Protein–RNA interactions for Protein: Q8K268

Abcf3, ATP-binding cassette sub-family F member 3, mousemouse

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Length 709 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcf3Q8K268 Ccdc134-201ENSMUST00000089174 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Abcf3Q8K268 Spidr-201ENSMUST00000040248 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Abcf3Q8K268 Pcdha11-203ENSMUST00000192447 4583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Abcf3Q8K268 Cckar-201ENSMUST00000031093 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Abcf3Q8K268 Lzts3-202ENSMUST00000089561 4169 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Abcf3Q8K268 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Abcf3Q8K268 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Abcf3Q8K268 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Abcf3Q8K268 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Abcf3Q8K268 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Abcf3Q8K268 Arid3a-201ENSMUST00000019708 5361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Abcf3Q8K268 Msantd3-201ENSMUST00000061135 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Abcf3Q8K268 Cyth1-203ENSMUST00000106302 3119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Abcf3Q8K268 Eya1-203ENSMUST00000168081 4366 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Abcf3Q8K268 Olfr322-202ENSMUST00000213232 4632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Abcf3Q8K268 Ildr2-201ENSMUST00000111416 8251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Abcf3Q8K268 Necab1-202ENSMUST00000108273 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Abcf3Q8K268 Eme1-201ENSMUST00000039949 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Abcf3Q8K268 Edrf1-201ENSMUST00000051169 5424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Abcf3Q8K268 Ephb3-201ENSMUST00000006112 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Abcf3Q8K268 Armcx1-204ENSMUST00000113198 2085 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Abcf3Q8K268 Gm13730-201ENSMUST00000121036 1462 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Abcf3Q8K268 6030458C11Rik-202ENSMUST00000227299 3206 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Abcf3Q8K268 Myh7-201ENSMUST00000102803 6135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Abcf3Q8K268 Micu1-201ENSMUST00000020311 2336 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Abcf3Q8K268 Foxd4-201ENSMUST00000058600 2345 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Abcf3Q8K268 4931428F04Rik-203ENSMUST00000212219 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Abcf3Q8K268 Sesn3-207ENSMUST00000209187 1700 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Abcf3Q8K268 Dync1i1-204ENSMUST00000115559 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Abcf3Q8K268 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Abcf3Q8K268 Zfp595-205ENSMUST00000171466 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Abcf3Q8K268 Gm20700-201ENSMUST00000176749 2206 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Abcf3Q8K268 Stox2-201ENSMUST00000079195 10467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Abcf3Q8K268 Drc1-201ENSMUST00000101448 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Abcf3Q8K268 Grip1-212ENSMUST00000147356 4145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Abcf3Q8K268 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Abcf3Q8K268 Apaf1-207ENSMUST00000161987 2710 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Abcf3Q8K268 Atp6ap1-201ENSMUST00000019231 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Abcf3Q8K268 Camk2b-203ENSMUST00000066431 1603 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Abcf3Q8K268 2810403A07Rik-201ENSMUST00000029696 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Abcf3Q8K268 Alox12e-201ENSMUST00000019051 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Abcf3Q8K268 Nrp2-204ENSMUST00000102822 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Abcf3Q8K268 Cavin1-201ENSMUST00000060792 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Abcf3Q8K268 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Abcf3Q8K268 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Abcf3Q8K268 Dnmt1-207ENSMUST00000216540 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Abcf3Q8K268 Sec14l2-201ENSMUST00000003681 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Abcf3Q8K268 Rap1gds1-202ENSMUST00000098574 3669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Abcf3Q8K268 Dpp9-201ENSMUST00000038794 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Abcf3Q8K268 Naa15-205ENSMUST00000193266 7480 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
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Abcf3Q8K268 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
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Abcf3Q8K268 Psd-210ENSMUST00000225323 3398 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Abcf3Q8K268 Gpat3-201ENSMUST00000031255 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Abcf3Q8K268 Sh3bp2-201ENSMUST00000067638 2885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Abcf3Q8K268 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Abcf3Q8K268 Fam214b-205ENSMUST00000107959 3060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Abcf3Q8K268 Mocs2-208ENSMUST00000166176 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Abcf3Q8K268 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Abcf3Q8K268 Tmem181b-ps-203ENSMUST00000188746 1626 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Abcf3Q8K268 Gm15557-201ENSMUST00000109629 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Abcf3Q8K268 Ebna1bp2-201ENSMUST00000030501 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Abcf3Q8K268 Pigq-209ENSMUST00000140304 1835 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Abcf3Q8K268 Ppp6r1-201ENSMUST00000064099 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Abcf3Q8K268 Gm26788-201ENSMUST00000181692 1750 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Abcf3Q8K268 Fermt2-201ENSMUST00000045905 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Abcf3Q8K268 Stau1-201ENSMUST00000049412 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Abcf3Q8K268 Anks1b-221ENSMUST00000182786 3042 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Abcf3Q8K268 Baiap2l1-201ENSMUST00000055190 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Abcf3Q8K268 Dnmt3b-205ENSMUST00000103150 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Abcf3Q8K268 Gm20036-201ENSMUST00000177547 844 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Abcf3Q8K268 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Abcf3Q8K268 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Abcf3Q8K268 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Abcf3Q8K268 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
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Abcf3Q8K268 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
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Abcf3Q8K268 Cecr2-202ENSMUST00000112686 9212 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
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