Protein–RNA interactions for Protein: Q8CIX8

Lgsn, Lengsin, mousemouse

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LgsnQ8CIX8 Rpp21-201ENSMUST00000025319 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
LgsnQ8CIX8 Lamtor1-201ENSMUST00000033131 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
LgsnQ8CIX8 Phgr1-201ENSMUST00000061360 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
LgsnQ8CIX8 Polr2g-201ENSMUST00000096261 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
LgsnQ8CIX8 Enpp6-202ENSMUST00000119686 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
LgsnQ8CIX8 Osbpl11-201ENSMUST00000039733 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
LgsnQ8CIX8 Kcnk16-202ENSMUST00000225596 2127 ntBASIC15.05■□□□□ -0
LgsnQ8CIX8 Inpp5a-202ENSMUST00000097975 2301 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
LgsnQ8CIX8 Pak4-201ENSMUST00000032823 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
LgsnQ8CIX8 Slc25a37-201ENSMUST00000037064 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
LgsnQ8CIX8 Grin3a-202ENSMUST00000093859 7491 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
LgsnQ8CIX8 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LgsnQ8CIX8 Cacna2d2-204ENSMUST00000166799 3474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
LgsnQ8CIX8 Slc38a7-204ENSMUST00000212270 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LgsnQ8CIX8 Ddx23-201ENSMUST00000003450 3187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
LgsnQ8CIX8 Clec16a-205ENSMUST00000115827 2949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LgsnQ8CIX8 Mfge8-202ENSMUST00000107409 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LgsnQ8CIX8 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LgsnQ8CIX8 Phldb1-212ENSMUST00000138356 5600 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
LgsnQ8CIX8 Lenep-201ENSMUST00000057431 1806 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
LgsnQ8CIX8 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.04■□□□□ -0
LgsnQ8CIX8 Zfp683-201ENSMUST00000105884 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
LgsnQ8CIX8 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LgsnQ8CIX8 Rnd1-202ENSMUST00000109149 1034 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LgsnQ8CIX8 Rpl36al-203ENSMUST00000110620 757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
LgsnQ8CIX8 Gfpt1-203ENSMUST00000113657 1200 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LgsnQ8CIX8 3110053B16Rik-204ENSMUST00000145605 575 ntBASIC15.04■□□□□ -0
LgsnQ8CIX8 Gm6283-201ENSMUST00000182369 1000 ntBASIC15.04■□□□□ -0
LgsnQ8CIX8 H2-Bl-210ENSMUST00000195833 829 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LgsnQ8CIX8 Gm7653-201ENSMUST00000214567 508 ntBASIC15.04■□□□□ -0
LgsnQ8CIX8 Batf3-201ENSMUST00000027943 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LgsnQ8CIX8 Msgn1-201ENSMUST00000049877 613 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
LgsnQ8CIX8 Obp2a-201ENSMUST00000077667 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LgsnQ8CIX8 Cbl-206ENSMUST00000206147 3452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
LgsnQ8CIX8 Ilvbl-208ENSMUST00000218875 3020 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LgsnQ8CIX8 Pcdhgb8-202ENSMUST00000208907 2796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LgsnQ8CIX8 Bptf-202ENSMUST00000106762 11847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
LgsnQ8CIX8 Ska1-201ENSMUST00000040188 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LgsnQ8CIX8 Fam19a2-201ENSMUST00000050756 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LgsnQ8CIX8 Arhgap33-203ENSMUST00000207858 4337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LgsnQ8CIX8 Metap2-206ENSMUST00000180840 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LgsnQ8CIX8 Gm5639-201ENSMUST00000122305 2403 ntBASIC15.04■□□□□ -0
LgsnQ8CIX8 Nfix-203ENSMUST00000109762 2261 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LgsnQ8CIX8 Gspt1-205ENSMUST00000167571 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LgsnQ8CIX8 Hspa8-202ENSMUST00000117557 2019 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LgsnQ8CIX8 Il11-201ENSMUST00000094892 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LgsnQ8CIX8 Epsti1-201ENSMUST00000022591 1870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LgsnQ8CIX8 Gm29724-201ENSMUST00000214688 3062 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LgsnQ8CIX8 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LgsnQ8CIX8 Zfp57-201ENSMUST00000069250 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LgsnQ8CIX8 Tnk2-201ENSMUST00000115120 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LgsnQ8CIX8 B3galnt2-201ENSMUST00000099747 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LgsnQ8CIX8 Ggn-202ENSMUST00000098609 2653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LgsnQ8CIX8 Hells-201ENSMUST00000025965 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LgsnQ8CIX8 Ptpn11-202ENSMUST00000100770 5599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LgsnQ8CIX8 Esrrb-202ENSMUST00000110203 2363 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LgsnQ8CIX8 Slc39a8-202ENSMUST00000081978 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LgsnQ8CIX8 Pde7b-206ENSMUST00000170265 1380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
LgsnQ8CIX8 Rab37-201ENSMUST00000021076 2210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LgsnQ8CIX8 Gm12490-201ENSMUST00000120255 560 ntBASIC15.03■□□□□ -0
LgsnQ8CIX8 E130201H02Rik-201ENSMUST00000123576 851 ntBASIC15.03■□□□□ -0
LgsnQ8CIX8 Gm37917-201ENSMUST00000194711 392 ntBASIC15.03■□□□□ -0
LgsnQ8CIX8 Letm2-213ENSMUST00000211422 738 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
LgsnQ8CIX8 AC154239.3-201ENSMUST00000226933 674 ntBASIC15.03■□□□□ -0
LgsnQ8CIX8 2610528J11Rik-201ENSMUST00000030261 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LgsnQ8CIX8 Dhx9-202ENSMUST00000186380 4561 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
LgsnQ8CIX8 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LgsnQ8CIX8 Tbc1d4-209ENSMUST00000161991 6483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
LgsnQ8CIX8 Il1rapl2-202ENSMUST00000113063 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LgsnQ8CIX8 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LgsnQ8CIX8 B430212C06Rik-205ENSMUST00000145081 2623 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LgsnQ8CIX8 Pnck-201ENSMUST00000002087 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
LgsnQ8CIX8 Yes1-201ENSMUST00000072311 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
LgsnQ8CIX8 Gm26847-201ENSMUST00000180407 2109 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
LgsnQ8CIX8 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
LgsnQ8CIX8 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
LgsnQ8CIX8 Gm13883-201ENSMUST00000150450 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
LgsnQ8CIX8 Tm7sf2-203ENSMUST00000159084 1351 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
LgsnQ8CIX8 Hspa4-201ENSMUST00000020630 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
LgsnQ8CIX8 Tsku-206ENSMUST00000179780 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
LgsnQ8CIX8 Il17re-202ENSMUST00000058548 2940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
LgsnQ8CIX8 Nt5c3b-202ENSMUST00000092689 1344 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
LgsnQ8CIX8 Glud1-201ENSMUST00000022322 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
LgsnQ8CIX8 Slc13a5-201ENSMUST00000021161 3329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
LgsnQ8CIX8 Anapc15-204ENSMUST00000106973 650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
LgsnQ8CIX8 Id1-202ENSMUST00000109824 1160 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.02■□□□□ -0
LgsnQ8CIX8 Ngb-202ENSMUST00000110176 908 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
LgsnQ8CIX8 Mvk-203ENSMUST00000124260 1051 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
LgsnQ8CIX8 Cenpa-206ENSMUST00000149759 346 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
LgsnQ8CIX8 Hoxd8-203ENSMUST00000151380 557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
LgsnQ8CIX8 Gm23984-201ENSMUST00000157139 203 ntBASIC15.02■□□□□ -0
LgsnQ8CIX8 Gm20412-201ENSMUST00000173249 633 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
LgsnQ8CIX8 Gm4804-201ENSMUST00000182234 999 ntBASIC15.02■□□□□ -0
LgsnQ8CIX8 Gm11214-201ENSMUST00000184252 552 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
LgsnQ8CIX8 Gm8515-201ENSMUST00000194852 576 ntBASIC15.02■□□□□ -0
LgsnQ8CIX8 Tcta-203ENSMUST00000195615 597 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
LgsnQ8CIX8 Gm42846-201ENSMUST00000201771 514 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
LgsnQ8CIX8 Gm33045-202ENSMUST00000210049 975 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
LgsnQ8CIX8 Tssc1-207ENSMUST00000222407 489 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
LgsnQ8CIX8 AC139580.1-202ENSMUST00000223574 928 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.1 ms