Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEQ0

Cdkl1, Cyclin-dependent kinase-like 1, mousemouse

Predictions only

Length 352 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdkl1Q8CEQ0 Pltp-203ENSMUST00000109317 1575 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Cdkl1Q8CEQ0 Ap3d1-201ENSMUST00000020420 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Cdkl1Q8CEQ0 Mettl14-201ENSMUST00000029759 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Cdkl1Q8CEQ0 Dlgap3-201ENSMUST00000046659 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Cdkl1Q8CEQ0 Src-202ENSMUST00000092576 3887 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Cdkl1Q8CEQ0 Slc8b1-204ENSMUST00000111890 2775 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Cdkl1Q8CEQ0 Pdlim5-208ENSMUST00000196220 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Cdkl1Q8CEQ0 Cog7-201ENSMUST00000057576 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Cdkl1Q8CEQ0 Serinc5-201ENSMUST00000049488 5366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Cdkl1Q8CEQ0 Kcnk13-204ENSMUST00000177549 3075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Cdkl1Q8CEQ0 Opa1-201ENSMUST00000038867 3230 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cdkl1Q8CEQ0 Nid2-201ENSMUST00000022340 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cdkl1Q8CEQ0 Otop2-202ENSMUST00000106544 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cdkl1Q8CEQ0 Radil-204ENSMUST00000110785 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cdkl1Q8CEQ0 Sema3f-204ENSMUST00000192727 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cdkl1Q8CEQ0 Bcl2l1-201ENSMUST00000007803 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cdkl1Q8CEQ0 Hist1h2be-202ENSMUST00000091704 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cdkl1Q8CEQ0 Matn3-201ENSMUST00000020899 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cdkl1Q8CEQ0 Abr-205ENSMUST00000108408 3534 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cdkl1Q8CEQ0 Gtf2ird1-229ENSMUST00000202554 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cdkl1Q8CEQ0 Mbd3-202ENSMUST00000105347 914 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cdkl1Q8CEQ0 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cdkl1Q8CEQ0 Cd99l2-204ENSMUST00000114587 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cdkl1Q8CEQ0 Ptgr2-205ENSMUST00000135001 1286 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cdkl1Q8CEQ0 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cdkl1Q8CEQ0 Fam219aos-201ENSMUST00000151164 708 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cdkl1Q8CEQ0 Lcmt1-204ENSMUST00000206574 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cdkl1Q8CEQ0 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cdkl1Q8CEQ0 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cdkl1Q8CEQ0 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cdkl1Q8CEQ0 Olfr975-201ENSMUST00000054067 933 ntAPPRIS P1 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cdkl1Q8CEQ0 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cdkl1Q8CEQ0 Olfr222-201ENSMUST00000071943 1115 ntAPPRIS P1 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cdkl1Q8CEQ0 Acp5-202ENSMUST00000115315 1349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cdkl1Q8CEQ0 2600006K01Rik-201ENSMUST00000047607 1406 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cdkl1Q8CEQ0 Reck-201ENSMUST00000030198 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cdkl1Q8CEQ0 2610507B11Rik-201ENSMUST00000010421 7443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cdkl1Q8CEQ0 Gale-201ENSMUST00000102540 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cdkl1Q8CEQ0 Gm9946-202ENSMUST00000162741 1580 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cdkl1Q8CEQ0 Gad1-205ENSMUST00000130998 1705 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cdkl1Q8CEQ0 Ap1s2-201ENSMUST00000033734 1785 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cdkl1Q8CEQ0 Rbm42-201ENSMUST00000042726 1784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cdkl1Q8CEQ0 Gm28386-201ENSMUST00000189147 1849 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Cdkl1Q8CEQ0 Xlr-202ENSMUST00000067782 1860 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cdkl1Q8CEQ0 BC006965-201ENSMUST00000124028 1952 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cdkl1Q8CEQ0 Gm5124-201ENSMUST00000127554 1970 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cdkl1Q8CEQ0 Ak1-202ENSMUST00000113277 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cdkl1Q8CEQ0 Esm1-201ENSMUST00000038144 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cdkl1Q8CEQ0 Gm38197-201ENSMUST00000192320 2122 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Cdkl1Q8CEQ0 Lmod3-201ENSMUST00000095655 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cdkl1Q8CEQ0 Gm29455-201ENSMUST00000186504 2659 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cdkl1Q8CEQ0 Cox10-201ENSMUST00000049091 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cdkl1Q8CEQ0 Lrfn2-201ENSMUST00000046254 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cdkl1Q8CEQ0 Fgfr1-202ENSMUST00000117179 4046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cdkl1Q8CEQ0 Nphp4-202ENSMUST00000081393 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cdkl1Q8CEQ0 Diaph1-204ENSMUST00000115631 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cdkl1Q8CEQ0 Cacna2d1-205ENSMUST00000167946 7436 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Cdkl1Q8CEQ0 Ino80-201ENSMUST00000049920 6354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Cdkl1Q8CEQ0 Rbl2-208ENSMUST00000209518 4792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cdkl1Q8CEQ0 Nup98-206ENSMUST00000211235 3748 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Cdkl1Q8CEQ0 Slc45a1-201ENSMUST00000037827 3387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cdkl1Q8CEQ0 Eml3-201ENSMUST00000096241 3322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cdkl1Q8CEQ0 Ilvbl-208ENSMUST00000218875 3020 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cdkl1Q8CEQ0 Qsox1-202ENSMUST00000111764 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cdkl1Q8CEQ0 Il12rb1-205ENSMUST00000212657 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Cdkl1Q8CEQ0 Specc1-202ENSMUST00000092415 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Cdkl1Q8CEQ0 Galns-203ENSMUST00000212319 2111 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cdkl1Q8CEQ0 Iqcm-203ENSMUST00000212704 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cdkl1Q8CEQ0 Tex19.1-201ENSMUST00000039088 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cdkl1Q8CEQ0 Mief1-201ENSMUST00000023048 5081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cdkl1Q8CEQ0 Gm15816-201ENSMUST00000141930 1688 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cdkl1Q8CEQ0 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cdkl1Q8CEQ0 Gm14452-201ENSMUST00000118680 1632 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Cdkl1Q8CEQ0 Naaa-202ENSMUST00000159345 1629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cdkl1Q8CEQ0 Slc4a4-207ENSMUST00000148750 7931 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Cdkl1Q8CEQ0 Noxa1-202ENSMUST00000114373 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cdkl1Q8CEQ0 Pcna-201ENSMUST00000028817 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cdkl1Q8CEQ0 Gm16534-201ENSMUST00000149300 1492 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cdkl1Q8CEQ0 Celf5-201ENSMUST00000118763 4391 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cdkl1Q8CEQ0 Art3-205ENSMUST00000120193 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cdkl1Q8CEQ0 Pcgf5-211ENSMUST00000225920 6443 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Cdkl1Q8CEQ0 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cdkl1Q8CEQ0 Rdm1-201ENSMUST00000010506 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cdkl1Q8CEQ0 Rab15-204ENSMUST00000122419 856 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Cdkl1Q8CEQ0 Mettl26-204ENSMUST00000169085 324 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Cdkl1Q8CEQ0 Synj2bp-205ENSMUST00000169158 691 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cdkl1Q8CEQ0 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cdkl1Q8CEQ0 Cxcl17-202ENSMUST00000200880 760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cdkl1Q8CEQ0 AC153937.4-201ENSMUST00000218479 661 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
Cdkl1Q8CEQ0 AC238811.1-201ENSMUST00000225302 441 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Cdkl1Q8CEQ0 Cxcl17-201ENSMUST00000074040 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Cdkl1Q8CEQ0 Gm3695-201ENSMUST00000087222 1009 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Cdkl1Q8CEQ0 Olfr142-201ENSMUST00000099752 918 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
Cdkl1Q8CEQ0 Ptpn11-202ENSMUST00000100770 5599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cdkl1Q8CEQ0 Wdr36-202ENSMUST00000166214 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cdkl1Q8CEQ0 1700065D16Rik-205ENSMUST00000190890 2903 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Cdkl1Q8CEQ0 Ctbs-202ENSMUST00000061937 2892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cdkl1Q8CEQ0 Arhgap4-204ENSMUST00000114406 2749 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cdkl1Q8CEQ0 Lipe-202ENSMUST00000054301 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cdkl1Q8CEQ0 Scin-202ENSMUST00000078481 2654 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26 ms