Protein–RNA interactions for Protein: Q8C9E8

Calhm6, Calcium homeostasis modulator protein 6, mousemouse

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Length 313 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Calhm6Q8C9E8 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Calhm6Q8C9E8 Gm43738-201ENSMUST00000200659 2635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Calhm6Q8C9E8 Rbbp7-201ENSMUST00000033720 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Calhm6Q8C9E8 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Calhm6Q8C9E8 Syngr1-201ENSMUST00000009727 4180 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Calhm6Q8C9E8 Tmem164-202ENSMUST00000101198 4443 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Calhm6Q8C9E8 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Calhm6Q8C9E8 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Calhm6Q8C9E8 Cenpl-203ENSMUST00000111620 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Calhm6Q8C9E8 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Calhm6Q8C9E8 Isg20-202ENSMUST00000118867 697 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Calhm6Q8C9E8 Trav4d-2-201ENSMUST00000120914 335 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Calhm6Q8C9E8 Fuom-203ENSMUST00000121115 872 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Calhm6Q8C9E8 Ccdc24-209ENSMUST00000171052 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Calhm6Q8C9E8 Tmem52-204ENSMUST00000178188 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Calhm6Q8C9E8 Tmem52-205ENSMUST00000178238 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Calhm6Q8C9E8 Gm44397-201ENSMUST00000195950 113 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Calhm6Q8C9E8 Oit1-201ENSMUST00000022269 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Calhm6Q8C9E8 AC166997.1-201ENSMUST00000225122 572 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Calhm6Q8C9E8 Sit1-201ENSMUST00000030180 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Calhm6Q8C9E8 4921530L21Rik-201ENSMUST00000045892 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Calhm6Q8C9E8 Fam241b-202ENSMUST00000064050 1096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Calhm6Q8C9E8 B230118H07Rik-202ENSMUST00000099682 895 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Calhm6Q8C9E8 Pex2-202ENSMUST00000071280 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Calhm6Q8C9E8 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Calhm6Q8C9E8 Atp5f1-201ENSMUST00000118209 1604 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Calhm6Q8C9E8 Cep295nl-202ENSMUST00000168100 1602 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Calhm6Q8C9E8 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Calhm6Q8C9E8 Mmp14-206ENSMUST00000225641 3238 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Calhm6Q8C9E8 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Calhm6Q8C9E8 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Calhm6Q8C9E8 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Calhm6Q8C9E8 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Calhm6Q8C9E8 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Calhm6Q8C9E8 Pnkd-201ENSMUST00000027370 2937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Calhm6Q8C9E8 Tpm1-202ENSMUST00000034928 1824 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Calhm6Q8C9E8 Gm16685-201ENSMUST00000181286 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Calhm6Q8C9E8 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Calhm6Q8C9E8 Gm20465-201ENSMUST00000174768 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Calhm6Q8C9E8 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Calhm6Q8C9E8 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Calhm6Q8C9E8 Gm13859-201ENSMUST00000119936 1423 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Calhm6Q8C9E8 Gm26546-201ENSMUST00000181000 4276 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Calhm6Q8C9E8 Gm14455-201ENSMUST00000138288 2146 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Calhm6Q8C9E8 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Calhm6Q8C9E8 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Calhm6Q8C9E8 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Calhm6Q8C9E8 Epsti1-201ENSMUST00000022591 1870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Calhm6Q8C9E8 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Calhm6Q8C9E8 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Calhm6Q8C9E8 Stat3-201ENSMUST00000092671 2927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Calhm6Q8C9E8 Sh3glb1-201ENSMUST00000163279 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Calhm6Q8C9E8 Klhl21-201ENSMUST00000097773 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Calhm6Q8C9E8 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Calhm6Q8C9E8 Gm23931-201ENSMUST00000103842 109 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Calhm6Q8C9E8 4930412M03Rik-201ENSMUST00000130746 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Calhm6Q8C9E8 Tbx3os1-203ENSMUST00000140101 490 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Calhm6Q8C9E8 Ccdc70-201ENSMUST00000017193 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Calhm6Q8C9E8 Gm38223-201ENSMUST00000194484 695 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Calhm6Q8C9E8 Cd37-201ENSMUST00000033063 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Calhm6Q8C9E8 Mfrp-202ENSMUST00000161381 4254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Calhm6Q8C9E8 Vwa2-201ENSMUST00000026068 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Calhm6Q8C9E8 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Calhm6Q8C9E8 Mapt-201ENSMUST00000100347 1362 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Calhm6Q8C9E8 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Calhm6Q8C9E8 Haus8-202ENSMUST00000110071 1452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Calhm6Q8C9E8 Ankra2-208ENSMUST00000226100 1476 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Calhm6Q8C9E8 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Calhm6Q8C9E8 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Calhm6Q8C9E8 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Calhm6Q8C9E8 Phka2-202ENSMUST00000112376 2310 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Calhm6Q8C9E8 Sh2b3-202ENSMUST00000086310 4195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Calhm6Q8C9E8 Mrps9-201ENSMUST00000057208 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Calhm6Q8C9E8 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Calhm6Q8C9E8 Rab11fip2-201ENSMUST00000051996 4482 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Calhm6Q8C9E8 Hcrtr1-201ENSMUST00000030562 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Calhm6Q8C9E8 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Calhm6Q8C9E8 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Calhm6Q8C9E8 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Calhm6Q8C9E8 Gm16282-201ENSMUST00000162641 451 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Calhm6Q8C9E8 Tldc2-202ENSMUST00000166140 639 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Calhm6Q8C9E8 Gm26721-201ENSMUST00000181723 992 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Calhm6Q8C9E8 Gm29741-201ENSMUST00000192667 421 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Calhm6Q8C9E8 Chd3os-203ENSMUST00000218008 1026 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Calhm6Q8C9E8 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Calhm6Q8C9E8 Atp2b3-201ENSMUST00000033744 3894 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Calhm6Q8C9E8 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Calhm6Q8C9E8 Zfp853-201ENSMUST00000180336 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Calhm6Q8C9E8 AC168058.1-201ENSMUST00000219521 2282 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Calhm6Q8C9E8 Asb18-201ENSMUST00000086882 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Calhm6Q8C9E8 Adgrb2-206ENSMUST00000106018 4470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Calhm6Q8C9E8 Acy1-201ENSMUST00000024031 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Calhm6Q8C9E8 Gm12280-201ENSMUST00000155836 1624 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Calhm6Q8C9E8 Ppt2-209ENSMUST00000171121 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Calhm6Q8C9E8 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Calhm6Q8C9E8 Grid2ip-202ENSMUST00000110733 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Calhm6Q8C9E8 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Calhm6Q8C9E8 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Calhm6Q8C9E8 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Calhm6Q8C9E8 Fhad1-202ENSMUST00000105779 4263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.7 ms