Protein–RNA interactions for Protein: Q8BYH8

Chd9, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 9, mousemouse

Predictions only

Length 2,885 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chd9Q8BYH8 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Chd9Q8BYH8 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Chd9Q8BYH8 Etfrf1-203ENSMUST00000111721 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Chd9Q8BYH8 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Chd9Q8BYH8 Car3-201ENSMUST00000029076 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Chd9Q8BYH8 Slc37a1-201ENSMUST00000165149 3354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Chd9Q8BYH8 Vav1-203ENSMUST00000112870 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Chd9Q8BYH8 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Chd9Q8BYH8 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Chd9Q8BYH8 Pex2-202ENSMUST00000071280 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Chd9Q8BYH8 4930465M20Rik-201ENSMUST00000130564 1446 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Chd9Q8BYH8 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Chd9Q8BYH8 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Chd9Q8BYH8 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Chd9Q8BYH8 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Chd9Q8BYH8 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Chd9Q8BYH8 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Chd9Q8BYH8 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Chd9Q8BYH8 Ifna15-201ENSMUST00000102809 573 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Chd9Q8BYH8 Ntm-202ENSMUST00000115236 1072 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Chd9Q8BYH8 Snrpa-206ENSMUST00000163311 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Chd9Q8BYH8 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Chd9Q8BYH8 Rps13-201ENSMUST00000170953 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Chd9Q8BYH8 Ube2a-202ENSMUST00000200835 911 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Chd9Q8BYH8 Ube2a-209ENSMUST00000202991 715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Chd9Q8BYH8 Gm45527-201ENSMUST00000211052 774 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Chd9Q8BYH8 Gm32141-201ENSMUST00000220189 488 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Chd9Q8BYH8 1700018B08Rik-201ENSMUST00000034265 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Chd9Q8BYH8 Lcn6-201ENSMUST00000059693 1254 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Chd9Q8BYH8 Chchd1-201ENSMUST00000071215 616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Chd9Q8BYH8 Saxo1-201ENSMUST00000030216 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Chd9Q8BYH8 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Chd9Q8BYH8 Clic6-201ENSMUST00000023670 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Chd9Q8BYH8 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Chd9Q8BYH8 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Chd9Q8BYH8 Yap1-202ENSMUST00000086580 4115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Chd9Q8BYH8 Ash2l-202ENSMUST00000110608 2134 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Chd9Q8BYH8 Gtf2ird1-208ENSMUST00000167084 3283 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Chd9Q8BYH8 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Chd9Q8BYH8 Prpf3-201ENSMUST00000015892 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Chd9Q8BYH8 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Chd9Q8BYH8 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Chd9Q8BYH8 Gm12969-201ENSMUST00000120199 1004 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Chd9Q8BYH8 Ndufa2-201ENSMUST00000014438 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Chd9Q8BYH8 Mt1-202ENSMUST00000211807 1085 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Chd9Q8BYH8 Olfr117-201ENSMUST00000073636 954 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Chd9Q8BYH8 Gm24447-201ENSMUST00000083977 338 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Chd9Q8BYH8 Mir483-201ENSMUST00000093631 73 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Chd9Q8BYH8 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Chd9Q8BYH8 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Chd9Q8BYH8 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Chd9Q8BYH8 Bnc2-215ENSMUST00000176691 3385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Chd9Q8BYH8 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Chd9Q8BYH8 Tmtc3-202ENSMUST00000099318 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Chd9Q8BYH8 Myef2-207ENSMUST00000147105 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Chd9Q8BYH8 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Chd9Q8BYH8 Tagap1-201ENSMUST00000063683 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Chd9Q8BYH8 Dgki-202ENSMUST00000090314 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Chd9Q8BYH8 Gm14460-201ENSMUST00000121511 639 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Chd9Q8BYH8 Rps2-ps4-201ENSMUST00000121977 633 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Chd9Q8BYH8 Gm27552-201ENSMUST00000183351 62 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Chd9Q8BYH8 Gm27844-201ENSMUST00000183613 62 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Chd9Q8BYH8 Hax1-206ENSMUST00000197786 857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Chd9Q8BYH8 Nat8f6-201ENSMUST00000087656 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Chd9Q8BYH8 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Chd9Q8BYH8 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Chd9Q8BYH8 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Chd9Q8BYH8 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Chd9Q8BYH8 Flt3-201ENSMUST00000049324 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
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Chd9Q8BYH8 Sox5os3-201ENSMUST00000139351 906 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
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Chd9Q8BYH8 Tmem176b-202ENSMUST00000164733 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Chd9Q8BYH8 Six3os1-211ENSMUST00000176958 2889 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
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Chd9Q8BYH8 Ighv1-51-201ENSMUST00000192903 354 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Chd9Q8BYH8 Gm45564-201ENSMUST00000210460 530 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Chd9Q8BYH8 Abhd6-203ENSMUST00000225234 1958 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Chd9Q8BYH8 4930579G24Rik-201ENSMUST00000029388 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Chd9Q8BYH8 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Chd9Q8BYH8 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Chd9Q8BYH8 Rpl34-202ENSMUST00000079085 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Chd9Q8BYH8 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Chd9Q8BYH8 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Chd9Q8BYH8 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Chd9Q8BYH8 Ap5z1-202ENSMUST00000196055 2965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Chd9Q8BYH8 Pnkd-201ENSMUST00000027370 2937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Chd9Q8BYH8 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Chd9Q8BYH8 Mfn2-202ENSMUST00000105714 2427 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Chd9Q8BYH8 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Chd9Q8BYH8 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Chd9Q8BYH8 P3h2-201ENSMUST00000039990 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Chd9Q8BYH8 Fam214b-202ENSMUST00000107956 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Chd9Q8BYH8 1500009C09Rik-201ENSMUST00000136948 1526 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Chd9Q8BYH8 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Chd9Q8BYH8 Ulk3-201ENSMUST00000053230 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Chd9Q8BYH8 Tmem19-203ENSMUST00000217884 2799 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Chd9Q8BYH8 Ssc4d-202ENSMUST00000111150 459 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Chd9Q8BYH8 Rpl28-ps1-201ENSMUST00000121497 414 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Chd9Q8BYH8 Gm10051-201ENSMUST00000145209 414 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.3 ms