Protein–RNA interactions for Protein: Q8CGC6

Rbm28, RNA-binding protein 28, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 750 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbm28Q8CGC6 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rbm28Q8CGC6 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rbm28Q8CGC6 Zfp711-202ENSMUST00000113409 4330 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rbm28Q8CGC6 Cyfip1-201ENSMUST00000032629 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rbm28Q8CGC6 Ppp1r18-206ENSMUST00000190496 1395 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rbm28Q8CGC6 Glmn-202ENSMUST00000082121 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rbm28Q8CGC6 Fgd6-201ENSMUST00000020208 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rbm28Q8CGC6 Capns2-201ENSMUST00000104947 1005 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rbm28Q8CGC6 Nedd8-201ENSMUST00000010520 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rbm28Q8CGC6 Shf-202ENSMUST00000110530 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rbm28Q8CGC6 Cd99l2-204ENSMUST00000114587 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rbm28Q8CGC6 Gm15824-201ENSMUST00000119516 955 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Rbm28Q8CGC6 Gm15821-201ENSMUST00000121995 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rbm28Q8CGC6 Gm17232-201ENSMUST00000164515 453 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rbm28Q8CGC6 Ccdc24-209ENSMUST00000171052 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rbm28Q8CGC6 Cks1b-201ENSMUST00000029679 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rbm28Q8CGC6 Kcnk9-201ENSMUST00000044624 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rbm28Q8CGC6 Tex13c3-201ENSMUST00000089246 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rbm28Q8CGC6 Gm5356-201ENSMUST00000093326 615 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Rbm28Q8CGC6 Wdr83-201ENSMUST00000093357 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rbm28Q8CGC6 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rbm28Q8CGC6 Popdc2-201ENSMUST00000023494 2169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rbm28Q8CGC6 AC159196.2-201ENSMUST00000224082 1622 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Rbm28Q8CGC6 Zscan22-203ENSMUST00000119989 2087 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rbm28Q8CGC6 Slc35b1-201ENSMUST00000021243 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rbm28Q8CGC6 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Rbm28Q8CGC6 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rbm28Q8CGC6 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rbm28Q8CGC6 Gm28182-201ENSMUST00000188354 2477 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Rbm28Q8CGC6 Krt36-201ENSMUST00000107416 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rbm28Q8CGC6 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rbm28Q8CGC6 Rdh10-201ENSMUST00000027053 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rbm28Q8CGC6 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rbm28Q8CGC6 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rbm28Q8CGC6 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rbm28Q8CGC6 Gm43056-201ENSMUST00000197865 2791 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Rbm28Q8CGC6 Gm28729-201ENSMUST00000190704 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rbm28Q8CGC6 Adarb1-201ENSMUST00000020496 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rbm28Q8CGC6 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rbm28Q8CGC6 Iah1-204ENSMUST00000223345 1890 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rbm28Q8CGC6 Mir692-1-201ENSMUST00000102263 109 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Rbm28Q8CGC6 Slc2a9-207ENSMUST00000143758 1296 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rbm28Q8CGC6 Tex22-203ENSMUST00000146107 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rbm28Q8CGC6 Gm27772-201ENSMUST00000184900 187 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Rbm28Q8CGC6 Gm34086-201ENSMUST00000196486 743 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rbm28Q8CGC6 Gm15411-202ENSMUST00000201913 668 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rbm28Q8CGC6 Gm6266-201ENSMUST00000203844 806 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Rbm28Q8CGC6 Gm44719-201ENSMUST00000206404 149 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Rbm28Q8CGC6 Gm18062-201ENSMUST00000208020 547 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Rbm28Q8CGC6 Gm18055-201ENSMUST00000208254 547 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Rbm28Q8CGC6 Ccdc159-204ENSMUST00000216710 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rbm28Q8CGC6 CT030704.2-201ENSMUST00000228887 494 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Rbm28Q8CGC6 Cmc2-201ENSMUST00000078589 523 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rbm28Q8CGC6 Mir497b-201ENSMUST00000093601 125 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Rbm28Q8CGC6 Syvn1-201ENSMUST00000025723 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rbm28Q8CGC6 Hlcs-202ENSMUST00000163193 5371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rbm28Q8CGC6 Zmym4-201ENSMUST00000106108 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rbm28Q8CGC6 2600006K01Rik-201ENSMUST00000047607 1406 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rbm28Q8CGC6 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rbm28Q8CGC6 Grin1-203ENSMUST00000114308 4165 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rbm28Q8CGC6 Exoc6b-203ENSMUST00000160197 5439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rbm28Q8CGC6 Tshz2-202ENSMUST00000109159 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rbm28Q8CGC6 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rbm28Q8CGC6 Map2k6-202ENSMUST00000100260 2088 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rbm28Q8CGC6 Dhrs3-207ENSMUST00000171001 1349 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rbm28Q8CGC6 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rbm28Q8CGC6 Gm26576-201ENSMUST00000181018 1977 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rbm28Q8CGC6 Apln-201ENSMUST00000039026 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rbm28Q8CGC6 Dnajc27-201ENSMUST00000020986 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rbm28Q8CGC6 Syce1-201ENSMUST00000026553 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rbm28Q8CGC6 Sipa1-202ENSMUST00000080824 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rbm28Q8CGC6 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rbm28Q8CGC6 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rbm28Q8CGC6 Ncdn-202ENSMUST00000106116 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rbm28Q8CGC6 Gm26788-201ENSMUST00000181692 1750 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rbm28Q8CGC6 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rbm28Q8CGC6 Zfp467-205ENSMUST00000114560 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rbm28Q8CGC6 Klhl12-203ENSMUST00000116528 3277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rbm28Q8CGC6 Crybb2-202ENSMUST00000112336 906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rbm28Q8CGC6 Dusp13-203ENSMUST00000120956 1070 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rbm28Q8CGC6 Cmc4-203ENSMUST00000149863 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rbm28Q8CGC6 Kctd17-202ENSMUST00000159771 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rbm28Q8CGC6 Gm27892-201ENSMUST00000185017 106 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Rbm28Q8CGC6 Gm29481-201ENSMUST00000189080 1049 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rbm28Q8CGC6 Selenoh-205ENSMUST00000189636 499 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rbm28Q8CGC6 Lcmt1-204ENSMUST00000206574 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rbm28Q8CGC6 Pomc-202ENSMUST00000218089 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rbm28Q8CGC6 Elane-201ENSMUST00000046091 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rbm28Q8CGC6 Swi5-201ENSMUST00000050410 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rbm28Q8CGC6 Tpm1-202ENSMUST00000034928 1824 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rbm28Q8CGC6 Clec4g-201ENSMUST00000058040 1441 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rbm28Q8CGC6 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rbm28Q8CGC6 Foxi2-201ENSMUST00000060356 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rbm28Q8CGC6 Plxdc1-203ENSMUST00000107565 2439 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rbm28Q8CGC6 Col6a2-202ENSMUST00000105413 4653 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rbm28Q8CGC6 Vav1-203ENSMUST00000112870 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rbm28Q8CGC6 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rbm28Q8CGC6 Tspan32-205ENSMUST00000105924 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rbm28Q8CGC6 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rbm28Q8CGC6 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
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