Protein–RNA interactions for Protein: Q8C2S0

Usp44, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 44, mousemouse

Predictions only

Length 711 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp44Q8C2S0 Gpr4-201ENSMUST00000060225 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Usp44Q8C2S0 Src-202ENSMUST00000092576 3887 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Usp44Q8C2S0 Olfr683-202ENSMUST00000209879 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Usp44Q8C2S0 Kcnk13-204ENSMUST00000177549 3075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Usp44Q8C2S0 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Usp44Q8C2S0 Zfand4-202ENSMUST00000112900 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Usp44Q8C2S0 Lypd6-201ENSMUST00000053208 3620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Usp44Q8C2S0 Myl4-203ENSMUST00000106957 943 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Usp44Q8C2S0 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Usp44Q8C2S0 Platr12-202ENSMUST00000189722 549 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Usp44Q8C2S0 Med10-201ENSMUST00000022089 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Usp44Q8C2S0 4930470G03Rik-201ENSMUST00000122926 2447 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Usp44Q8C2S0 Krt35-201ENSMUST00000103127 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Usp44Q8C2S0 Slc38a7-204ENSMUST00000212270 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Usp44Q8C2S0 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Usp44Q8C2S0 Neil1-203ENSMUST00000190245 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Usp44Q8C2S0 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Usp44Q8C2S0 4632404H12Rik-201ENSMUST00000038450 2791 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Usp44Q8C2S0 Stxbp1-202ENSMUST00000077458 3616 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Usp44Q8C2S0 Desi1-206ENSMUST00000152227 2934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Usp44Q8C2S0 Enox1-201ENSMUST00000022589 3142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Usp44Q8C2S0 Tnk1-203ENSMUST00000108628 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Usp44Q8C2S0 Adamts3-204ENSMUST00000198151 1833 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Usp44Q8C2S0 Fam71f1-204ENSMUST00000166462 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Usp44Q8C2S0 Adm-201ENSMUST00000033054 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Usp44Q8C2S0 Tfe3-201ENSMUST00000077680 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Usp44Q8C2S0 Rnf10-203ENSMUST00000112097 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Usp44Q8C2S0 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Usp44Q8C2S0 Pla2g4c-204ENSMUST00000167232 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Usp44Q8C2S0 Sema3f-204ENSMUST00000192727 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Usp44Q8C2S0 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Usp44Q8C2S0 Eps8l1-214ENSMUST00000171445 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Usp44Q8C2S0 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Usp44Q8C2S0 Gm8775-201ENSMUST00000170943 1327 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Usp44Q8C2S0 Ccdc160-201ENSMUST00000101588 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Usp44Q8C2S0 Gif-201ENSMUST00000025585 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Usp44Q8C2S0 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Usp44Q8C2S0 1700065D16Rik-205ENSMUST00000190890 2903 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Usp44Q8C2S0 Dab1-203ENSMUST00000106830 5278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Usp44Q8C2S0 Cxcl16-201ENSMUST00000019064 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Usp44Q8C2S0 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Usp44Q8C2S0 Sgce-205ENSMUST00000115579 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Usp44Q8C2S0 Dnmt3l-208ENSMUST00000151242 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Usp44Q8C2S0 Tpd52-206ENSMUST00000121038 849 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Usp44Q8C2S0 Gm6460-202ENSMUST00000163787 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Usp44Q8C2S0 Dhrs2-202ENSMUST00000165432 849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Usp44Q8C2S0 Ift27-201ENSMUST00000016781 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Usp44Q8C2S0 Gm8879-201ENSMUST00000170260 1125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Usp44Q8C2S0 4933402N22Rik-202ENSMUST00000170301 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Usp44Q8C2S0 Mir7654-201ENSMUST00000185082 70 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Usp44Q8C2S0 1700030C10Rik-202ENSMUST00000186243 126 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Usp44Q8C2S0 Gm34866-201ENSMUST00000196146 515 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Usp44Q8C2S0 4930592C13Rik-201ENSMUST00000196791 661 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Usp44Q8C2S0 AC135669.1-201ENSMUST00000213585 412 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Usp44Q8C2S0 Gm18624-201ENSMUST00000220966 658 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Usp44Q8C2S0 Rhbdl2-201ENSMUST00000053202 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Usp44Q8C2S0 Zmat5-201ENSMUST00000009220 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Usp44Q8C2S0 Rcsd1-201ENSMUST00000040357 2622 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Usp44Q8C2S0 Atp13a2-201ENSMUST00000037055 3956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Usp44Q8C2S0 Rbm47-206ENSMUST00000200775 3180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Usp44Q8C2S0 Prdx2-203ENSMUST00000109734 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Usp44Q8C2S0 Ptpn6-201ENSMUST00000004377 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Usp44Q8C2S0 5730409E04Rik-201ENSMUST00000097886 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Usp44Q8C2S0 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Usp44Q8C2S0 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Usp44Q8C2S0 Ankrd6-204ENSMUST00000084750 4444 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Usp44Q8C2S0 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Usp44Q8C2S0 Nphs2-201ENSMUST00000027896 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Usp44Q8C2S0 Pisd-202ENSMUST00000071829 1986 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Usp44Q8C2S0 Gm13689-201ENSMUST00000119360 685 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Usp44Q8C2S0 Gm15821-201ENSMUST00000121995 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Usp44Q8C2S0 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Usp44Q8C2S0 Gm16000-201ENSMUST00000146657 447 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Usp44Q8C2S0 Gm37917-201ENSMUST00000194711 392 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Usp44Q8C2S0 Gm45668-201ENSMUST00000211271 493 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Usp44Q8C2S0 Tspan3-203ENSMUST00000215906 842 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Usp44Q8C2S0 Pomc-202ENSMUST00000218089 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Usp44Q8C2S0 Fthl17c-201ENSMUST00000075792 850 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Usp44Q8C2S0 Emd-203ENSMUST00000096424 896 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Usp44Q8C2S0 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Usp44Q8C2S0 Nek6-203ENSMUST00000112902 3147 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Usp44Q8C2S0 Yap1-202ENSMUST00000086580 4115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Usp44Q8C2S0 Mos-201ENSMUST00000105158 1449 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Usp44Q8C2S0 CT030684.3-201ENSMUST00000227308 2445 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Usp44Q8C2S0 Gm14963-201ENSMUST00000146751 2558 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Usp44Q8C2S0 Noxa1-202ENSMUST00000114373 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Usp44Q8C2S0 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Usp44Q8C2S0 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Usp44Q8C2S0 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Usp44Q8C2S0 Trim45-203ENSMUST00000106980 3337 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Usp44Q8C2S0 Rbbp8-201ENSMUST00000047322 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Usp44Q8C2S0 Gm14371-201ENSMUST00000138925 1518 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Usp44Q8C2S0 Tmem269-202ENSMUST00000212054 1504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Usp44Q8C2S0 Dclk2-206ENSMUST00000193632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Usp44Q8C2S0 Arhgef4-201ENSMUST00000047664 3287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Usp44Q8C2S0 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Usp44Q8C2S0 Cenpl-202ENSMUST00000111618 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Usp44Q8C2S0 Prkacb-202ENSMUST00000102515 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Usp44Q8C2S0 Hnrnpf-203ENSMUST00000167182 2271 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Usp44Q8C2S0 Cdk19-202ENSMUST00000095743 3973 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.3 ms