156511 927 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Ssh3Q8K330 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Ssh3Q8K330 Ndufa8-201ENSMUST00000070112 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Ssh3Q8K330 Vldlr-207ENSMUST00000167487 7971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Ssh3Q8K330 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Ssh3Q8K330 Ubqln5-201ENSMUST00000053743 1915 ntAPPRIS P1 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Ssh3Q8K330 Taf7l-201ENSMUST00000009740 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Ssh3Q8K330 Gm38376-201ENSMUST00000195493 2253 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
Ssh3Q8K330 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Ssh3Q8K330 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
Ssh3Q8K330 Zfp711-202ENSMUST00000113409 4330 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Ssh3Q8K330 Glud1-201ENSMUST00000022322 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Ssh3Q8K330 Hipk4-202ENSMUST00000108353 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Ssh3Q8K330 Anapc7-202ENSMUST00000119792 3599 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Ssh3Q8K330 Kifc3-202ENSMUST00000169353 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Ssh3Q8K330 Eif3j1-201ENSMUST00000028668 5413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Ssh3Q8K330 Vwf-202ENSMUST00000112253 2184 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Ssh3Q8K330 Mrpl58-209ENSMUST00000153983 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Ssh3Q8K330 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Ssh3Q8K330 Ero1lb-202ENSMUST00000220811 3341 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Ssh3Q8K330 Nfya-212ENSMUST00000162460 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Ssh3Q8K330 Abcg8-203ENSMUST00000171915 2284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Ssh3Q8K330 Tnip1-204ENSMUST00000108885 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Ssh3Q8K330 Ankfn1-201ENSMUST00000050983 2665 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Ssh3Q8K330 Plch2-201ENSMUST00000105631 5053 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Ssh3Q8K330 Pcdhgb1-201ENSMUST00000192931 4723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Ssh3Q8K330 Pcdhga9-201ENSMUST00000091935 4724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Ssh3Q8K330 Ccser2-202ENSMUST00000090024 7509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Ssh3Q8K330 Kif3c-205ENSMUST00000220210 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Ssh3Q8K330 Gm27194-201ENSMUST00000175753 2936 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
Ssh3Q8K330 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Ssh3Q8K330 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Ssh3Q8K330 Car4-201ENSMUST00000103194 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Ssh3Q8K330 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
Ssh3Q8K330 Eif4g1-205ENSMUST00000115461 5507 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Ssh3Q8K330 Gm10044-204ENSMUST00000170177 659 ntTSL 3 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Ssh3Q8K330 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Ssh3Q8K330 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Ssh3Q8K330 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Ssh3Q8K330 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Ssh3Q8K330 Tmem86b-204ENSMUST00000206610 522 ntTSL 3 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Ssh3Q8K330 Gm7030-201ENSMUST00000046131 913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Ssh3Q8K330 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Ssh3Q8K330 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
Ssh3Q8K330 Il1rapl2-202ENSMUST00000113063 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Ssh3Q8K330 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Ssh3Q8K330 Sorbs1-203ENSMUST00000165212 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Ssh3Q8K330 Slc34a3-201ENSMUST00000006638 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Ssh3Q8K330 9130008F23Rik-201ENSMUST00000068258 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Ssh3Q8K330 Cuedc2-201ENSMUST00000051234 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Ssh3Q8K330 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Ssh3Q8K330 Slc25a18-201ENSMUST00000112682 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Ssh3Q8K330 Erc1-207ENSMUST00000183911 3865 ntTSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Ssh3Q8K330 Zfp853-201ENSMUST00000180336 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Ssh3Q8K330 Rsl1-201ENSMUST00000021997 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Ssh3Q8K330 Wls-205ENSMUST00000198878 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Ssh3Q8K330 Adamts20-204ENSMUST00000155907 6886 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Ssh3Q8K330 Slc38a7-204ENSMUST00000212270 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Ssh3Q8K330 Psrc1-202ENSMUST00000102629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Ssh3Q8K330 Camk2d-202ENSMUST00000066466 4075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Ssh3Q8K330 4931406C07Rik-208ENSMUST00000216955 1750 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Ssh3Q8K330 Pip5k1c-201ENSMUST00000045469 4323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Ssh3Q8K330 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Ssh3Q8K330 Gm24543-201ENSMUST00000103867 82 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
Ssh3Q8K330 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Ssh3Q8K330 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 76 ms