Protein–RNA interactions for Protein: Q8BKS9

Pum3, Pumilio homolog 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 647 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pum3Q8BKS9 Gm13127-201ENSMUST00000118978 1389 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Pum3Q8BKS9 Tpr-201ENSMUST00000119161 7480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pum3Q8BKS9 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pum3Q8BKS9 Nrxn1-201ENSMUST00000054059 4697 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pum3Q8BKS9 Cpne6-202ENSMUST00000163767 2004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pum3Q8BKS9 1700001C02Rik-203ENSMUST00000127815 660 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pum3Q8BKS9 A530058N18Rik-202ENSMUST00000134129 411 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pum3Q8BKS9 1600025M17Rik-202ENSMUST00000151426 547 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pum3Q8BKS9 1700055C04Rik-201ENSMUST00000176450 355 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pum3Q8BKS9 Mpv17-209ENSMUST00000202241 903 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pum3Q8BKS9 Gm19078-201ENSMUST00000206311 727 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Pum3Q8BKS9 Tomm20l-201ENSMUST00000021482 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pum3Q8BKS9 Ube2i-201ENSMUST00000049911 1138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pum3Q8BKS9 Gm4559-201ENSMUST00000080669 600 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pum3Q8BKS9 Gm10188-201ENSMUST00000086544 720 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pum3Q8BKS9 Emd-203ENSMUST00000096424 896 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pum3Q8BKS9 Gm42872-201ENSMUST00000200026 1967 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Pum3Q8BKS9 Ska1-201ENSMUST00000040188 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pum3Q8BKS9 Togaram2-205ENSMUST00000153445 3302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pum3Q8BKS9 Gm37133-201ENSMUST00000192705 1922 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Pum3Q8BKS9 Gpr157-201ENSMUST00000094451 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pum3Q8BKS9 Arhgef25-202ENSMUST00000167353 2189 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pum3Q8BKS9 Dpysl5-203ENSMUST00000114729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pum3Q8BKS9 Plch2-208ENSMUST00000145662 1818 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pum3Q8BKS9 Pgr-201ENSMUST00000070463 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pum3Q8BKS9 Pgr-202ENSMUST00000098986 3068 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pum3Q8BKS9 Txn2-203ENSMUST00000109747 1778 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pum3Q8BKS9 Diaph2-207ENSMUST00000167619 8439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pum3Q8BKS9 Prrxl1-202ENSMUST00000186452 2371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pum3Q8BKS9 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Pum3Q8BKS9 AW209491-202ENSMUST00000178289 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pum3Q8BKS9 Dlgap3-201ENSMUST00000046659 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pum3Q8BKS9 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pum3Q8BKS9 Rnf152-201ENSMUST00000058688 8492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pum3Q8BKS9 Gins3-201ENSMUST00000034094 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pum3Q8BKS9 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pum3Q8BKS9 Grin3a-202ENSMUST00000093859 7491 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pum3Q8BKS9 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pum3Q8BKS9 Aurka-203ENSMUST00000109140 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pum3Q8BKS9 Atp13a2-203ENSMUST00000127833 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pum3Q8BKS9 Pltp-203ENSMUST00000109317 1575 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pum3Q8BKS9 Bola2-202ENSMUST00000106369 642 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pum3Q8BKS9 Gm15770-201ENSMUST00000117498 584 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Pum3Q8BKS9 Tmem128-202ENSMUST00000119047 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pum3Q8BKS9 Gm11524-201ENSMUST00000119349 807 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Pum3Q8BKS9 4930456L15Rik-201ENSMUST00000145577 1185 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pum3Q8BKS9 Gm15945-201ENSMUST00000146755 810 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
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Pum3Q8BKS9 Tspan3-203ENSMUST00000215906 842 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pum3Q8BKS9 Wdyhv1-206ENSMUST00000227142 786 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Pum3Q8BKS9 Taf11-201ENSMUST00000025057 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pum3Q8BKS9 Olfr222-201ENSMUST00000071943 1115 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pum3Q8BKS9 Med8-202ENSMUST00000073881 1052 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pum3Q8BKS9 Sipa1-202ENSMUST00000080824 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pum3Q8BKS9 Arhgef1-203ENSMUST00000117419 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pum3Q8BKS9 Gigyf2-201ENSMUST00000027475 5724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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Pum3Q8BKS9 Zbtb33-201ENSMUST00000049740 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pum3Q8BKS9 Slc12a8-202ENSMUST00000117134 2081 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pum3Q8BKS9 Cnbd2-202ENSMUST00000073942 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pum3Q8BKS9 Sntb2-203ENSMUST00000212524 9945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pum3Q8BKS9 Lpar2-202ENSMUST00000164890 5800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pum3Q8BKS9 Mpp4-210ENSMUST00000191200 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pum3Q8BKS9 Cybrd1-201ENSMUST00000028403 5339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pum3Q8BKS9 4930473A02Rik-202ENSMUST00000136793 1409 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pum3Q8BKS9 Hoxc10-201ENSMUST00000001699 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pum3Q8BKS9 Top1mt-201ENSMUST00000000958 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pum3Q8BKS9 Slc25a37-201ENSMUST00000037064 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pum3Q8BKS9 Map2k7-203ENSMUST00000110994 1600 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pum3Q8BKS9 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pum3Q8BKS9 Gm9742-201ENSMUST00000165220 1553 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pum3Q8BKS9 Rtraf-201ENSMUST00000022341 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pum3Q8BKS9 Hp-201ENSMUST00000074898 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pum3Q8BKS9 Cdk19-202ENSMUST00000095743 3973 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pum3Q8BKS9 Tnn-201ENSMUST00000039178 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pum3Q8BKS9 Slc4a1ap-213ENSMUST00000202950 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pum3Q8BKS9 Ap3d1-201ENSMUST00000020420 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pum3Q8BKS9 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pum3Q8BKS9 Serpinb2-201ENSMUST00000009356 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pum3Q8BKS9 Tmem176b-201ENSMUST00000101429 1238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pum3Q8BKS9 Gm12485-201ENSMUST00000119641 291 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Pum3Q8BKS9 Spcs2-ps-201ENSMUST00000122326 682 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Pum3Q8BKS9 Cox16-206ENSMUST00000168463 431 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pum3Q8BKS9 Pax5-213ENSMUST00000173821 996 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pum3Q8BKS9 Flg-208ENSMUST00000180308 1076 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pum3Q8BKS9 Gm26600-201ENSMUST00000181637 1256 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pum3Q8BKS9 Med10-201ENSMUST00000022089 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pum3Q8BKS9 Gm18624-201ENSMUST00000220966 658 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Pum3Q8BKS9 AC099934.3-201ENSMUST00000223192 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pum3Q8BKS9 Eapp-201ENSMUST00000067272 590 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pum3Q8BKS9 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pum3Q8BKS9 4632428C04Rik-201ENSMUST00000181485 2430 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pum3Q8BKS9 Gm16534-201ENSMUST00000149300 1492 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pum3Q8BKS9 AC154527.2-201ENSMUST00000225256 1466 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Pum3Q8BKS9 Trim80-201ENSMUST00000093914 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pum3Q8BKS9 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pum3Q8BKS9 Ccser2-202ENSMUST00000090024 7509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pum3Q8BKS9 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pum3Q8BKS9 Ccnc-203ENSMUST00000108240 1406 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pum3Q8BKS9 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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