Protein–RNA interactions for Protein: Q8K284

Gtf3c1, General transcription factor 3C polypeptide 1, mousemouse

Predictions only

Length 2,101 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf3c1Q8K284 Rufy3-203ENSMUST00000196894 3703 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gtf3c1Q8K284 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gtf3c1Q8K284 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gtf3c1Q8K284 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gtf3c1Q8K284 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gtf3c1Q8K284 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gtf3c1Q8K284 1500011K16Rik-201ENSMUST00000135091 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gtf3c1Q8K284 Gm14230-202ENSMUST00000137463 874 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gtf3c1Q8K284 Gm29585-203ENSMUST00000188089 835 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gtf3c1Q8K284 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gtf3c1Q8K284 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gtf3c1Q8K284 Rap1gap-203ENSMUST00000105835 4140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gtf3c1Q8K284 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gtf3c1Q8K284 Stx4a-202ENSMUST00000121705 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gtf3c1Q8K284 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gtf3c1Q8K284 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gtf3c1Q8K284 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gtf3c1Q8K284 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gtf3c1Q8K284 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gtf3c1Q8K284 Arr3-201ENSMUST00000113769 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gtf3c1Q8K284 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gtf3c1Q8K284 Ppp2r5c-204ENSMUST00000221074 1971 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gtf3c1Q8K284 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gtf3c1Q8K284 Gm11725-201ENSMUST00000125607 1850 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gtf3c1Q8K284 AI480526-203ENSMUST00000160099 1017 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gtf3c1Q8K284 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gtf3c1Q8K284 Gm4610-201ENSMUST00000198222 905 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gtf3c1Q8K284 Ldha-213ENSMUST00000210631 685 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gtf3c1Q8K284 Gm6015-201ENSMUST00000217493 1586 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Gtf3c1Q8K284 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gtf3c1Q8K284 H2afv-201ENSMUST00000093346 519 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gtf3c1Q8K284 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gtf3c1Q8K284 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gtf3c1Q8K284 Gm26788-201ENSMUST00000181692 1750 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gtf3c1Q8K284 Cnbd2-202ENSMUST00000073942 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gtf3c1Q8K284 Prdx2-203ENSMUST00000109734 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gtf3c1Q8K284 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
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Gtf3c1Q8K284 2900005J15Rik-202ENSMUST00000171190 2025 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Gtf3c1Q8K284 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gtf3c1Q8K284 Prss42-201ENSMUST00000035715 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gtf3c1Q8K284 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gtf3c1Q8K284 Rps19-203ENSMUST00000108430 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gtf3c1Q8K284 Gstt1-202ENSMUST00000120177 1105 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gtf3c1Q8K284 Gm11637-201ENSMUST00000120601 592 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Gtf3c1Q8K284 Tmem255b-202ENSMUST00000167505 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gtf3c1Q8K284 1700015O11Rik-201ENSMUST00000180964 678 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gtf3c1Q8K284 Gm27341-201ENSMUST00000183570 106 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Gtf3c1Q8K284 Prr29-204ENSMUST00000188561 592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gtf3c1Q8K284 Prr29-206ENSMUST00000190795 822 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gtf3c1Q8K284 Gsdmcl-ps-204ENSMUST00000191285 637 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gtf3c1Q8K284 Ggact-201ENSMUST00000038075 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gtf3c1Q8K284 Olfr223-201ENSMUST00000061293 1111 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gtf3c1Q8K284 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gtf3c1Q8K284 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Gtf3c1Q8K284 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gtf3c1Q8K284 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gtf3c1Q8K284 Sh2d7-202ENSMUST00000118413 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gtf3c1Q8K284 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gtf3c1Q8K284 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gtf3c1Q8K284 Cpped1-203ENSMUST00000121750 2614 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gtf3c1Q8K284 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gtf3c1Q8K284 Tnfaip8-207ENSMUST00000148159 1921 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gtf3c1Q8K284 Pou5f2-201ENSMUST00000175955 1394 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gtf3c1Q8K284 Pnoc-202ENSMUST00000224594 1388 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
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Gtf3c1Q8K284 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gtf3c1Q8K284 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
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Gtf3c1Q8K284 Gpr19-202ENSMUST00000066107 1647 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gtf3c1Q8K284 P2ry2-201ENSMUST00000037540 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gtf3c1Q8K284 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gtf3c1Q8K284 Gm4909-201ENSMUST00000118749 794 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Gtf3c1Q8K284 Prss41-202ENSMUST00000122936 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gtf3c1Q8K284 Gm15046-201ENSMUST00000130153 408 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gtf3c1Q8K284 BC046401-201ENSMUST00000155786 847 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gtf3c1Q8K284 Mir5120-201ENSMUST00000175020 78 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Gtf3c1Q8K284 Gm16505-201ENSMUST00000179981 232 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Gtf3c1Q8K284 Gm5565-201ENSMUST00000199463 1162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gtf3c1Q8K284 0610005C13Rik-202ENSMUST00000209510 671 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gtf3c1Q8K284 H2-M10.2-201ENSMUST00000023845 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gtf3c1Q8K284 Add2-203ENSMUST00000203279 1454 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gtf3c1Q8K284 Acsl6-201ENSMUST00000000145 2297 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gtf3c1Q8K284 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gtf3c1Q8K284 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gtf3c1Q8K284 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gtf3c1Q8K284 Gm14608-201ENSMUST00000120030 1553 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Gtf3c1Q8K284 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gtf3c1Q8K284 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gtf3c1Q8K284 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gtf3c1Q8K284 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gtf3c1Q8K284 Mmp21-201ENSMUST00000033278 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gtf3c1Q8K284 Gm16793-201ENSMUST00000181322 1680 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gtf3c1Q8K284 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Gtf3c1Q8K284 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gtf3c1Q8K284 Gm2694-202ENSMUST00000180806 1452 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gtf3c1Q8K284 Klhl21-201ENSMUST00000097773 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gtf3c1Q8K284 Madd-201ENSMUST00000066420 3753 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gtf3c1Q8K284 Fsd1-201ENSMUST00000011733 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
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